data_8Y8F # _model_server_result.job_id 5WlYZN3HwQreBZGodL206w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 18:17:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8y8f # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":1309}' # _entry.id 8Y8F # _exptl.entry_id 8Y8F _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 32 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8Y8F _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8Y8F _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 I N N ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 Q N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1311 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1324 NAG 2 n E NAG 1 E 1 NAG A 1317 NAG 2 n E NAG 2 E 2 NAG A 1326 NAG 3 n F NAG 1 F 1 NAG A 1320 NAG 3 n F NAG 2 F 2 NAG A 1321 NAG 3 n F BMA 3 F 3 BMA A 1327 BMA 2 n G NAG 1 G 1 NAG C 1311 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG C 1320 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 7 A CYS 20 1_555 A SG CYS 143 A CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 138 A CYS 151 1_555 A SG CYS 170 A CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 150 A CYS 163 1_555 A SG CYS 229 A CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 269 A CYS 282 1_555 A SG CYS 279 A CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 314 A CYS 327 1_555 A SG CYS 339 A CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 357 A CYS 370 1_555 A SG CYS 410 A CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 369 A CYS 382 1_555 A SG CYS 590 A CYS 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 453 A CYS 466 1_555 A SG CYS 533 A CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 461 A CYS 474 1_555 A SG CYS 482 A CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 463 A CYS 476 1_555 A SG CYS 552 A CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 472 A CYS 485 1_555 A SG CYS 503 A CYS 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 491 A CYS 504 1_555 A SG CYS 505 A CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 507 A CYS 520 1_555 A SG CYS 520 A CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 543 A CYS 556 1_555 A SG CYS 554 A CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 567 A CYS 580 1_555 A SG CYS 573 A CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 606 A CYS 619 1_555 A SG CYS 659 A CYS 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 684 A CYS 697 1_555 A SG CYS 706 A CYS 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 A SG CYS 721 A CYS 734 1_555 A SG CYS 730 A CYS 743 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 A SG CYS 801 A CYS 814 1_555 A SG CYS 823 A CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 A SG CYS 806 A CYS 819 1_555 A SG CYS 812 A CYS 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 A SG CYS 877 A CYS 890 1_555 A SG CYS 882 A CYS 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 A SG CYS 912 A CYS 925 1_555 A SG CYS 923 A CYS 936 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 A SG CYS 1100 A CYS 1113 1_555 A SG CYS 1111 A CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 A SG CYS 1150 A CYS 1163 1_555 A SG CYS 1195 A CYS 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 7 B CYS 20 1_555 B SG CYS 143 B CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 138 B CYS 151 1_555 B SG CYS 170 B CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 150 B CYS 163 1_555 B SG CYS 229 B CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 269 B CYS 282 1_555 B SG CYS 279 B CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 314 B CYS 327 1_555 B SG CYS 339 B CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 357 B CYS 370 1_555 B SG CYS 410 B CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 369 B CYS 382 1_555 B SG CYS 590 B CYS 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 453 B CYS 466 1_555 B SG CYS 533 B CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 461 B CYS 474 1_555 B SG CYS 482 B CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 463 B CYS 476 1_555 B SG CYS 552 B CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 507 B CYS 520 1_555 B SG CYS 520 B CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 543 B CYS 556 1_555 B SG CYS 554 B CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf37 B SG CYS 567 B CYS 580 1_555 B SG CYS 573 B CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 B SG CYS 606 B CYS 619 1_555 B SG CYS 659 B CYS 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 B SG CYS 684 B CYS 697 1_555 B SG CYS 706 B CYS 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 B SG CYS 721 B CYS 734 1_555 B SG CYS 730 B CYS 743 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf41 B SG CYS 801 B CYS 814 1_555 B SG CYS 823 B CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf42 B SG CYS 806 B CYS 819 1_555 B SG CYS 812 B CYS 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf43 B SG CYS 877 B CYS 890 1_555 B SG CYS 882 B CYS 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf44 B SG CYS 912 B CYS 925 1_555 B SG CYS 923 B CYS 936 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf45 B SG CYS 1100 B CYS 1113 1_555 B SG CYS 1111 B CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf46 B SG CYS 1150 B CYS 1163 1_555 B SG CYS 1195 B CYS 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf47 C SG CYS 7 C CYS 20 1_555 C SG CYS 143 C CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf48 C SG CYS 138 C CYS 151 1_555 C SG CYS 170 C CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf49 C SG CYS 150 C CYS 163 1_555 C SG CYS 229 C CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf50 C SG CYS 269 C CYS 282 1_555 C SG CYS 279 C CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf51 C SG CYS 314 C CYS 327 1_555 C SG CYS 339 C CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf52 C SG CYS 357 C CYS 370 1_555 C SG CYS 410 C CYS 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf53 C SG CYS 369 C CYS 382 1_555 C SG CYS 590 C CYS 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf54 C SG CYS 453 C CYS 466 1_555 C SG CYS 533 C CYS 546 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf55 C SG CYS 461 C CYS 474 1_555 C SG CYS 482 C CYS 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf56 C SG CYS 463 C CYS 476 1_555 C SG CYS 552 C CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf57 C SG CYS 491 C CYS 504 1_555 C SG CYS 505 C CYS 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf58 C SG CYS 507 C CYS 520 1_555 C SG CYS 520 C CYS 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf59 C SG CYS 543 C CYS 556 1_555 C SG CYS 554 C CYS 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf60 C SG CYS 567 C CYS 580 1_555 C SG CYS 573 C CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf61 C SG CYS 606 C CYS 619 1_555 C SG CYS 659 C CYS 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf62 C SG CYS 684 C CYS 697 1_555 C SG CYS 706 C CYS 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf63 C SG CYS 721 C CYS 734 1_555 C SG CYS 730 C CYS 743 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf64 C SG CYS 801 C CYS 814 1_555 C SG CYS 823 C CYS 836 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf65 C SG CYS 806 C CYS 819 1_555 C SG CYS 812 C CYS 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf66 C SG CYS 877 C CYS 890 1_555 C SG CYS 882 C CYS 895 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf67 C SG CYS 912 C CYS 925 1_555 C SG CYS 923 C CYS 936 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf68 C SG CYS 1100 C CYS 1113 1_555 C SG CYS 1111 C CYS 1124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf69 C SG CYS 1150 C CYS 1163 1_555 C SG CYS 1195 C CYS 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 6 A ASN 19 1_555 R C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 45 A ASN 58 1_555 H C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 119 A ASN 132 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 175 A ASN 188 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 179 A ASN 192 1_555 K C1 NAG . A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 322 A ASN 335 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 342 A ASN 355 1_555 I C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 420 A ASN 433 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 651 A ASN 664 1_555 M C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 690 A ASN 703 1_555 J C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 712 A ASN 725 1_555 O C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 758 A ASN 771 1_555 L C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 780 A ASN 793 1_555 N C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 1198 A ASN 1211 1_555 P C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 45 B ASN 58 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 119 B ASN 132 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 179 B ASN 192 1_555 X C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 322 B ASN 335 1_555 W C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 342 B ASN 355 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 420 B ASN 433 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 441 B ASN 454 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 B ND2 ASN 651 B ASN 664 1_555 V C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 B ND2 ASN 690 B ASN 703 1_555 S C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 B ND2 ASN 712 B ASN 725 1_555 T C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 B ND2 ASN 780 B ASN 793 1_555 U C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 B ND2 ASN 1198 B ASN 1211 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 6 C ASN 19 1_555 KA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 45 C ASN 58 1_555 EA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 119 C ASN 132 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 158 C ASN 171 1_555 LA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 175 C ASN 188 1_555 HA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 179 C ASN 192 1_555 FA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 322 C ASN 335 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 342 C ASN 355 1_555 IA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale35 C ND2 ASN 712 C ASN 725 1_555 GA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale36 C ND2 ASN 1198 C ASN 1211 1_555 JA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale39 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale40 F O4 NAG . F NAG 2 1_555 F C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale41 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8Y8F _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code H 4 NAG A 1 1301 1312 NAG NAG . I 4 NAG A 1 1302 1313 NAG NAG . J 4 NAG A 1 1303 1314 NAG NAG . K 4 NAG A 1 1304 1315 NAG NAG . L 4 NAG A 1 1305 1316 NAG NAG . M 4 NAG A 1 1306 1318 NAG NAG . N 4 NAG A 1 1307 1319 NAG NAG . O 4 NAG A 1 1308 1322 NAG NAG . P 4 NAG A 1 1309 1323 NAG NAG . Q 4 NAG A 1 1310 1328 NAG NAG . R 4 NAG A 1 1311 1329 NAG NAG . S 4 NAG B 1 1301 1311 NAG NAG . T 4 NAG B 1 1302 1312 NAG NAG . U 4 NAG B 1 1303 1313 NAG NAG . V 4 NAG B 1 1304 1314 NAG NAG . W 4 NAG B 1 1305 1315 NAG NAG . X 4 NAG B 1 1306 1316 NAG NAG . Y 4 NAG B 1 1307 1317 NAG NAG . Z 4 NAG B 1 1308 1318 NAG NAG . AA 4 NAG B 1 1309 1319 NAG NAG . BA 4 NAG B 1 1310 1320 NAG NAG . CA 4 NAG B 1 1311 1321 NAG NAG . DA 4 NAG B 1 1312 1322 NAG NAG . EA 4 NAG C 1 1301 1310 NAG NAG . FA 4 NAG C 1 1302 1312 NAG NAG . GA 4 NAG C 1 1303 1313 NAG NAG . HA 4 NAG C 1 1304 1314 NAG NAG . IA 4 NAG C 1 1305 1315 NAG NAG . JA 4 NAG C 1 1306 1316 NAG NAG . KA 4 NAG C 1 1307 1317 NAG NAG . LA 4 NAG C 1 1308 1318 NAG NAG . MA 4 NAG C 1 1309 1319 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . P 4 135.518 175.894 227.12 1 86.98 ? C1 NAG 1309 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . P 4 135.527 175.742 225.597 1 86.98 ? C2 NAG 1309 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . P 4 134.475 176.651 224.963 1 86.98 ? C3 NAG 1309 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . P 4 133.112 176.411 225.597 1 86.98 ? C4 NAG 1309 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . P 4 133.204 176.541 227.115 1 86.98 ? C5 NAG 1309 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . P 4 131.91 176.202 227.817 1 86.98 ? C6 NAG 1309 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . P 4 137.495 177.171 225.137 1 86.98 ? C7 NAG 1309 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . P 4 138.845 177.224 224.488 1 86.98 ? C8 NAG 1309 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . P 4 136.846 176.002 225.038 1 86.98 ? N2 NAG 1309 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . P 4 134.413 176.4 223.564 1 86.98 ? O3 NAG 1309 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . P 4 132.171 177.357 225.102 1 86.98 ? O4 NAG 1309 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . P 4 134.199 175.64 227.622 1 86.98 ? O5 NAG 1309 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . P 4 131.914 174.865 228.298 1 86.98 ? O6 NAG 1309 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . P 4 137.018 178.141 225.722 1 86.98 ? O7 NAG 1309 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 53 _model_server_stats.query_time_ms 400 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 14 #