data_8Z3S
#
_model_server_result.job_id            8YcVyIVDBM7-yZvvD4CVVg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-21 23:40:16' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          8z3s 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":1205}' 
#
_entry.id    8Z3S 
#
_exptl.entry_id    8Z3S 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            8Z3S 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 8Z3S 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 O N N 
? 5 P N N 
? 5 U N N 
? 5 V N N 
? 5 AA N N 
? 5 BA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 367 A ASP 367 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 399 A GLU 399 1_555 H MG MG . A MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 399 A GLU 399 1_555 H MG MG . A MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? 
metalc ? metalc4 A O ARG 514 A ARG 514 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? 
metalc ? metalc5 A O SER 533 A SER 533 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc6 A OG SER 533 A SER 533 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc7 A OE2 GLU 535 A GLU 535 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc8 A O SER 600 A SER 600 1_555 I CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? 
metalc ? metalc9 A O GLN 947 A GLN 947 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc10 A O ASP 950 A ASP 950 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 953 A ASP 953 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc12 A OD2 ASP 953 A ASP 953 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? 
metalc ? metalc13 A OD1 ASP 955 A ASP 955 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc14 A OD2 ASP 955 A ASP 955 1_555 J CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc15 J CA CA . A CA 1206 1_555 D OD1 ASN 449 D ASN 449 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? 
metalc ? metalc16 B OD2 ASP 367 B ASP 367 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
metalc ? metalc17 B OE2 GLU 399 B GLU 399 1_555 N MG MG . B MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? 
metalc ? metalc18 B O ARG 514 B ARG 514 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.936 ? 
metalc ? metalc19 B O SER 533 B SER 533 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? 
metalc ? metalc20 B OE1 GLU 535 B GLU 535 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? 
metalc ? metalc21 B OE2 GLU 535 B GLU 535 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc22 B O SER 600 B SER 600 1_555 O CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
metalc ? metalc23 B O GLN 947 B GLN 947 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc24 B O ASP 950 B ASP 950 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc25 B OD1 ASP 953 B ASP 953 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc26 B OD2 ASP 953 B ASP 953 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc27 B OD1 ASP 955 B ASP 955 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc28 B OD2 ASP 955 B ASP 955 1_555 P CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc29 C OD2 ASP 367 C ASP 367 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc30 C OE1 GLU 399 C GLU 399 1_555 T MG MG . C MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? 
metalc ? metalc31 C OE2 GLU 399 C GLU 399 1_555 T MG MG . C MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc32 C OD1 ASN 449 C ASN 449 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc33 C O ARG 514 C ARG 514 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? 
metalc ? metalc34 C O SER 533 C SER 533 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc35 C OE1 GLU 535 C GLU 535 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc36 C OE2 GLU 535 C GLU 535 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc37 C O SER 600 C SER 600 1_555 U CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc38 C O GLN 947 C GLN 947 1_555 V CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc39 C O ASP 950 C ASP 950 1_555 V CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? 
metalc ? metalc40 C OD2 ASP 953 C ASP 953 1_555 V CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc41 D OD2 ASP 367 D ASP 367 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? 
metalc ? metalc42 D OE2 GLU 399 D GLU 399 1_555 Z MG MG . D MG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc43 D O ARG 514 D ARG 514 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? 
metalc ? metalc44 D O SER 533 D SER 533 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc45 D OE1 GLU 535 D GLU 535 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc46 D OE2 GLU 535 D GLU 535 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc47 D O SER 600 D SER 600 1_555 AA CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc48 D O GLN 947 D GLN 947 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? 
metalc ? metalc49 D O ASP 950 D ASP 950 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc50 D OD1 ASP 953 D ASP 953 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? 
metalc ? metalc51 D OD2 ASP 953 D ASP 953 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc52 D OD1 ASP 955 D ASP 955 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc53 D OD2 ASP 955 D ASP 955 1_555 BA CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     8Z3S 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 A1L04 A 1 1201 1 A1L04 CTI . 
F 2 A1L04 A 1 1202 5 A1L04 CTI . 
G 3 Y01 A 1 1203 4 Y01 Y01 . 
H 4 MG A 1 1204 1 MG MG . 
I 5 CA A 1 1205 1 CA CA . 
J 5 CA A 1 1206 2 CA CA . 
K 2 A1L04 B 1 1201 2 A1L04 CTI . 
L 2 A1L04 B 1 1202 6 A1L04 CTI . 
M 3 Y01 B 1 1203 1 Y01 Y01 . 
N 4 MG B 1 1204 2 MG MG . 
O 5 CA B 1 1205 3 CA CA . 
P 5 CA B 1 1206 4 CA CA . 
Q 2 A1L04 C 1 1201 3 A1L04 CTI . 
R 2 A1L04 C 1 1202 7 A1L04 CTI . 
S 3 Y01 C 1 1203 2 Y01 Y01 . 
T 4 MG C 1 1204 3 MG MG . 
U 5 CA C 1 1205 5 CA CA . 
V 5 CA C 1 1206 6 CA CA . 
W 2 A1L04 D 1 1201 4 A1L04 CTI . 
X 2 A1L04 D 1 1202 8 A1L04 CTI . 
Y 3 Y01 D 1 1203 3 Y01 Y01 . 
Z 4 MG D 1 1204 4 MG MG . 
AA 5 CA D 1 1205 7 CA CA . 
BA 5 CA D 1 1206 8 CA CA . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         I 
_atom_site.label_entity_id       5 
_atom_site.Cartn_x               149.98 
_atom_site.Cartn_y               191.818 
_atom_site.Cartn_z               156.523 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        135.67 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           1205 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              17 
_model_server_stats.parse_time_ms           17 
_model_server_stats.create_model_time_ms    56 
_model_server_stats.query_time_ms           589 
_model_server_stats.encode_time_ms          10 
_model_server_stats.element_count           1 
#