data_8ZY1 # _model_server_result.job_id wgB9N6J2DEgHDS9bn0LVDQ _model_server_result.datetime_utc '2025-09-13 07:43:24' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 8zy1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":1305}' # _entry.id 8ZY1 # _exptl.entry_id 8ZY1 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 39 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 8ZY1 _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 8ZY1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N ? 4 P N N ? 4 Q N N ? 4 R N N ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N ? 4 ZA N N ? 4 AB N N ? 4 BB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 3 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1301 NAG 2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1302 NAG 3 n E NAG 1 E 1 NAG A 1985 NAG 3 n E NAG 2 E 2 NAG A 1986 NAG 3 n E BMA 3 E 3 BMA A 1997 BMA 3 n E MAN 4 E 4 MAN A 1998 MAN 2 n F NAG 1 F 1 NAG A 1992 NAG 2 n F NAG 2 F 2 NAG A 1993 NAG 2 n G NAG 1 G 1 NAG B 1301 NAG 2 n G NAG 2 G 2 NAG B 1302 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG B 1985 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG B 1986 NAG 3 n H BMA 3 H 3 BMA B 1997 BMA 3 n H MAN 4 H 4 MAN B 1998 MAN 2 n I NAG 1 I 1 NAG B 1992 NAG 2 n I NAG 2 I 2 NAG B 1993 NAG 2 n J NAG 1 J 1 NAG C 1301 NAG 2 n J NAG 2 J 2 NAG C 1302 NAG 3 n K NAG 1 K 1 NAG C 1985 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG C 1986 NAG 3 n K BMA 3 K 3 BMA C 1997 BMA 3 n K MAN 4 K 4 MAN C 1998 MAN 2 n L NAG 1 L 1 NAG C 1992 NAG 2 n L NAG 2 L 2 NAG C 1993 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 20 A CYS 20 1_555 A SG CYS 140 A CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 135 A CYS 135 1_555 A SG CYS 164 A CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 282 A CYS 282 1_555 A SG CYS 292 A CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 327 A CYS 327 1_555 A SG CYS 352 A CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 371 A CYS 371 1_555 A SG CYS 424 A CYS 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 383 A CYS 383 1_555 A SG CYS 512 A CYS 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 468 A CYS 468 1_555 A SG CYS 475 A CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 525 A CYS 525 1_555 A SG CYS 577 A CYS 577 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 604 A CYS 604 1_555 A SG CYS 638 A CYS 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 651 A CYS 651 1_555 A SG CYS 660 A CYS 660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 724 A CYS 724 1_555 A SG CYS 746 A CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 729 A CYS 729 1_555 A SG CYS 735 A CYS 735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 826 A CYS 826 1_555 A SG CYS 837 A CYS 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 1018 A CYS 1018 1_555 A SG CYS 1029 A CYS 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 1068 A CYS 1068 1_555 A SG CYS 1112 A CYS 1112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 20 B CYS 20 1_555 B SG CYS 140 B CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 135 B CYS 135 1_555 B SG CYS 164 B CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 282 B CYS 282 1_555 B SG CYS 292 B CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 327 B CYS 327 1_555 B SG CYS 352 B CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 371 B CYS 371 1_555 B SG CYS 424 B CYS 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 383 B CYS 383 1_555 B SG CYS 512 B CYS 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 468 B CYS 468 1_555 B SG CYS 475 B CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 B SG CYS 577 B CYS 577 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 604 B CYS 604 1_555 B SG CYS 638 B CYS 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 651 B CYS 651 1_555 B SG CYS 660 B CYS 660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 724 B CYS 724 1_555 B SG CYS 746 B CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 729 B CYS 729 1_555 B SG CYS 735 B CYS 735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 826 B CYS 826 1_555 B SG CYS 837 B CYS 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 1018 B CYS 1018 1_555 B SG CYS 1029 B CYS 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 1068 B CYS 1068 1_555 B SG CYS 1112 B CYS 1112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf31 C SG CYS 20 C CYS 20 1_555 C SG CYS 140 C CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 C SG CYS 135 C CYS 135 1_555 C SG CYS 164 C CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf33 C SG CYS 282 C CYS 282 1_555 C SG CYS 292 C CYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 C SG CYS 327 C CYS 327 1_555 C SG CYS 352 C CYS 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 371 C CYS 371 1_555 C SG CYS 424 C CYS 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 383 C CYS 383 1_555 C SG CYS 512 C CYS 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 468 C CYS 468 1_555 C SG CYS 475 C CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 525 C CYS 525 1_555 C SG CYS 577 C CYS 577 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 604 C CYS 604 1_555 C SG CYS 638 C CYS 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 651 C CYS 651 1_555 C SG CYS 660 C CYS 660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 724 C CYS 724 1_555 C SG CYS 746 C CYS 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 729 C CYS 729 1_555 C SG CYS 735 C CYS 735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf43 C SG CYS 826 C CYS 826 1_555 C SG CYS 837 C CYS 837 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf44 C SG CYS 1018 C CYS 1018 1_555 C SG CYS 1029 C CYS 1029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf45 C SG CYS 1068 C CYS 1068 1_555 C SG CYS 1112 C CYS 1112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 116 A ASN 116 1_555 T C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 231 A ASN 231 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 273 A ASN 273 1_555 U C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 334 A ASN 334 1_555 V C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 361 A ASN 361 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 646 A ASN 646 1_555 O C1 NAG . A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 703 A ASN 703 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 787 A ASN 787 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 1084 A ASN 1084 1_555 W C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 1120 A ASN 1120 1_555 X C1 NAG . A NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 116 B ASN 116 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 163 B ASN 163 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 231 B ASN 231 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 273 B ASN 273 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 334 B ASN 334 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 361 B ASN 361 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 646 B ASN 646 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 703 B ASN 703 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 B ND2 ASN 787 B ASN 787 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale20 B ND2 ASN 1084 B ASN 1084 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale21 B ND2 ASN 1120 B ASN 1120 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 116 C ASN 116 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 163 C ASN 163 1_555 BB C1 NAG . C NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 231 C ASN 231 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 273 C ASN 273 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 334 C ASN 334 1_555 YA C1 NAG . C NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 361 C ASN 361 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 646 C ASN 646 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 703 C ASN 703 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 787 C ASN 787 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 1084 C ASN 1084 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 1313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 1120 C ASN 1120 1_555 AB C1 NAG . C NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale33 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale35 E O4 NAG . E NAG 2 1_555 E C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale36 E O3 BMA . E BMA 3 1_555 E C1 MAN . E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale37 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale39 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale40 H O4 NAG . H NAG 2 1_555 H C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale41 H O3 BMA . H BMA 3 1_555 H C1 MAN . H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale42 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale43 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale44 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale45 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale46 K O3 BMA . K BMA 3 1_555 K C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 334 n n C1 O1 NAG sing 335 n n C1 O5 NAG sing 336 n n C1 H1 NAG sing 337 n n C2 C3 NAG sing 338 n n C2 N2 NAG sing 339 n n C2 H2 NAG sing 340 n n C3 C4 NAG sing 341 n n C3 O3 NAG sing 342 n n C3 H3 NAG sing 343 n n C4 C5 NAG sing 344 n n C4 O4 NAG sing 345 n n C4 H4 NAG sing 346 n n C5 C6 NAG sing 347 n n C5 O5 NAG sing 348 n n C5 H5 NAG sing 349 n n C6 O6 NAG sing 350 n n C6 H61 NAG sing 351 n n C6 H62 NAG sing 352 n n C7 C8 NAG sing 353 n n C7 N2 NAG sing 354 n n C7 O7 NAG doub 355 n n C8 H81 NAG sing 356 n n C8 H82 NAG sing 357 n n C8 H83 NAG sing 358 n n N2 HN2 NAG sing 359 n n O1 HO1 NAG sing 360 n n O3 HO3 NAG sing 361 n n O4 HO4 NAG sing 362 n n O6 HO6 NAG sing 363 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 8ZY1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 4 NAG A 1 1301 1293 NAG NAG . N 4 NAG A 1 1302 1296 NAG NAG . O 4 NAG A 1 1303 1297 NAG NAG . P 4 NAG A 1 1304 1298 NAG NAG . Q 4 NAG A 1 1305 1299 NAG NAG . R 4 NAG A 1 1306 1303 NAG NAG . S 4 NAG A 1 1307 1984 NAG NAG . T 4 NAG A 1 1308 1989 NAG NAG . U 4 NAG A 1 1309 1990 NAG NAG . V 4 NAG A 1 1310 1991 NAG NAG . W 4 NAG A 1 1311 1994 NAG NAG . X 4 NAG A 1 1312 1995 NAG NAG . Y 4 NAG A 1 1313 1996 NAG NAG . Z 5 EIC B 1 1301 1201 EIC EIC . AA 4 NAG B 1 1302 1293 NAG NAG . BA 4 NAG B 1 1303 1296 NAG NAG . CA 4 NAG B 1 1304 1297 NAG NAG . DA 4 NAG B 1 1305 1298 NAG NAG . EA 4 NAG B 1 1306 1299 NAG NAG . FA 4 NAG B 1 1307 1303 NAG NAG . GA 4 NAG B 1 1308 1984 NAG NAG . HA 4 NAG B 1 1309 1989 NAG NAG . IA 4 NAG B 1 1310 1990 NAG NAG . JA 4 NAG B 1 1311 1991 NAG NAG . KA 4 NAG B 1 1312 1994 NAG NAG . LA 4 NAG B 1 1313 1995 NAG NAG . MA 4 NAG B 1 1314 1996 NAG NAG . NA 5 EIC C 1 1301 1201 EIC EIC . OA 5 EIC C 1 1302 1201 EIC EIC . PA 4 NAG C 1 1303 1293 NAG NAG . QA 4 NAG C 1 1304 1296 NAG NAG . RA 4 NAG C 1 1305 1297 NAG NAG . SA 4 NAG C 1 1306 1298 NAG NAG . TA 4 NAG C 1 1307 1299 NAG NAG . UA 4 NAG C 1 1308 1303 NAG NAG . VA 4 NAG C 1 1309 1984 NAG NAG . WA 4 NAG C 1 1310 1989 NAG NAG . XA 4 NAG C 1 1311 1990 NAG NAG . YA 4 NAG C 1 1312 1991 NAG NAG . ZA 4 NAG C 1 1313 1994 NAG NAG . AB 4 NAG C 1 1314 1995 NAG NAG . BB 4 NAG C 1 1315 1996 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . DA 4 193.794 239.074 146.014 1 92.24 ? C1 NAG 1305 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . DA 4 192.688 238.057 145.704 1 94.18 ? C2 NAG 1305 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . DA 4 191.468 238.787 145.145 1 100.22 ? C3 NAG 1305 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . DA 4 191.033 239.915 146.077 1 102.01 ? C4 NAG 1305 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . DA 4 192.23 240.832 146.363 1 102.04 ? C5 NAG 1305 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . DA 4 191.921 241.952 147.331 1 95.55 ? C6 NAG 1305 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . DA 4 193.203 235.737 145.068 1 91.59 ? C7 NAG 1305 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . DA 4 193.724 234.862 143.954 1 83.56 ? C8 NAG 1305 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . DA 4 193.151 237.052 144.785 1 89.18 ? N2 NAG 1305 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . DA 4 190.45 237.841 144.953 1 97.39 ? O3 NAG 1305 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . DA 4 189.985 240.608 145.439 1 96.93 ? O4 NAG 1305 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . DA 4 193.298 240.063 146.887 1 100.32 ? O5 NAG 1305 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . DA 4 191.399 241.413 148.523 1 92.28 ? O6 NAG 1305 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . DA 4 192.856 235.267 146.141 1 87.53 ? O7 NAG 1305 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 237 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #