data_9AXD # _model_server_result.job_id OidQEyJq3nVKMEQDachkbg _model_server_result.datetime_utc '2025-01-30 22:11:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9axd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"XA","auth_seq_id":702}' # _entry.id 9AXD # _exptl.entry_id 9AXD _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 40 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9AXD _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9AXD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N ? 8 QB N N ? 8 RB N N ? 8 SB N N ? 8 TB N N ? 8 UB N N ? 8 VB N N ? 8 WB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 6 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 6 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 7 3 2 NAG NAG C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG A 507 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG A 508 NAG 6 n J NAG 1 I 1 NAG A 513 NAG 6 n J NAG 2 I 2 NAG A 514 NAG 6 n J BMA 3 I 3 BMA A 515 BMA 6 n J MAN 4 I 4 MAN A 516 MAN 6 n J MAN 5 I 5 MAN A 517 MAN 5 n K NAG 1 J 1 NAG A 518 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG A 519 NAG 5 n L NAG 1 K 1 NAG A 521 NAG 5 n L NAG 2 K 2 NAG A 522 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG A 524 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG A 525 NAG 7 n N NAG 1 N 1 NAG A 528 NAG 7 n N NAG 2 N 2 NAG A 529 NAG 7 n N NAG 3 N 3 NAG A 531 NAG 5 n O NAG 1 O 1 NAG C 507 NAG 5 n O NAG 2 O 2 NAG C 508 NAG 5 n P NAG 1 P 1 NAG C 509 NAG 5 n P NAG 2 P 2 NAG C 510 NAG 5 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 511 NAG 5 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 512 NAG 5 n R NAG 1 R 1 NAG C 513 NAG 5 n R NAG 2 R 2 NAG C 514 NAG 5 n S NAG 1 S 1 NAG C 515 NAG 5 n S NAG 2 S 2 NAG C 516 NAG 6 n T NAG 1 T 1 NAG C 517 NAG 6 n T NAG 2 T 2 NAG C 518 NAG 6 n T BMA 3 T 3 BMA C 519 BMA 6 n T MAN 4 T 4 MAN C 520 MAN 6 n T MAN 5 T 5 MAN C 521 MAN 5 n U NAG 1 U 1 NAG C 523 NAG 5 n U NAG 2 U 2 NAG C 524 NAG 5 n V NAG 1 V 1 NAG C 525 NAG 5 n V NAG 2 V 2 NAG C 526 NAG 5 n W NAG 1 W 1 NAG C 528 NAG 5 n W NAG 2 W 2 NAG C 529 NAG 5 n X NAG 1 X 1 NAG C 532 NAG 5 n X NAG 2 X 2 NAG C 533 NAG 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG C 534 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG C 535 NAG 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 538 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 539 NAG 5 n AA NAG 1 a 1 NAG E 507 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG E 508 NAG 5 n BA NAG 1 b 1 NAG E 511 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG E 512 NAG 5 n CA NAG 1 c 1 NAG E 513 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG E 514 NAG 6 n DA NAG 1 d 1 NAG E 516 NAG 6 n DA NAG 2 d 2 NAG E 517 NAG 6 n DA BMA 3 d 3 BMA E 518 BMA 6 n DA MAN 4 d 4 MAN E 519 MAN 6 n DA MAN 5 d 5 MAN E 520 MAN 5 n EA NAG 1 e 1 NAG E 521 NAG 5 n EA NAG 2 e 2 NAG E 522 NAG 5 n FA NAG 1 f 1 NAG E 526 NAG 5 n FA NAG 2 f 2 NAG E 527 NAG 5 n GA NAG 1 g 1 NAG E 530 NAG 5 n GA NAG 2 g 2 NAG E 531 NAG 5 n HA NAG 1 h 1 NAG E 532 NAG 5 n HA NAG 2 h 2 NAG E 533 NAG 5 n IA NAG 1 i 1 NAG E 536 NAG 5 n IA NAG 2 i 2 NAG E 537 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 59 A CYS 54 1_555 C SG CYS 78 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 124 A CYS 119 1_555 C SG CYS 210 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 131 A CYS 126 1_555 C SG CYS 201 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 136 A CYS 131 1_555 C SG CYS 154 A CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 223 A CYS 218 1_555 C SG CYS 252 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 233 A CYS 228 1_555 C SG CYS 244 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 301 A CYS 296 1_555 C SG CYS 335 A CYS 330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 389 A CYS 384 1_555 C SG CYS 421 A CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 504 A CYS 500 1_555 D SG CYS 96 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? disulf ? disulf10 D SG CYS 89 B CYS 598 1_555 D SG CYS 95 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf11 E SG CYS 59 C CYS 54 1_555 E SG CYS 78 C CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 E SG CYS 124 C CYS 119 1_555 E SG CYS 210 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 131 C CYS 126 1_555 E SG CYS 201 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 136 C CYS 131 1_555 E SG CYS 154 C CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 223 C CYS 218 1_555 E SG CYS 252 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 233 C CYS 228 1_555 E SG CYS 244 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 301 C CYS 296 1_555 E SG CYS 335 C CYS 330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 382 C CYS 377 1_555 E SG CYS 448 C CYS 444 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 389 C CYS 384 1_555 E SG CYS 421 C CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 504 C CYS 500 1_555 F SG CYS 96 D CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 89 D CYS 598 1_555 F SG CYS 95 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 59 E CYS 54 1_555 G SG CYS 78 E CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 124 E CYS 119 1_555 G SG CYS 210 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 G SG CYS 131 E CYS 126 1_555 G SG CYS 201 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 136 E CYS 131 1_555 G SG CYS 154 E CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 223 E CYS 218 1_555 G SG CYS 252 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 233 E CYS 228 1_555 G SG CYS 244 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 301 E CYS 296 1_555 G SG CYS 335 E CYS 330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 382 E CYS 377 1_555 G SG CYS 448 E CYS 444 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 389 E CYS 384 1_555 G SG CYS 421 E CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf31 H SG CYS 89 F CYS 598 1_555 H SG CYS 95 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 93 A ASN 88 1_555 JA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 138 A ASN 133 1_555 KA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 153 A ASN 148 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 157 A ASN 152 1_555 LA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 202 A ASN 197 1_555 MA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 239 A ASN 234 1_555 NA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 246 A ASN 241 1_555 OA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 267 A ASN 262 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 281 A ASN 276 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 294 A ASN 289 1_555 PA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 300 A ASN 295 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 306 A ASN 301 1_555 QA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 336 A ASN 331 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 343 A ASN 338 1_555 RA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 359 A ASN 354 1_555 SA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale16 C ND2 ASN 367 A ASN 362 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale17 C ND2 ASN 390 A ASN 385 1_555 TA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale18 C ND2 ASN 396 A ASN 391 1_555 UA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 451 A ASN 447 1_555 VA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 102 B ASN 611 1_555 WA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 128 B ASN 637 1_555 XA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 93 C ASN 88 1_555 YA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 138 C ASN 133 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 142 C ASN 137 1_555 AB C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 153 C ASN 148 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 157 C ASN 152 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 202 C ASN 197 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 239 C ASN 234 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 246 C ASN 241 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 267 C ASN 262 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 281 C ASN 276 1_555 BB C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 294 C ASN 289 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 300 C ASN 295 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 306 C ASN 301 1_555 CB C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 336 C ASN 331 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 343 C ASN 338 1_555 DB C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 367 C ASN 362 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 390 C ASN 385 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale39 E ND2 ASN 396 C ASN 391 1_555 EB C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale40 E ND2 ASN 451 C ASN 447 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale41 F ND2 ASN 102 D ASN 611 1_555 GB C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale42 F ND2 ASN 109 D ASN 618 1_555 HB C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale43 F ND2 ASN 128 D ASN 637 1_555 IB C1 NAG . D NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 93 E ASN 88 1_555 IA C1 NAG . i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 138 E ASN 133 1_555 JB C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 153 E ASN 148 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 157 E ASN 152 1_555 LB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 202 E ASN 197 1_555 KB C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale49 G ND2 ASN 239 E ASN 234 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale50 G ND2 ASN 246 E ASN 241 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale51 G ND2 ASN 267 E ASN 262 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale52 G ND2 ASN 281 E ASN 276 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale53 G ND2 ASN 294 E ASN 289 1_555 MB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale54 G ND2 ASN 300 E ASN 295 1_555 NB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale55 G ND2 ASN 306 E ASN 301 1_555 OB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 G ND2 ASN 336 E ASN 331 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? covale ? covale57 G ND2 ASN 343 E ASN 338 1_555 PB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale58 G ND2 ASN 359 E ASN 354 1_555 QB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale59 G ND2 ASN 367 E ASN 362 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale60 G ND2 ASN 390 E ASN 385 1_555 HA C1 NAG . h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale61 G ND2 ASN 396 E ASN 391 1_555 RB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale62 G ND2 ASN 451 E ASN 447 1_555 SB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale63 H ND2 ASN 102 F ASN 611 1_555 TB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale64 H ND2 ASN 109 F ASN 618 1_555 UB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale65 H ND2 ASN 116 F ASN 625 1_555 VB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale66 H ND2 ASN 128 F ASN 637 1_555 WB C1 NAG . F NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale67 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale68 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale69 J O4 NAG . I NAG 2 1_555 J C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale70 J O3 BMA . I BMA 3 1_555 J C1 MAN . I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale71 J O6 BMA . I BMA 3 1_555 J C1 MAN . I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale73 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale74 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale75 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale76 N O6 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 NAG . N NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale77 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale78 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale79 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale80 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale81 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale82 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale83 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale84 T O3 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale85 T O6 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale86 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale87 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale88 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale89 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? covale ? covale90 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale91 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale92 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale93 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale94 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale95 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale96 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale97 DA O3 BMA . d BMA 3 1_555 DA C1 MAN . d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale98 DA O6 BMA . d BMA 3 1_555 DA C1 MAN . d MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale99 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale100 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale101 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale102 HA O4 NAG . h NAG 1 1_555 HA C1 NAG . h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale103 IA O4 NAG . i NAG 1 1_555 IA C1 NAG . i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9AXD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code JA 8 NAG A 1 601 505 NAG NAG . KA 8 NAG A 1 602 506 NAG NAG . LA 8 NAG A 1 603 509 NAG NAG . MA 8 NAG A 1 604 510 NAG NAG . NA 8 NAG A 1 605 511 NAG NAG . OA 8 NAG A 1 606 512 NAG NAG . PA 8 NAG A 1 607 520 NAG NAG . QA 8 NAG A 1 608 523 NAG NAG . RA 8 NAG A 1 609 526 NAG NAG . SA 8 NAG A 1 610 527 NAG NAG . TA 8 NAG A 1 611 530 NAG NAG . UA 8 NAG A 1 612 532 NAG NAG . VA 8 NAG A 1 613 533 NAG NAG . WA 8 NAG B 1 701 664 NAG NAG . XA 8 NAG B 1 702 665 NAG NAG . YA 8 NAG C 1 601 504 NAG NAG . ZA 8 NAG C 1 602 505 NAG NAG . AB 8 NAG C 1 603 506 NAG NAG . BB 8 NAG C 1 604 522 NAG NAG . CB 8 NAG C 1 605 527 NAG NAG . DB 8 NAG C 1 606 530 NAG NAG . EB 8 NAG C 1 607 536 NAG NAG . FB 8 NAG C 1 608 540 NAG NAG . GB 8 NAG D 1 701 664 NAG NAG . HB 8 NAG D 1 702 665 NAG NAG . IB 8 NAG D 1 703 666 NAG NAG . JB 8 NAG E 1 601 506 NAG NAG . KB 8 NAG E 1 602 510 NAG NAG . LB 8 NAG E 1 603 515 NAG NAG . MB 8 NAG E 1 604 523 NAG NAG . NB 8 NAG E 1 605 524 NAG NAG . OB 8 NAG E 1 606 525 NAG NAG . PB 8 NAG E 1 607 528 NAG NAG . QB 8 NAG E 1 608 529 NAG NAG . RB 8 NAG E 1 609 534 NAG NAG . SB 8 NAG E 1 610 535 NAG NAG . TB 8 NAG F 1 701 662 NAG NAG . UB 8 NAG F 1 702 663 NAG NAG . VB 8 NAG F 1 703 664 NAG NAG . WB 8 NAG F 1 704 665 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . XA 8 184.61 220.122 175.675 1 68.03 ? C1 NAG 702 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . XA 8 184.455 221.534 175.109 1 68.03 ? C2 NAG 702 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . XA 8 185.089 222.552 176.05 1 68.03 ? C3 NAG 702 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . XA 8 184.52 222.401 177.454 1 68.03 ? C4 NAG 702 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . XA 8 184.675 220.961 177.93 1 68.03 ? C5 NAG 702 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . XA 8 184.021 220.709 179.269 1 68.03 ? C6 NAG 702 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . XA 8 184.336 221.51 172.652 1 68.03 ? C7 NAG 702 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . XA 8 185.111 221.647 171.376 1 68.03 ? C8 NAG 702 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . XA 8 185.042 221.634 173.782 1 68.03 ? N2 NAG 702 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . XA 8 184.837 223.865 175.563 1 68.03 ? O3 NAG 702 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . XA 8 185.203 223.269 178.351 1 68.03 ? O4 NAG 702 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . XA 8 184.053 220.068 176.994 1 68.03 ? O5 NAG 702 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . XA 8 182.612 220.581 179.142 1 68.03 ? O6 NAG 702 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . XA 8 183.129 221.292 172.658 1 68.03 ? O7 NAG 702 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 14 #