data_9B1D # _model_server_result.job_id ZY-oLPyLlFt9SZ9mZXVRZQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-11 03:13:28' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9b1d # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"X","auth_seq_id":902}' # _entry.id 9B1D # _exptl.entry_id 9B1D _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 523.247 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9B1D _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9B1D _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 12-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 M N N ? 9 O N N ? 9 S N N ? 9 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 825 A GLU 825 1_555 N MG MG . A MG 1602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc2 M O2G AGS . A AGS 1601 1_555 N MG MG . A MG 1602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc3 O O3G AGS . C AGS 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc4 O O2B AGS . C AGS 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.861 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 244 D CYS 244 1_555 Q ZN ZN . D ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc6 D SG CYS 247 D CYS 247 1_555 Q ZN ZN . D ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc7 D SG CYS 256 D CYS 256 1_555 R ZN ZN . D ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc8 D OD1 ASN 258 D ASN 258 1_555 R ZN ZN . D ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.861 ? metalc ? metalc9 D SG CYS 259 D CYS 259 1_555 R ZN ZN . D ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc10 D SG CYS 264 D CYS 264 1_555 Q ZN ZN . D ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 268 D CYS 268 1_555 Q ZN ZN . D ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc12 D NE2 HIS 272 D HIS 272 1_555 R ZN ZN . D ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc13 E OG1 THR 86 E THR 86 1_555 T MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc14 E OD1 ASP 311 E ASP 311 1_555 T MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc ? metalc15 E OD2 ASP 311 E ASP 311 1_555 T MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.991 ? metalc ? metalc16 S O3G AGS . E AGS 901 1_555 T MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? metalc ? metalc17 S O2B AGS . E AGS 901 1_555 T MG MG . E MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.885 ? metalc ? metalc18 F OG1 THR 82 F THR 82 1_555 U MG MG . F MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? metalc ? metalc19 U MG MG . F MG 501 1_555 V O1A ADP . F ADP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.987 ? metalc ? metalc20 U MG MG . F MG 501 1_555 V O1B ADP . F ADP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? metalc ? metalc21 G OG1 THR 86 G THR 86 1_555 W MG MG . G MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc22 W MG MG . G MG 901 1_555 X O2G AGS . G AGS 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc23 H OG1 THR 82 H THR 82 1_555 Y MG MG . H MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? metalc ? metalc24 Y MG MG . H MG 501 1_555 Z O2B ADP . H ADP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? metalc ? metalc25 I OG1 THR 86 I THR 86 1_555 BA MG MG . I MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc26 AA O2B ADP . I ADP 901 1_555 BA MG MG . I MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc27 J OG1 THR 82 J THR 82 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc28 CA O1B ADP . J ADP 501 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 K N3 DC 81 Y DC 81 1_555 L N1 DG 67 Z DG 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 K N4 DC 81 Y DC 81 1_555 L O6 DG 67 Z DG 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 K O2 DC 81 Y DC 81 1_555 L N2 DG 67 Z DG 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 K N3 DC 82 Y DC 82 1_555 L N1 DG 66 Z DG 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 K N4 DC 82 Y DC 82 1_555 L O6 DG 66 Z DG 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 K O2 DC 82 Y DC 82 1_555 L N2 DG 66 Z DG 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 K N1 DG 83 Y DG 83 1_555 L N3 DC 65 Z DC 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 K N2 DG 83 Y DG 83 1_555 L O2 DC 65 Z DC 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 K O6 DG 83 Y DG 83 1_555 L N4 DC 65 Z DC 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 K N3 DC 84 Y DC 84 1_555 L N1 DG 64 Z DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 K N4 DC 84 Y DC 84 1_555 L O6 DG 64 Z DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 K O2 DC 84 Y DC 84 1_555 L N2 DG 64 Z DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 K N1 DG 85 Y DG 85 1_555 L N3 DC 63 Z DC 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 K N2 DG 85 Y DG 85 1_555 L O2 DC 63 Z DC 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 K O6 DG 85 Y DG 85 1_555 L N4 DC 63 Z DC 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 K N3 DT 86 Y DT 86 1_555 L N1 DA 62 Z DA 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 K O4 DT 86 Y DT 86 1_555 L N6 DA 62 Z DA 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_18_PAIR hydrog18 K N3 DT 86 Y DT 86 1_555 L N3 DC 63 Z DC 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_18_PAIR hydrog19 K O4 DT 86 Y DT 86 1_555 L N4 DC 63 Z DC 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 K N3 DT 87 Y DT 87 1_555 L N1 DA 61 Z DA 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 K O4 DT 87 Y DT 87 1_555 L N6 DA 61 Z DA 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 K N3 DT 88 Y DT 88 1_555 L N1 DA 60 Z DA 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 K O4 DT 88 Y DT 88 1_555 L N6 DA 60 Z DA 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 K N3 DT 89 Y DT 89 1_555 L N1 DA 59 Z DA 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 K O4 DT 89 Y DT 89 1_555 L N6 DA 59 Z DA 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 K N1 DA 90 Y DA 90 1_555 L N3 DT 58 Z DT 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 K N6 DA 90 Y DA 90 1_555 L O4 DT 58 Z DT 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 K N1 DA 91 Y DA 91 1_555 L N3 DT 57 Z DT 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 K N6 DA 91 Y DA 91 1_555 L O4 DT 57 Z DT 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 K N3 DC 92 Y DC 92 1_555 L N1 DG 56 Z DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 K N4 DC 92 Y DC 92 1_555 L O6 DG 56 Z DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 K O2 DC 92 Y DC 92 1_555 L N2 DG 56 Z DG 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 K N3 DC 93 Y DC 93 1_555 L N1 DG 55 Z DG 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 K N4 DC 93 Y DC 93 1_555 L O6 DG 55 Z DG 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 K O2 DC 93 Y DC 93 1_555 L N2 DG 55 Z DG 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 K N1 DG 94 Y DG 94 1_555 L N3 DC 54 Z DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 K N2 DG 94 Y DG 94 1_555 L O2 DC 54 Z DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 K O6 DG 94 Y DG 94 1_555 L N4 DC 54 Z DC 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 K N3 DC 95 Y DC 95 1_555 L N1 DG 53 Z DG 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 K N4 DC 95 Y DC 95 1_555 L O6 DG 53 Z DG 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 K O2 DC 95 Y DC 95 1_555 L N2 DG 53 Z DG 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 K N3 DC 96 Y DC 96 1_555 L N1 DG 52 Z DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 K N4 DC 96 Y DC 96 1_555 L O6 DG 52 Z DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 K O2 DC 96 Y DC 96 1_555 L N2 DG 52 Z DG 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 K N1 DA 97 Y DA 97 1_555 L N3 DT 51 Z DT 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 K N6 DA 97 Y DA 97 1_555 L O4 DT 51 Z DT 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 K N1 DA 98 Y DA 98 1_555 L N3 DT 50 Z DT 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 K N6 DA 98 Y DA 98 1_555 L O4 DT 50 Z DT 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 K N1 DG 99 Y DG 99 1_555 L N3 DC 49 Z DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 K N2 DG 99 Y DG 99 1_555 L O2 DC 49 Z DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 K O6 DG 99 Y DG 99 1_555 L N4 DC 49 Z DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 K N1 DG 100 Y DG 100 1_555 L N3 DC 48 Z DC 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 K N2 DG 100 Y DG 100 1_555 L O2 DC 48 Z DC 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 K O6 DG 100 Y DG 100 1_555 L N4 DC 48 Z DC 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 K N1 DG 101 Y DG 101 1_555 L N3 DC 47 Z DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 K N2 DG 101 Y DG 101 1_555 L O2 DC 47 Z DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 K O6 DG 101 Y DG 101 1_555 L N4 DC 47 Z DC 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 K N1 DG 102 Y DG 102 1_555 L N3 DC 46 Z DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 K N2 DG 102 Y DG 102 1_555 L O2 DC 46 Z DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 K O6 DG 102 Y DG 102 1_555 L N4 DC 46 Z DC 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 K N1 DA 103 Y DA 103 1_555 L N3 DT 45 Z DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 K N6 DA 103 Y DA 103 1_555 L O4 DT 45 Z DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 K N3 DT 104 Y DT 104 1_555 L N1 DA 44 Z DA 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 K O4 DT 104 Y DT 104 1_555 L N6 DA 44 Z DA 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 K N3 DT 105 Y DT 105 1_555 L N1 DA 43 Z DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 K O4 DT 105 Y DT 105 1_555 L N6 DA 43 Z DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H16 N5 O12 P3 S' _chem_comp.formula_weight 523.247 _chem_comp.id AGS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms "ATP-GAMMA-S;ADENOSINE 5'-(3-THIOTRIPHOSPHATE);ADENOSINE 5'-(GAMMA-THIOTRIPHOSPHATE);ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE MONOTHIOPHOSPHATE" # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PG S1G AGS doub 45 n n PG O2G AGS sing 46 n n PG O3G AGS sing 47 n n PG O3B AGS sing 48 n n PB O1B AGS doub 49 n n PB O2B AGS sing 50 n n PB O3B AGS sing 51 n n PB O3A AGS sing 52 n n PA O1A AGS doub 53 n n PA O2A AGS sing 54 n n PA O3A AGS sing 55 n n PA O5' AGS sing 56 n n O5' C5' AGS sing 57 n n C5' C4' AGS sing 58 n n C4' O4' AGS sing 59 n n C4' C3' AGS sing 60 n n O4' C1' AGS sing 61 n n C3' O3' AGS sing 62 n n C3' C2' AGS sing 63 n n C2' O2' AGS sing 64 n n C2' C1' AGS sing 65 n n C1' N9 AGS sing 66 n n N9 C8 AGS sing 67 n y N9 C4 AGS sing 68 n y C8 N7 AGS doub 69 n y N7 C5 AGS sing 70 n y C5 C6 AGS sing 71 n y C5 C4 AGS doub 72 n y C6 N6 AGS sing 73 n n C6 N1 AGS doub 74 n y N1 C2 AGS sing 75 n y C2 N3 AGS doub 76 n y N3 C4 AGS sing 77 n y O2G HOG2 AGS sing 78 n n O3G H21 AGS sing 79 n n O2B HOB2 AGS sing 80 n n O2A HOA2 AGS sing 81 n n C5' "H5'1" AGS sing 82 n n C5' "H5'2" AGS sing 83 n n C4' H4' AGS sing 84 n n C3' H3' AGS sing 85 n n O3' HO3' AGS sing 86 n n C2' H2' AGS sing 87 n n O2' HO2' AGS sing 88 n n C1' H1' AGS sing 89 n n C8 H8 AGS sing 90 n n N6 HN61 AGS sing 91 n n N6 HN62 AGS sing 92 n n C2 H2 AGS sing 93 n n # _atom_sites.entry_id 9B1D _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 9 AGS A 1 1601 1501 AGS AGS . N 10 MG A 1 1602 1502 MG MG . O 9 AGS C 1 501 501 AGS AGS . P 10 MG C 1 502 502 MG MG . Q 11 ZN D 1 301 301 ZN ZN . R 11 ZN D 1 302 302 ZN ZN . S 9 AGS E 1 901 501 AGS AGS . T 10 MG E 1 902 502 MG MG . U 10 MG F 1 501 502 MG MG . V 12 ADP F 1 502 503 ADP ADP . W 10 MG G 1 901 502 MG MG . X 9 AGS G 1 902 503 AGS AGS . Y 10 MG H 1 501 502 MG MG . Z 12 ADP H 1 502 503 ADP ADP . AA 12 ADP I 1 901 501 ADP ADP . BA 10 MG I 1 902 503 MG MG . CA 12 ADP J 1 501 501 ADP ADP . DA 10 MG J 1 502 502 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PG AGS . . . X 9 191.556 256.47 175.683 1 109.72 ? PG AGS 902 G 1 HETATM 2 S S1G AGS . . . X 9 190.491 257.088 177.194 1 105.28 ? S1G AGS 902 G 1 HETATM 3 O O2G AGS . . . X 9 191.016 255.098 175.186 1 94.46 ? O2G AGS 902 G 1 HETATM 4 O O3G AGS . . . X 9 193.038 256.304 176.13 1 92.41 ? O3G AGS 902 G 1 HETATM 5 P PB AGS . . . X 9 191.62 256.999 173.035 1 67.96 ? PB AGS 902 G 1 HETATM 6 O O1B AGS . . . X 9 192.665 255.959 172.952 1 70.12 ? O1B AGS 902 G 1 HETATM 7 O O2B AGS . . . X 9 191.932 258.23 172.184 1 70.22 ? O2B AGS 902 G 1 HETATM 8 O O3B AGS . . . X 9 191.48 257.505 174.521 1 81.8 ? O3B AGS 902 G 1 HETATM 9 P PA AGS . . . X 9 190.009 256.195 170.979 1 72.56 ? PA AGS 902 G 1 HETATM 10 O O1A AGS . . . X 9 191.297 256.201 170.275 1 69.97 ? O1A AGS 902 G 1 HETATM 11 O O2A AGS . . . X 9 189.26 254.863 170.876 1 76.7 ? O2A AGS 902 G 1 HETATM 12 O O3A AGS . . . X 9 190.23 256.456 172.52 1 70.48 ? O3A AGS 902 G 1 HETATM 13 O O5' AGS . . . X 9 189.127 257.391 170.439 1 71.46 ? O5' AGS 902 G 1 HETATM 14 C C5' AGS . . . X 9 187.72 257.477 170.734 1 73.39 ? C5' AGS 902 G 1 HETATM 15 C C4' AGS . . . X 9 186.929 257.367 169.452 1 69.26 ? C4' AGS 902 G 1 HETATM 16 O O4' AGS . . . X 9 187.424 258.325 168.494 1 66.13 ? O4' AGS 902 G 1 HETATM 17 C C3' AGS . . . X 9 186.967 256.005 168.761 1 66.75 ? C3' AGS 902 G 1 HETATM 18 O O3' AGS . . . X 9 185.688 255.67 168.235 1 68.5 ? O3' AGS 902 G 1 HETATM 19 C C2' AGS . . . X 9 187.995 256.207 167.648 1 64.01 ? C2' AGS 902 G 1 HETATM 20 O O2' AGS . . . X 9 187.72 255.38 166.524 1 70.48 ? O2' AGS 902 G 1 HETATM 21 C C1' AGS . . . X 9 187.781 257.675 167.293 1 63.21 ? C1' AGS 902 G 1 HETATM 22 N N9 AGS . . . X 9 188.968 258.335 166.767 1 64.64 ? N9 AGS 902 G 1 HETATM 23 C C8 AGS . . . X 9 190.067 258.731 167.481 1 68.88 ? C8 AGS 902 G 1 HETATM 24 N N7 AGS . . . X 9 190.993 259.31 166.757 1 67.75 ? N7 AGS 902 G 1 HETATM 25 C C5 AGS . . . X 9 190.465 259.297 165.476 1 59.97 ? C5 AGS 902 G 1 HETATM 26 C C6 AGS . . . X 9 190.957 259.763 164.244 1 62.53 ? C6 AGS 902 G 1 HETATM 27 N N6 AGS . . . X 9 192.143 260.359 164.096 1 68.2 ? N6 AGS 902 G 1 HETATM 28 N N1 AGS . . . X 9 190.179 259.592 163.153 1 62.35 ? N1 AGS 902 G 1 HETATM 29 C C2 AGS . . . X 9 188.992 258.998 163.297 1 62.39 ? C2 AGS 902 G 1 HETATM 30 N N3 AGS . . . X 9 188.424 258.519 164.405 1 59.99 ? N3 AGS 902 G 1 HETATM 31 C C4 AGS . . . X 9 189.219 258.696 165.467 1 59.33 ? C4 AGS 902 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 43 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 56 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 31 #