data_9B8B # _model_server_result.job_id qXTcXPcczo4Q2bk-nqyS2Q _model_server_result.datetime_utc '2025-09-13 13:51:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9b8b # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"VB","auth_seq_id":704}' # _entry.id 9B8B # _exptl.entry_id 9B8B _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 9 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 49 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9B8B _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9B8B _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 9 Z N N ? 9 AA N N ? 9 BA N N ? 9 CA N N ? 9 DA N N ? 9 EA N N ? 9 FA N N ? 9 GA N N ? 9 HA N N ? 9 IA N N ? 9 JA N N ? 9 KA N N ? 9 LA N N ? 9 MA N N ? 9 NA N N ? 9 OA N N ? 9 PA N N ? 9 QA N N ? 9 RA N N ? 9 SA N N ? 9 TA N N ? 9 UA N N ? 9 VA N N ? 9 WA N N ? 9 XA N N ? 9 YA N N ? 9 ZA N N ? 9 AB N N ? 9 BB N N ? 9 CB N N ? 9 DB N N ? 9 EB N N ? 9 FB N N ? 9 GB N N ? 9 HB N N ? 9 IB N N ? 9 JB N N ? 9 KB N N ? 9 LB N N ? 9 MB N N ? 9 NB N N ? 9 OB N N ? 9 PB N N ? 9 QB N N ? 9 RB N N ? 9 SB N N ? 9 TB N N ? 9 UB N N ? 9 VB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n O NAG 1 O 1 NAG A 517 NAG 7 n O NAG 2 O 2 NAG A 525 NAG 8 n P NAG 1 P 1 NAG A 519 NAG 8 n P NAG 2 P 2 NAG A 520 NAG 8 n P BMA 3 P 3 BMA A 521 BMA 7 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 527 NAG 7 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 528 NAG 7 n R NAG 1 R 1 NAG C 512 NAG 7 n R NAG 2 R 2 NAG C 513 NAG 8 n S NAG 1 S 1 NAG C 517 NAG 8 n S NAG 2 S 2 NAG C 518 NAG 8 n S BMA 3 S 3 BMA C 519 BMA 7 n T NAG 1 T 1 NAG C 520 NAG 7 n T NAG 2 T 2 NAG C 521 NAG 7 n U NAG 1 U 1 NAG C 528 NAG 7 n U NAG 2 U 2 NAG C 530 NAG 7 n V NAG 1 V 1 NAG D 510 NAG 7 n V NAG 2 V 2 NAG D 511 NAG 7 n W NAG 1 W 1 NAG D 512 NAG 7 n W NAG 2 W 2 NAG D 513 NAG 8 n X NAG 1 X 1 NAG D 517 NAG 8 n X NAG 2 X 2 NAG D 518 NAG 8 n X BMA 3 X 3 BMA D 519 BMA 7 n Y NAG 1 Y 1 NAG D 527 NAG 7 n Y NAG 2 Y 2 NAG D 530 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 24 H CYS 22 1_555 A SG CYS 97 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 23 L CYS 23 1_555 B SG CYS 94 L CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 20 G CYS 23 1_555 C SG CYS 88 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 22 I CYS 22 1_555 D SG CYS 96 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf5 E SG CYS 20 J CYS 23 1_555 E SG CYS 88 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf6 F SG CYS 22 K CYS 22 1_555 F SG CYS 96 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf7 G SG CYS 22 M CYS 22 1_555 G SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 H SG CYS 20 N CYS 23 1_555 H SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf9 I SG CYS 120 A CYS 119 1_555 I SG CYS 198 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 I SG CYS 127 A CYS 126 1_555 I SG CYS 189 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 I SG CYS 132 A CYS 131 1_555 I SG CYS 150 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 I SG CYS 211 A CYS 218 1_555 I SG CYS 240 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf13 I SG CYS 221 A CYS 228 1_555 I SG CYS 232 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf14 I SG CYS 370 A CYS 378 1_555 I SG CYS 436 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf15 I SG CYS 377 A CYS 385 1_555 I SG CYS 409 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 I SG CYS 492 A CYS 501 1_555 J SG CYS 94 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf17 J SG CYS 87 B CYS 598 1_555 J SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf18 K SG CYS 55 C CYS 54 1_555 K SG CYS 75 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf19 K SG CYS 120 C CYS 119 1_555 K SG CYS 198 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf20 K SG CYS 127 C CYS 126 1_555 K SG CYS 189 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf21 K SG CYS 132 C CYS 131 1_555 K SG CYS 150 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 K SG CYS 211 C CYS 218 1_555 K SG CYS 240 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 K SG CYS 221 C CYS 228 1_555 K SG CYS 232 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf24 K SG CYS 370 C CYS 378 1_555 K SG CYS 436 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf25 K SG CYS 377 C CYS 385 1_555 K SG CYS 409 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 K SG CYS 492 C CYS 501 1_555 L SG CYS 94 E CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf27 L SG CYS 87 E CYS 598 1_555 L SG CYS 93 E CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf28 M SG CYS 120 D CYS 119 1_555 M SG CYS 198 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf29 M SG CYS 127 D CYS 126 1_555 M SG CYS 189 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 M SG CYS 132 D CYS 131 1_555 M SG CYS 150 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 M SG CYS 211 D CYS 218 1_555 M SG CYS 240 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 M SG CYS 221 D CYS 228 1_555 M SG CYS 232 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf33 M SG CYS 377 D CYS 385 1_555 M SG CYS 409 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf34 M SG CYS 492 D CYS 501 1_555 N SG CYS 94 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf35 N SG CYS 87 F CYS 598 1_555 N SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? covale ? covale1 A C ASP 108 H ASP 100 1_555 A N TYS 109 H TYS 100 1_555 C ? ? D ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? covale ? covale2 A C TYS 109 H TYS 100 1_555 A N GLY 110 H GLY 100 1_555 D ? ? E ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale3 A C GLY 110 H GLY 100 1_555 A N TYS 111 H TYS 100 1_555 E ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale4 A C TYS 111 H TYS 100 1_555 A N PHE 112 H PHE 100 1_555 F ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale5 I ND2 ASN 89 A ASN 88 1_555 Z C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale6 I ND2 ASN 134 A ASN 133 1_555 AA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale7 I ND2 ASN 149 A ASN 156 1_555 BA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale8 I ND2 ASN 153 A ASN 160 1_555 CA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale9 I ND2 ASN 190 A ASN 197 1_555 DA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale10 I ND2 ASN 227 A ASN 234 1_555 EA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale11 I ND2 ASN 234 A ASN 241 1_555 JA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale12 I ND2 ASN 255 A ASN 262 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale13 I ND2 ASN 269 A ASN 276 1_555 FA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 I ND2 ASN 282 A ASN 289 1_555 IA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale15 I ND2 ASN 288 A ASN 295 1_555 GA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale16 I ND2 ASN 294 A ASN 301 1_555 KA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale17 I ND2 ASN 324 A ASN 332 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 I ND2 ASN 378 A ASN 386 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale19 I ND2 ASN 439 A ASN 448 1_555 HA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale20 J ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 LA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale21 J ND2 ASN 107 B ASN 618 1_555 MA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale22 J ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 NA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale23 K ND2 ASN 89 C ASN 88 1_555 OA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale24 K ND2 ASN 134 C ASN 133 1_555 PA C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale25 K ND2 ASN 138 C ASN 137 1_555 QA C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale26 K ND2 ASN 149 C ASN 156 1_555 RA C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 K ND2 ASN 153 C ASN 160 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale28 K ND2 ASN 190 C ASN 197 1_555 SA C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale29 K ND2 ASN 227 C ASN 234 1_555 TA C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale30 K ND2 ASN 234 C ASN 241 1_555 UA C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale31 K ND2 ASN 255 C ASN 262 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale32 K ND2 ASN 269 C ASN 276 1_555 VA C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale33 K ND2 ASN 282 C ASN 289 1_555 WA C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale34 K ND2 ASN 288 C ASN 295 1_555 XA C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale35 K ND2 ASN 294 C ASN 301 1_555 YA C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 K ND2 ASN 324 C ASN 332 1_555 ZA C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale37 K ND2 ASN 347 C ASN 355 1_555 AB C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale38 K ND2 ASN 378 C ASN 386 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale39 K ND2 ASN 384 C ASN 392 1_555 BB C1 NAG . C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale40 K ND2 ASN 439 C ASN 448 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale41 L ND2 ASN 100 E ASN 611 1_555 CB C1 NAG . E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 L ND2 ASN 107 E ASN 618 1_555 DB C1 NAG . E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 L ND2 ASN 114 E ASN 625 1_555 FB C1 NAG . E NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale44 L ND2 ASN 126 E ASN 637 1_555 EB C1 NAG . E NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale45 M ND2 ASN 89 D ASN 88 1_555 GB C1 NAG . D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale46 M ND2 ASN 149 D ASN 156 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale47 M ND2 ASN 153 D ASN 160 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale48 M ND2 ASN 190 D ASN 197 1_555 HB C1 NAG . D NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale49 M ND2 ASN 227 D ASN 234 1_555 IB C1 NAG . D NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale50 M ND2 ASN 234 D ASN 241 1_555 JB C1 NAG . D NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale51 M ND2 ASN 255 D ASN 262 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale52 M ND2 ASN 269 D ASN 276 1_555 KB C1 NAG . D NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale53 M ND2 ASN 282 D ASN 289 1_555 LB C1 NAG . D NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale54 M ND2 ASN 288 D ASN 295 1_555 MB C1 NAG . D NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 M ND2 ASN 294 D ASN 301 1_555 OB C1 NAG . D NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale56 M ND2 ASN 324 D ASN 332 1_555 NB C1 NAG . D NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale57 M ND2 ASN 331 D ASN 339 1_555 PB C1 NAG . D NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale58 M ND2 ASN 378 D ASN 386 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale59 M ND2 ASN 384 D ASN 392 1_555 QB C1 NAG . D NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale60 M ND2 ASN 439 D ASN 448 1_555 RB C1 NAG . D NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale61 N ND2 ASN 100 F ASN 611 1_555 SB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale62 N ND2 ASN 107 F ASN 618 1_555 TB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale63 N ND2 ASN 114 F ASN 625 1_555 UB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale64 N ND2 ASN 126 F ASN 637 1_555 VB C1 NAG . F NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale65 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale66 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale67 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale68 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale69 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale70 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale71 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale72 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale73 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale74 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale75 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale76 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale77 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale78 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9B8B _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Z 9 NAG A 1 601 508 NAG NAG . AA 9 NAG A 1 602 509 NAG NAG . BA 9 NAG A 1 603 510 NAG NAG . CA 9 NAG A 1 604 512 NAG NAG . DA 9 NAG A 1 605 513 NAG NAG . EA 9 NAG A 1 606 514 NAG NAG . FA 9 NAG A 1 607 515 NAG NAG . GA 9 NAG A 1 608 516 NAG NAG . HA 9 NAG A 1 609 518 NAG NAG . IA 9 NAG A 1 610 522 NAG NAG . JA 9 NAG A 1 611 523 NAG NAG . KA 9 NAG A 1 612 524 NAG NAG . LA 9 NAG B 1 701 665 NAG NAG . MA 9 NAG B 1 702 666 NAG NAG . NA 9 NAG B 1 703 667 NAG NAG . OA 9 NAG C 1 601 508 NAG NAG . PA 9 NAG C 1 602 509 NAG NAG . QA 9 NAG C 1 603 510 NAG NAG . RA 9 NAG C 1 604 511 NAG NAG . SA 9 NAG C 1 605 514 NAG NAG . TA 9 NAG C 1 606 515 NAG NAG . UA 9 NAG C 1 607 516 NAG NAG . VA 9 NAG C 1 608 522 NAG NAG . WA 9 NAG C 1 609 523 NAG NAG . XA 9 NAG C 1 610 524 NAG NAG . YA 9 NAG C 1 611 525 NAG NAG . ZA 9 NAG C 1 612 526 NAG NAG . AB 9 NAG C 1 613 527 NAG NAG . BB 9 NAG C 1 614 529 NAG NAG . CB 9 NAG E 1 701 665 NAG NAG . DB 9 NAG E 1 702 666 NAG NAG . EB 9 NAG E 1 703 667 NAG NAG . FB 9 NAG E 1 704 668 NAG NAG . GB 9 NAG D 1 601 508 NAG NAG . HB 9 NAG D 1 602 514 NAG NAG . IB 9 NAG D 1 603 515 NAG NAG . JB 9 NAG D 1 604 516 NAG NAG . KB 9 NAG D 1 605 520 NAG NAG . LB 9 NAG D 1 606 521 NAG NAG . MB 9 NAG D 1 607 522 NAG NAG . NB 9 NAG D 1 608 523 NAG NAG . OB 9 NAG D 1 609 524 NAG NAG . PB 9 NAG D 1 610 525 NAG NAG . QB 9 NAG D 1 611 528 NAG NAG . RB 9 NAG D 1 612 529 NAG NAG . SB 9 NAG F 1 701 665 NAG NAG . TB 9 NAG F 1 702 666 NAG NAG . UB 9 NAG F 1 703 667 NAG NAG . VB 9 NAG F 1 704 668 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . VB 9 181.753 229.464 211.248 1 72.63 ? C1 NAG 704 F 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . VB 9 180.574 230.248 211.832 1 72.96 ? C2 NAG 704 F 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . VB 9 179.382 230.166 210.891 1 76.56 ? C3 NAG 704 F 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . VB 9 179.8 230.673 209.521 1 80.3 ? C4 NAG 704 F 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . VB 9 180.992 229.852 209.021 1 79.65 ? C5 NAG 704 F 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . VB 9 181.529 230.339 207.695 1 80.31 ? C6 NAG 704 F 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . VB 9 180.548 230.347 214.303 1 66.18 ? C7 NAG 704 F 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . VB 9 180.06 229.624 215.533 1 60.51 ? C8 NAG 704 F 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . VB 9 180.224 229.757 213.139 1 71.34 ? N2 NAG 704 F 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . VB 9 178.329 230.934 211.408 1 76.5 ? O3 NAG 704 F 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . VB 9 178.721 230.551 208.625 1 80.56 ? O4 NAG 704 F 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . VB 9 182.05 229.938 209.955 1 75.57 ? O5 NAG 704 F 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . VB 9 182.933 230.229 207.697 1 74.99 ? O6 NAG 704 F 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . VB 9 181.187 231.385 214.385 1 64.08 ? O7 NAG 704 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 332 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #