data_9BBF # _model_server_result.job_id eaplYbJsQDd86EpX24AzHQ _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 17:30:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9bbf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":902}' # _entry.id 9BBF # _exptl.entry_id 9BBF _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9BBF _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9BBF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 181 A ASP 222 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 181 A ASP 222 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 181 A ASP 222 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 183 A ASP 224 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 183 A ASP 224 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 183 A ASP 224 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 190 A GLU 231 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLU 190 A GLU 231 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc9 A OE2 GLU 190 A GLU 231 1_555 J CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.18 ? metalc ? metalc10 A O ASN 219 A ASN 260 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc11 A O GLU 222 A GLU 263 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 232 A ASP 273 1_555 I CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc13 B OD1 ASP 179 B ASP 220 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? metalc ? metalc14 B OD2 ASP 181 B ASP 222 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASP 181 B ASP 222 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc16 B OD2 ASP 181 B ASP 222 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.047 ? metalc ? metalc17 B OD2 ASP 183 B ASP 224 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASP 183 B ASP 224 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 183 B ASP 224 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.958 ? metalc ? metalc20 B O ILE 185 B ILE 226 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc21 B OE1 GLU 190 B GLU 231 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc22 B OE2 GLU 190 B GLU 231 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc23 B OE1 GLU 190 B GLU 231 1_555 L CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc24 B O ASN 219 B ASN 260 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc25 B O GLU 222 B GLU 263 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.122 ? metalc ? metalc26 B OD2 ASP 232 B ASP 273 1_555 K CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc27 C OD2 ASP 181 C ASP 222 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc28 C OD1 ASP 181 C ASP 222 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc29 C OD2 ASP 181 C ASP 222 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc30 C OD2 ASP 183 C ASP 224 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc31 C OD1 ASP 183 C ASP 224 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc32 C OD2 ASP 183 C ASP 224 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc33 C OE2 GLU 190 C GLU 231 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc34 C OE1 GLU 190 C GLU 231 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc35 C OE2 GLU 190 C GLU 231 1_555 N CA CA . C CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc36 C O ASN 219 C ASN 260 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? metalc ? metalc37 C O GLU 222 C GLU 263 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc38 C OD2 ASP 232 C ASP 273 1_555 M CA CA . C CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc39 D OD2 ASP 183 D ASP 224 1_555 O CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc40 D OD1 ASP 183 D ASP 224 1_555 P CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? metalc ? metalc41 D OD2 ASP 183 D ASP 224 1_555 P CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc42 D OE2 GLU 190 D GLU 231 1_555 O CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc43 D OE1 GLU 190 D GLU 231 1_555 P CA CA . D CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc44 D O ASN 219 D ASN 260 1_555 O CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc45 D O GLU 222 D GLU 263 1_555 O CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc46 D OD2 ASP 232 D ASP 273 1_555 O CA CA . D CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc47 E OD1 ASP 179 E ASP 220 1_555 R CA CA . E CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc48 E OD2 ASP 181 E ASP 222 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc49 E OD1 ASP 181 E ASP 222 1_555 R CA CA . E CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc50 E OD2 ASP 183 E ASP 224 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc51 E OD1 ASP 183 E ASP 224 1_555 R CA CA . E CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc52 E O ILE 185 E ILE 226 1_555 R CA CA . E CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc53 E OE2 GLU 190 E GLU 231 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.108 ? metalc ? metalc54 E OE1 GLU 190 E GLU 231 1_555 R CA CA . E CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc55 E O ASN 219 E ASN 260 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc56 E O GLU 222 E GLU 263 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc57 E OD2 ASP 232 E ASP 273 1_555 Q CA CA . E CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc58 F OD1 ASP 179 F ASP 220 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc59 F OD2 ASP 181 F ASP 222 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc60 F OD1 ASP 181 F ASP 222 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc61 F OD2 ASP 181 F ASP 222 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.071 ? metalc ? metalc62 F OD2 ASP 183 F ASP 224 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc63 F OD1 ASP 183 F ASP 224 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc64 F OD2 ASP 183 F ASP 224 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc ? metalc65 F O ILE 185 F ILE 226 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc66 F OE2 GLU 190 F GLU 231 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc67 F OE1 GLU 190 F GLU 231 1_555 T CA CA . F CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc68 F O GLU 222 F GLU 263 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc69 F O SER 223 F SER 264 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.843 ? metalc ? metalc70 F OD2 ASP 232 F ASP 273 1_555 S CA CA . F CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc71 G OD1 ASP 179 G ASP 220 1_555 V CA CA . G CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? metalc ? metalc72 G OD2 ASP 181 G ASP 222 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc73 G OD1 ASP 181 G ASP 222 1_555 V CA CA . G CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc74 G OD2 ASP 183 G ASP 224 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc75 G OD1 ASP 183 G ASP 224 1_555 V CA CA . G CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc76 G O ILE 185 G ILE 226 1_555 V CA CA . G CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc77 G OE2 GLU 190 G GLU 231 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? metalc ? metalc78 G OE1 GLU 190 G GLU 231 1_555 V CA CA . G CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc79 G O ASN 219 G ASN 260 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc80 G O GLU 222 G GLU 263 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc81 G OD2 ASP 232 G ASP 273 1_555 U CA CA . G CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9BBF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 CA A 1 901 901 CA CA . J 3 CA A 1 902 902 CA CA . K 3 CA B 1 901 901 CA CA . L 3 CA B 1 902 902 CA CA . M 3 CA C 1 901 901 CA CA . N 3 CA C 1 902 902 CA CA . O 3 CA D 1 901 901 CA CA . P 3 CA D 1 902 902 CA CA . Q 3 CA E 1 901 901 CA CA . R 3 CA E 1 902 902 CA CA . S 3 CA F 1 901 901 CA CA . T 3 CA F 1 902 902 CA CA . U 3 CA G 1 901 901 CA CA . V 3 CA G 1 902 902 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id L _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 127.25 _atom_site.Cartn_y 140.921 _atom_site.Cartn_z 104.714 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 67.26 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 902 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 41 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #