data_9BNE # _model_server_result.job_id Ew3ZP3r4ePJSLeRd-QpdPg _model_server_result.datetime_utc '2025-09-04 15:23:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9bne # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"YA","auth_seq_id":1311}' # _entry.id 9BNE # _exptl.entry_id 9BNE _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 4 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 33 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9BNE _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9BNE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 S N N ? 4 T N N ? 4 U N N ? 4 V N N ? 4 W N N ? 4 X N N ? 4 Y N N ? 4 Z N N ? 4 AA N N ? 4 BA N N ? 4 CA N N ? 4 DA N N ? 4 EA N N ? 4 FA N N ? 4 GA N N ? 4 HA N N ? 4 IA N N ? 4 JA N N ? 4 KA N N ? 4 LA N N ? 4 MA N N ? 4 NA N N ? 4 OA N N ? 4 PA N N ? 4 QA N N ? 4 RA N N ? 4 SA N N ? 4 TA N N ? 4 UA N N ? 4 VA N N ? 4 WA N N ? 4 XA N N ? 4 YA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG G 1 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG G 2 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG H 1 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG H 2 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG I 1 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG I 2 NAG 3 n J NAG 1 K 1 NAG K 1 NAG 3 n J NAG 2 K 2 NAG K 2 NAG 3 n K NAG 1 L 1 NAG L 1 NAG 3 n K NAG 2 L 2 NAG L 2 NAG 3 n L NAG 1 M 1 NAG M 1 NAG 3 n L NAG 2 M 2 NAG M 2 NAG 3 n M NAG 1 N 1 NAG N 1 NAG 3 n M NAG 2 N 2 NAG N 2 NAG 3 n N NAG 1 O 1 NAG O 1 NAG 3 n N NAG 2 O 2 NAG O 2 NAG 3 n O NAG 1 P 1 NAG P 1 NAG 3 n O NAG 2 P 2 NAG P 2 NAG 3 n P NAG 1 Q 1 NAG Q 1 NAG 3 n P NAG 2 Q 2 NAG Q 2 NAG 3 n Q NAG 1 R 1 NAG R 1 NAG 3 n Q NAG 2 R 2 NAG R 2 NAG 3 n R NAG 1 J 1 NAG J 1 NAG 3 n R NAG 2 J 2 NAG J 2 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 199 A CYS 1133 1_555 A SG CYS 207 A CYS 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 410 A CYS 1344 1_555 A SG CYS 427 A CYS 1361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 596 A CYS 1530 1_555 A SG CYS 608 A CYS 1542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 131 B CYS 131 1_555 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 291 B CYS 291 1_555 B SG CYS 301 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 336 B CYS 336 1_555 B SG CYS 361 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 379 B CYS 379 1_555 B SG CYS 432 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 391 B CYS 391 1_555 B SG CYS 525 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 480 B CYS 480 1_555 B SG CYS 488 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 649 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 662 B CYS 662 1_555 B SG CYS 671 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 738 B CYS 738 1_555 B SG CYS 760 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 743 B CYS 743 1_555 B SG CYS 749 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 1032 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1043 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 1082 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1126 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 199 C CYS 1133 1_555 C SG CYS 207 C CYS 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 410 C CYS 1344 1_555 C SG CYS 427 C CYS 1361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 596 C CYS 1530 1_555 C SG CYS 608 C CYS 1542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 D SG CYS 131 D CYS 131 1_555 D SG CYS 166 D CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 D SG CYS 291 D CYS 291 1_555 D SG CYS 301 D CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf21 D SG CYS 336 D CYS 336 1_555 D SG CYS 361 D CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf22 D SG CYS 379 D CYS 379 1_555 D SG CYS 432 D CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf23 D SG CYS 391 D CYS 391 1_555 D SG CYS 525 D CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf24 D SG CYS 480 D CYS 480 1_555 D SG CYS 488 D CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 617 D CYS 617 1_555 D SG CYS 649 D CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 662 D CYS 662 1_555 D SG CYS 671 D CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 738 D CYS 738 1_555 D SG CYS 760 D CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 743 D CYS 743 1_555 D SG CYS 749 D CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 1032 D CYS 1032 1_555 D SG CYS 1043 D CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 1082 D CYS 1082 1_555 D SG CYS 1126 D CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 199 E CYS 1133 1_555 E SG CYS 207 E CYS 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 410 E CYS 1344 1_555 E SG CYS 427 E CYS 1361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf33 E SG CYS 596 E CYS 1530 1_555 E SG CYS 608 E CYS 1542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf34 F SG CYS 131 F CYS 131 1_555 F SG CYS 166 F CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf35 F SG CYS 291 F CYS 291 1_555 F SG CYS 301 F CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 F SG CYS 336 F CYS 336 1_555 F SG CYS 361 F CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf37 F SG CYS 379 F CYS 379 1_555 F SG CYS 432 F CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 F SG CYS 391 F CYS 391 1_555 F SG CYS 525 F CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf39 F SG CYS 480 F CYS 480 1_555 F SG CYS 488 F CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf40 F SG CYS 617 F CYS 617 1_555 F SG CYS 649 F CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf41 F SG CYS 662 F CYS 662 1_555 F SG CYS 671 F CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 738 F CYS 738 1_555 F SG CYS 760 F CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf43 F SG CYS 743 F CYS 743 1_555 F SG CYS 749 F CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf44 F SG CYS 1032 F CYS 1032 1_555 F SG CYS 1043 F CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf45 F SG CYS 1082 F CYS 1082 1_555 F SG CYS 1126 F CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 B ND2 ASN 61 B ASN 61 1_555 S C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale2 B ND2 ASN 122 B ASN 122 1_555 T C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale3 B ND2 ASN 165 B ASN 165 1_555 U C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale4 B ND2 ASN 234 B ASN 234 1_555 V C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 B ND2 ASN 282 B ASN 282 1_555 W C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale6 B ND2 ASN 331 B ASN 331 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 343 B ASN 343 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 616 B ASN 616 1_555 X C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 657 B ASN 657 1_555 Y C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 709 B ASN 709 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 717 B ASN 717 1_555 R C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 801 B ASN 801 1_555 J C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 1074 B ASN 1074 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 1098 B ASN 1098 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 1134 B ASN 1134 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 61 D ASN 61 1_555 CA C1 NAG . D NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 122 D ASN 122 1_555 DA C1 NAG . D NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 165 D ASN 165 1_555 EA C1 NAG . D NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 234 D ASN 234 1_555 FA C1 NAG . D NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 282 D ASN 282 1_555 GA C1 NAG . D NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 331 D ASN 331 1_555 HA C1 NAG . D NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 D ND2 ASN 343 D ASN 343 1_555 IA C1 NAG . D NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale23 D ND2 ASN 616 D ASN 616 1_555 JA C1 NAG . D NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale24 D ND2 ASN 657 D ASN 657 1_555 KA C1 NAG . D NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 D ND2 ASN 709 D ASN 709 1_555 LA C1 NAG . D NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale26 D ND2 ASN 717 D ASN 717 1_555 K C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale27 D ND2 ASN 801 D ASN 801 1_555 L C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale28 D ND2 ASN 1074 D ASN 1074 1_555 MA C1 NAG . D NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale29 D ND2 ASN 1098 D ASN 1098 1_555 M C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale30 D ND2 ASN 1134 D ASN 1134 1_555 NA C1 NAG . D NAG 1312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 F ND2 ASN 61 F ASN 61 1_555 OA C1 NAG . F NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale32 F ND2 ASN 122 F ASN 122 1_555 PA C1 NAG . F NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale33 F ND2 ASN 165 F ASN 165 1_555 QA C1 NAG . F NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale34 F ND2 ASN 234 F ASN 234 1_555 RA C1 NAG . F NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale35 F ND2 ASN 282 F ASN 282 1_555 SA C1 NAG . F NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 331 F ASN 331 1_555 N C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale37 F ND2 ASN 343 F ASN 343 1_555 O C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale38 F ND2 ASN 616 F ASN 616 1_555 TA C1 NAG . F NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 F ND2 ASN 657 F ASN 657 1_555 UA C1 NAG . F NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale40 F ND2 ASN 709 F ASN 709 1_555 VA C1 NAG . F NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale41 F ND2 ASN 717 F ASN 717 1_555 P C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale42 F ND2 ASN 801 F ASN 801 1_555 Q C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale43 F ND2 ASN 1074 F ASN 1074 1_555 WA C1 NAG . F NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale44 F ND2 ASN 1098 F ASN 1098 1_555 XA C1 NAG . F NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale45 F ND2 ASN 1134 F ASN 1134 1_555 YA C1 NAG . F NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale46 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale47 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale48 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale49 J O4 NAG . K NAG 1 1_555 J C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale50 K O4 NAG . L NAG 1 1_555 K C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale51 L O4 NAG . M NAG 1 1_555 L C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale52 M O4 NAG . N NAG 1 1_555 M C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale53 N O4 NAG . O NAG 1 1_555 N C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale54 O O4 NAG . P NAG 1 1_555 O C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale55 P O4 NAG . Q NAG 1 1_555 P C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale56 Q O4 NAG . R NAG 1 1_555 Q C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale57 R O4 NAG . J NAG 1 1_555 R C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9BNE _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 4 NAG B 1 1301 1301 NAG NAG . T 4 NAG B 1 1302 1302 NAG NAG . U 4 NAG B 1 1303 1303 NAG NAG . V 4 NAG B 1 1304 1304 NAG NAG . W 4 NAG B 1 1305 1305 NAG NAG . X 4 NAG B 1 1306 1309 NAG NAG . Y 4 NAG B 1 1307 1310 NAG NAG . Z 4 NAG B 1 1308 1311 NAG NAG . AA 4 NAG B 1 1309 1314 NAG NAG . BA 4 NAG B 1 1310 1316 NAG NAG . CA 4 NAG D 1 1301 1301 NAG NAG . DA 4 NAG D 1 1302 1302 NAG NAG . EA 4 NAG D 1 1303 1303 NAG NAG . FA 4 NAG D 1 1304 1304 NAG NAG . GA 4 NAG D 1 1305 1305 NAG NAG . HA 4 NAG D 1 1306 1306 NAG NAG . IA 4 NAG D 1 1307 1307 NAG NAG . JA 4 NAG D 1 1308 1309 NAG NAG . KA 4 NAG D 1 1309 1310 NAG NAG . LA 4 NAG D 1 1310 1311 NAG NAG . MA 4 NAG D 1 1311 1314 NAG NAG . NA 4 NAG D 1 1312 1316 NAG NAG . OA 4 NAG F 1 1301 1301 NAG NAG . PA 4 NAG F 1 1302 1302 NAG NAG . QA 4 NAG F 1 1303 1303 NAG NAG . RA 4 NAG F 1 1304 1304 NAG NAG . SA 4 NAG F 1 1305 1305 NAG NAG . TA 4 NAG F 1 1306 1309 NAG NAG . UA 4 NAG F 1 1307 1310 NAG NAG . VA 4 NAG F 1 1308 1311 NAG NAG . WA 4 NAG F 1 1309 1314 NAG NAG . XA 4 NAG F 1 1310 1315 NAG NAG . YA 4 NAG F 1 1311 1316 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . YA 4 164.841 126.201 36.68 1 386.68 ? C1 NAG 1311 F 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . YA 4 166.08 127.11 36.926 1 390.06 ? C2 NAG 1311 F 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . YA 4 166.815 126.794 38.243 1 391.61 ? C3 NAG 1311 F 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . YA 4 167.005 125.304 38.503 1 392.51 ? C4 NAG 1311 F 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . YA 4 165.74 124.494 38.255 1 392.04 ? C5 NAG 1311 F 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . YA 4 164.669 124.689 39.305 1 389.88 ? C6 NAG 1311 F 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . YA 4 167.531 126.122 35.153 1 394.19 ? C7 NAG 1311 F 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . YA 4 168.445 126.453 34.012 1 394.92 ? C8 NAG 1311 F 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . YA 4 166.996 127.172 35.792 1 392.6 ? N2 NAG 1311 F 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . YA 4 166.128 127.402 39.332 1 388.29 ? O3 NAG 1311 F 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . YA 4 168.063 124.792 37.701 1 394.35 ? O4 NAG 1311 F 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . YA 4 165.164 124.808 36.98 1 390.62 ? O5 NAG 1311 F 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . YA 4 165.224 125.123 40.539 1 390.63 ? O6 NAG 1311 F 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . YA 4 167.304 124.964 35.48 1 394.18 ? O7 NAG 1311 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 109 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 41 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #