data_9BPE
#
_model_server_result.job_id            ClQ18sDtIPr52uDkr6rFpQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-10 15:26:03' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9bpe 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":2001}' 
#
_entry.id    9BPE 
#
loop_
_exptl.entry_id
_exptl.method
9BPE 'X-RAY DIFFRACTION' 
9BPE 'NEUTRON DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              473.439 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'N-[4-({[(6S)-2-amino-5-formyl-4-oxo-3,4,5,6,7,8-hexahydropteridin-6-yl]methyl}amino)benzoyl]-L-glutamic acid' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          91.52 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            9BPE 
_cell.length_a            58.764 
_cell.length_b            83.478 
_cell.length_c            95.558 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 9BPE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             D 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C HIS 220 A HIS 225 1_555 A N LLP 221 A LLP 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale2 A C LLP 221 A LLP 226 1_555 A N THR 222 A THR 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale3 B C HIS 220 B HIS 1225 1_555 B N LLP 221 B LLP 1226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale4 B C LLP 221 B LLP 1226 1_555 B N THR 222 B THR 1227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
#
_chem_comp.formula           'C20 H23 N7 O7' 
_chem_comp.formula_weight    473.439 
_chem_comp.id                FFO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'N-[4-({[(6S)-2-amino-5-formyl-4-oxo-3,4,5,6,7,8-hexahydropteridin-6-yl]methyl}amino)benzoyl]-L-glutamic acid' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     '[6S]-5-FORMYL-TETRAHYDROFOLATE;6S-FOLINIC ACID' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N1 C2 FFO doub 91 n n 
N1 C8A FFO sing 92 n n 
C2 NA2 FFO sing 93 n n 
C2 N3 FFO sing 94 n n 
NA2 HN21 FFO sing 95 n n 
NA2 HN22 FFO sing 96 n n 
N3 C4 FFO sing 97 n n 
N3 H22 FFO sing 98 n n 
C4 O4 FFO doub 99 n n 
C4 C4A FFO sing 100 n n 
C4A N5 FFO sing 101 n n 
C4A C8A FFO doub 102 n n 
N5 C6 FFO sing 103 n n 
N5 C5A FFO sing 104 n n 
C6 C7 FFO sing 105 n n 
C6 C9 FFO sing 106 n n 
C6 H6 FFO sing 107 n n 
C7 N8 FFO sing 108 n n 
C7 H7 FFO sing 109 n n 
C7 H23 FFO sing 110 n n 
N8 C8A FFO sing 111 n n 
N8 H24 FFO sing 112 n n 
C9 N10 FFO sing 113 n n 
C9 H91 FFO sing 114 n n 
C9 H92 FFO sing 115 n n 
N10 C14 FFO sing 116 n n 
N10 HN0 FFO sing 117 n n 
C11 C12 FFO doub 118 n y 
C11 C16 FFO sing 119 n y 
C11 C FFO sing 120 n n 
C12 C13 FFO sing 121 n y 
C12 H12 FFO sing 122 n n 
C13 C14 FFO doub 123 n y 
C13 H13 FFO sing 124 n n 
C14 C15 FFO sing 125 n y 
C15 C16 FFO doub 126 n y 
C15 H15 FFO sing 127 n n 
C16 H16 FFO sing 128 n n 
C O FFO doub 129 n n 
C N FFO sing 130 n n 
N CA FFO sing 131 n n 
N HN FFO sing 132 n n 
CA CB FFO sing 133 n n 
CA CT FFO sing 134 n n 
CA HA FFO sing 135 n n 
CB CG FFO sing 136 n n 
CB HB1 FFO sing 137 n n 
CB HB2 FFO sing 138 n n 
CG CD FFO sing 139 n n 
CG HG1 FFO sing 140 n n 
CG HG2 FFO sing 141 n n 
CD OE1 FFO doub 142 n n 
CD OE2 FFO sing 143 n n 
OE2 HOE2 FFO sing 144 n n 
CT O1 FFO doub 145 n n 
CT O2 FFO sing 146 n n 
O2 HO2 FFO sing 147 n n 
C5A O5B FFO doub 148 n n 
C5A H5A FFO sing 149 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9BPE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017017 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000452 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011979 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.010469 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 SO4 A 1 501 3004 SO4 SO4 . 
D 3 FFO B 1 2001 2001 FFO FFO . 
E 4 ACT B 1 2002 3001 ACT ACT . 
F 5 DOD A 1 601 4494 DOD DOD . 
F 5 DOD A 2 602 4112 DOD DOD . 
F 5 DOD A 3 603 4151 DOD DOD . 
F 5 DOD A 4 604 4192 DOD DOD . 
F 5 DOD A 5 605 4097 DOD DOD . 
F 5 DOD A 6 606 4484 DOD DOD . 
F 5 DOD A 7 607 4152 DOD DOD . 
F 5 DOD A 8 608 4199 DOD DOD . 
F 5 DOD A 9 609 4106 DOD DOD . 
F 5 DOD A 10 610 4122 DOD DOD . 
F 5 DOD A 11 611 4395 DOD DOD . 
F 5 DOD A 12 612 4358 DOD DOD . 
F 5 DOD A 13 613 4041 DOD DOD . 
F 5 DOD A 14 614 4033 DOD DOD . 
F 5 DOD A 15 615 4240 DOD DOD . 
F 5 DOD A 16 616 4334 DOD DOD . 
F 5 DOD A 17 617 4353 DOD DOD . 
F 5 DOD A 18 618 4167 DOD DOD . 
F 5 DOD A 19 619 4011 DOD DOD . 
F 5 DOD A 20 620 4225 DOD DOD . 
F 5 DOD A 21 621 4114 DOD DOD . 
F 5 DOD A 22 622 4496 DOD DOD . 
F 5 DOD A 23 623 4257 DOD DOD . 
F 5 DOD A 24 624 4155 DOD DOD . 
F 5 DOD A 25 625 4487 DOD DOD . 
F 5 DOD A 26 626 4204 DOD DOD . 
F 5 DOD A 27 627 4412 DOD DOD . 
F 5 DOD A 28 628 4073 DOD DOD . 
F 5 DOD A 29 629 4094 DOD DOD . 
F 5 DOD A 30 630 4171 DOD DOD . 
F 5 DOD A 31 631 4186 DOD DOD . 
F 5 DOD A 32 632 4168 DOD DOD . 
F 5 DOD A 33 633 4273 DOD DOD . 
F 5 DOD A 34 634 4344 DOD DOD . 
F 5 DOD A 35 635 4265 DOD DOD . 
F 5 DOD A 36 636 4088 DOD DOD . 
F 5 DOD A 37 637 4342 DOD DOD . 
F 5 DOD A 38 638 4444 DOD DOD . 
F 5 DOD A 39 639 4177 DOD DOD . 
F 5 DOD A 40 640 4340 DOD DOD . 
F 5 DOD A 41 641 4039 DOD DOD . 
F 5 DOD A 42 642 4025 DOD DOD . 
F 5 DOD A 43 643 4063 DOD DOD . 
F 5 DOD A 44 644 4028 DOD DOD . 
F 5 DOD A 45 645 4356 DOD DOD . 
F 5 DOD A 46 646 4343 DOD DOD . 
F 5 DOD A 47 647 4101 DOD DOD . 
F 5 DOD A 48 648 4007 DOD DOD . 
F 5 DOD A 49 649 4103 DOD DOD . 
F 5 DOD A 50 650 4248 DOD DOD . 
F 5 DOD A 51 651 4263 DOD DOD . 
F 5 DOD A 52 652 4208 DOD DOD . 
F 5 DOD A 53 653 4166 DOD DOD . 
F 5 DOD A 54 654 4015 DOD DOD . 
F 5 DOD A 55 655 4066 DOD DOD . 
F 5 DOD A 56 656 4035 DOD DOD . 
F 5 DOD A 57 657 4144 DOD DOD . 
F 5 DOD A 58 658 4232 DOD DOD . 
F 5 DOD A 59 659 4329 DOD DOD . 
F 5 DOD A 60 660 4061 DOD DOD . 
F 5 DOD A 61 661 4178 DOD DOD . 
F 5 DOD A 62 662 4108 DOD DOD . 
F 5 DOD A 63 663 4321 DOD DOD . 
F 5 DOD A 64 664 4129 DOD DOD . 
F 5 DOD A 65 665 4322 DOD DOD . 
F 5 DOD A 66 666 4346 DOD DOD . 
F 5 DOD A 67 667 4181 DOD DOD . 
F 5 DOD A 68 668 4084 DOD DOD . 
F 5 DOD A 69 669 4359 DOD DOD . 
F 5 DOD A 70 670 4058 DOD DOD . 
F 5 DOD A 71 671 4411 DOD DOD . 
F 5 DOD A 72 672 4115 DOD DOD . 
F 5 DOD A 73 673 4031 DOD DOD . 
F 5 DOD A 74 674 4158 DOD DOD . 
F 5 DOD A 75 675 4287 DOD DOD . 
F 5 DOD A 76 676 4100 DOD DOD . 
F 5 DOD A 77 677 4306 DOD DOD . 
F 5 DOD A 78 678 4006 DOD DOD . 
F 5 DOD A 79 679 4059 DOD DOD . 
F 5 DOD A 80 680 4331 DOD DOD . 
F 5 DOD A 81 681 4110 DOD DOD . 
F 5 DOD A 82 682 4096 DOD DOD . 
F 5 DOD A 83 683 4049 DOD DOD . 
F 5 DOD A 84 684 4279 DOD DOD . 
F 5 DOD A 85 685 4249 DOD DOD . 
F 5 DOD A 86 686 4138 DOD DOD . 
F 5 DOD A 87 687 4448 DOD DOD . 
F 5 DOD A 88 688 4012 DOD DOD . 
F 5 DOD A 89 689 4026 DOD DOD . 
F 5 DOD A 90 690 4259 DOD DOD . 
F 5 DOD A 91 691 4239 DOD DOD . 
F 5 DOD A 92 692 4018 DOD DOD . 
F 5 DOD A 93 693 4335 DOD DOD . 
F 5 DOD A 94 694 4010 DOD DOD . 
F 5 DOD A 95 695 4019 DOD DOD . 
F 5 DOD A 96 696 4070 DOD DOD . 
F 5 DOD A 97 697 4293 DOD DOD . 
F 5 DOD A 98 698 4218 DOD DOD . 
F 5 DOD A 99 699 4325 DOD DOD . 
F 5 DOD A 100 700 4064 DOD DOD . 
F 5 DOD A 101 701 4187 DOD DOD . 
F 5 DOD A 102 702 4078 DOD DOD . 
F 5 DOD A 103 703 4153 DOD DOD . 
F 5 DOD A 104 704 4109 DOD DOD . 
F 5 DOD A 105 705 4375 DOD DOD . 
F 5 DOD A 106 706 4048 DOD DOD . 
F 5 DOD A 107 707 4065 DOD DOD . 
F 5 DOD A 108 708 4083 DOD DOD . 
F 5 DOD A 109 709 4021 DOD DOD . 
F 5 DOD A 110 710 4483 DOD DOD . 
F 5 DOD A 111 711 4164 DOD DOD . 
F 5 DOD A 112 712 4141 DOD DOD . 
F 5 DOD A 113 713 4216 DOD DOD . 
F 5 DOD A 114 714 4362 DOD DOD . 
F 5 DOD A 115 715 4425 DOD DOD . 
F 5 DOD A 116 716 4393 DOD DOD . 
F 5 DOD A 117 717 4291 DOD DOD . 
F 5 DOD A 118 718 4244 DOD DOD . 
F 5 DOD A 119 719 4029 DOD DOD . 
F 5 DOD A 120 720 4022 DOD DOD . 
F 5 DOD A 121 721 4080 DOD DOD . 
F 5 DOD A 122 722 4043 DOD DOD . 
F 5 DOD A 123 723 4286 DOD DOD . 
F 5 DOD A 124 724 4372 DOD DOD . 
F 5 DOD A 125 725 4005 DOD DOD . 
F 5 DOD A 126 726 4040 DOD DOD . 
F 5 DOD A 127 727 4082 DOD DOD . 
F 5 DOD A 128 728 4262 DOD DOD . 
F 5 DOD A 129 729 4479 DOD DOD . 
F 5 DOD A 130 730 4196 DOD DOD . 
F 5 DOD A 131 731 4207 DOD DOD . 
F 5 DOD A 132 732 4284 DOD DOD . 
F 5 DOD A 133 733 4089 DOD DOD . 
F 5 DOD A 134 734 4003 DOD DOD . 
F 5 DOD A 135 735 4301 DOD DOD . 
F 5 DOD A 136 736 4289 DOD DOD . 
F 5 DOD A 137 737 4229 DOD DOD . 
F 5 DOD A 138 738 4313 DOD DOD . 
F 5 DOD A 139 739 4086 DOD DOD . 
F 5 DOD A 140 740 4311 DOD DOD . 
F 5 DOD A 141 741 4183 DOD DOD . 
F 5 DOD A 142 742 4203 DOD DOD . 
F 5 DOD A 143 743 4020 DOD DOD . 
F 5 DOD A 144 744 4118 DOD DOD . 
F 5 DOD A 145 745 4294 DOD DOD . 
F 5 DOD A 146 746 4054 DOD DOD . 
F 5 DOD A 147 747 4454 DOD DOD . 
F 5 DOD A 148 748 4211 DOD DOD . 
F 5 DOD A 149 749 4268 DOD DOD . 
F 5 DOD A 150 750 4320 DOD DOD . 
F 5 DOD A 151 751 4379 DOD DOD . 
F 5 DOD A 152 752 4173 DOD DOD . 
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HETATM 17 C C13 FFO . . . D 3 18.981 19.085 20.702 1 14.37 ? C13 FFO 2001 B 1 
HETATM 18 C C14 FFO . . . D 3 19.059 19.211 19.274 1 14.4 ? C14 FFO 2001 B 1 
HETATM 19 C C15 FFO . . . D 3 20.364 19.262 18.672 1 16.67 ? C15 FFO 2001 B 1 
HETATM 20 C C16 FFO . . . D 3 21.523 19.187 19.476 1 18.23 ? C16 FFO 2001 B 1 
HETATM 21 C C FFO . . . D 3 22.649 18.972 21.785 1 20.51 ? C FFO 2001 B 1 
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HETATM 42 H H12 FFO . . . D 3 20.069 18.91 22.565 1 15.41 ? H12 FFO 2001 B 1 
HETATM 43 H H13 FFO . . . D 3 18.003 19.039 21.175 1 13.58 ? H13 FFO 2001 B 1 
HETATM 44 H H15 FFO . . . D 3 20.471 19.36 17.594 1 17.34 ? H15 FFO 2001 B 1 
HETATM 45 H H16 FFO . . . D 3 22.49 19.231 18.984 1 18.18 ? H16 FFO 2001 B 1 
HETATM 46 D DN FFO . . . D 3 21.682 19.871 23.412 1 19.71 ? DN FFO 2001 B 1 
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HETATM 50 H HG1 FFO . . . D 3 22.905 22.134 24.638 1 28.81 ? HG1 FFO 2001 B 1 
HETATM 51 H HG2 FFO . . . D 3 23.256 22.157 22.915 1 29 ? HG2 FFO 2001 B 1 
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