data_9C6K # _model_server_result.job_id 9k18tVCoWsyP6Ha_d3RxUw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-28 06:51:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9c6k # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":207}' # _entry.id 9C6K # _exptl.entry_id 9C6K _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9C6K _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9C6K _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O4 U 328 X U 25 1_555 J NA NA . X NA 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc2 A O6 G 363 X G 60 1_555 B MG MG . X MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? metalc ? metalc3 A O6 G 381 X G 78 1_555 B MG MG . X MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? metalc ? metalc4 B MG MG . X MG 201 1_555 D O2B TPP . X TPP 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.888 ? metalc ? metalc5 C MG MG . X MG 202 1_555 D O1A TPP . X TPP 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc6 C MG MG . X MG 202 1_555 D O1B TPP . X TPP 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc ? metalc7 D O7 TPP . X TPP 203 1_555 E MG MG . X MG 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.933 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 313 X G 10 1_555 A N3 C 392 X C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 313 X G 10 1_555 A O2 C 392 X C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 313 X G 10 1_555 A N4 C 392 X C 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog4 A N3 U 314 X U 11 1_555 A O6 G 391 X G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog5 A O2 U 314 X U 11 1_555 A N1 G 391 X G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N1 A 315 X A 12 1_555 A N3 U 390 X U 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N6 A 315 X A 12 1_555 A O4 U 390 X U 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N3 C 316 X C 13 1_555 A N1 G 389 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N4 C 316 X C 13 1_555 A O6 G 389 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O2 C 316 X C 13 1_555 A N2 G 389 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 U 317 X U 14 1_555 A N1 A 388 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O4 U 317 X U 14 1_555 A N6 A 388 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N3 C 318 X C 15 1_555 A N1 G 354 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N4 C 318 X C 15 1_555 A O6 G 354 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O2 C 318 X C 15 1_555 A N2 G 354 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 G 319 X G 16 1_555 A N3 C 353 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N2 G 319 X G 16 1_555 A O2 C 353 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O6 G 319 X G 16 1_555 A N4 C 353 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog19 A N2 G 319 X G 16 1_555 A N3 A 387 X A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N1 G 320 X G 17 1_555 A N3 C 352 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N2 G 320 X G 17 1_555 A O2 C 352 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O6 G 320 X G 17 1_555 A N4 C 352 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog23 A N2 G 320 X G 17 1_555 A N3 A 359 X A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N1 G 321 X G 18 1_555 A N3 C 351 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N2 G 321 X G 18 1_555 A O2 C 351 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A O6 G 321 X G 18 1_555 A N4 C 351 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_4_PAIR hydrog27 A N2 G 322 X G 19 1_555 A N3 G 345 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_4_PAIR hydrog28 A N3 G 322 X G 19 1_555 A N2 G 345 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog29 A N1 G 322 X G 19 1_555 A N1 A 350 X A 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog30 A O6 G 322 X G 19 1_555 A N6 A 350 X A 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N3 U 323 X U 20 1_555 A N1 A 348 X A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A O4 U 323 X U 20 1_555 A N6 A 348 X A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N1 G 324 X G 21 1_555 A N3 C 341 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N2 G 324 X G 21 1_555 A O2 C 341 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A O6 G 324 X G 21 1_555 A N4 C 341 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N3 C 325 X C 22 1_555 A N1 G 340 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N4 C 325 X C 22 1_555 A O6 G 340 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A O2 C 325 X C 22 1_555 A N2 G 340 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N3 C 326 X C 23 1_555 A N1 G 339 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A N4 C 326 X C 23 1_555 A O6 G 339 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A O2 C 326 X C 23 1_555 A N2 G 339 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N3 U 328 X U 25 1_555 A N1 A 338 X A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O4 U 328 X U 25 1_555 A N6 A 338 X A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N3 U 329 X U 26 1_555 A N1 A 337 X A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A O4 U 329 X U 26 1_555 A N6 A 337 X A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N3 C 330 X C 27 1_555 A N1 G 336 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N4 C 330 X C 27 1_555 A O6 G 336 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A O2 C 330 X C 27 1_555 A N2 G 336 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_12_PAIR hydrog49 A N3 U 331 X U 28 1_555 A O4 U 335 X U 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_12_PAIR hydrog50 A O4 U 331 X U 28 1_555 A N3 U 335 X U 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog51 A N2 G 340 X G 37 1_555 A N1 A 372 X A 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog52 A N3 U 342 X U 39 1_555 A N7 A 346 X A 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog53 A O2 U 342 X U 39 1_555 A N6 A 346 X A 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog54 A N6 A 356 X A 53 1_555 A N7 A 387 X A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog55 A N7 A 356 X A 53 1_555 A N6 A 387 X A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog56 A N6 A 359 X A 56 1_555 A N3 G 386 X G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog57 A N7 A 359 X A 56 1_555 A N2 G 386 X G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N3 C 360 X C 57 1_555 A N1 G 385 X G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A N4 C 360 X C 57 1_555 A O6 G 385 X G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A O2 C 360 X C 57 1_555 A N2 G 385 X G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N3 C 361 X C 58 1_555 A N1 G 384 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A N4 C 361 X C 58 1_555 A O6 G 384 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 A O2 C 361 X C 58 1_555 A N2 G 384 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A N3 U 362 X U 59 1_555 A N1 A 383 X A 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A O4 U 362 X U 59 1_555 A N6 A 383 X A 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog66 A N1 G 363 X G 60 1_555 A O6 G 381 X G 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog67 A N2 G 363 X G 60 1_555 A N7 G 381 X G 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog68 A N6 A 364 X A 61 1_555 A O2 C 380 X C 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A N3 C 366 X C 63 1_555 A N1 G 379 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N4 C 366 X C 63 1_555 A O6 G 379 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A O2 C 366 X C 63 1_555 A N2 G 379 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A N3 U 367 X U 64 1_555 A N1 A 378 X A 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 A O4 U 367 X U 64 1_555 A N6 A 378 X A 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A N1 G 368 X G 65 1_555 A N3 C 377 X C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N2 G 368 X G 65 1_555 A O2 C 377 X C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 A O6 G 368 X G 65 1_555 A N4 C 377 X C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A N1 G 369 X G 66 1_555 A N3 C 376 X C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A N2 G 369 X G 66 1_555 A O2 C 376 X C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A O6 G 369 X G 66 1_555 A N4 C 376 X C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9C6K _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG X 1 201 101 MG MG . C 2 MG X 1 202 102 MG MG . D 3 TPP X 1 203 100 TPP TPP . E 2 MG X 1 204 1 MG MG . F 2 MG X 1 205 2 MG MG . G 2 MG X 1 206 3 MG MG . H 2 MG X 1 207 4 MG MG . I 4 NA X 1 208 1 NA NA . J 4 NA X 1 209 2 NA NA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 154.901 _atom_site.Cartn_y 155.636 _atom_site.Cartn_z 170.906 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 85.39 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 207 _atom_site.auth_asym_id X _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 1022 _model_server_stats.encode_time_ms 12 _model_server_stats.element_count 1 #