data_9CMO # _model_server_result.job_id Eov9uXGSIkJNWYFYxoBP0Q _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 01:10:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9cmo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":602}' # _entry.id 9CMO # _exptl.entry_id 9CMO _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9CMO _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9CMO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 D SG CYS 60 Z CYS 17 1_555 D SG CYS 65 Z CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 D SG CYS 90 Z CYS 47 1_555 D SG CYS 103 Z CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 D SG CYS 108 Z CYS 65 1_555 D SG CYS 186 Z CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 129 Z CYS 86 1_555 D SG CYS 169 Z CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 D SG CYS 157 Z CYS 114 1_555 D SG CYS 181 Z CYS 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf6 D SG CYS 213 Z CYS 170 1_555 D SG CYS 291 Z CYS 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 234 Z CYS 191 1_555 D SG CYS 274 Z CYS 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 262 Z CYS 219 1_555 D SG CYS 286 Z CYS 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 D SG CYS 336 Z CYS 293 1_555 D SG CYS 482 Z CYS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 D SG CYS 391 Z CYS 348 1_555 D SG CYS 407 Z CYS 364 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 536 Z CYS 493 1_555 D SG CYS 550 Z CYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 564 Z CYS 521 1_555 D SG CYS 594 Z CYS 551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? covale ? covale1 D C LEU 48 Z LEU 5 1_555 D N CGU 49 Z CGU 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale2 D C CGU 49 Z CGU 6 1_555 D N CGU 50 Z CGU 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale3 D C CGU 50 Z CGU 7 1_555 D N VAL 51 Z VAL 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale4 D C LEU 56 Z LEU 13 1_555 D N CGU 57 Z CGU 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale5 D C CGU 57 Z CGU 14 1_555 D N ARG 58 Z ARG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale6 D C ARG 58 Z ARG 15 1_555 D N CGU 59 Z CGU 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale7 D C CGU 59 Z CGU 16 1_555 D N CYS 60 Z CYS 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale8 D C VAL 61 Z VAL 18 1_555 D N CGU 62 Z CGU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale9 D C CGU 62 Z CGU 19 1_555 D N CGU 63 Z CGU 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale10 D C CGU 63 Z CGU 20 1_555 D N THR 64 Z THR 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale11 D C TYR 67 Z TYR 24 1_555 D N CGU 68 Z CGU 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale12 D C CGU 68 Z CGU 25 1_555 D N CGU 69 Z CGU 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale13 D C CGU 69 Z CGU 26 1_555 D N ALA 70 Z ALA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale14 D C PHE 71 Z PHE 28 1_555 D N CGU 72 Z CGU 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale15 D C CGU 72 Z CGU 29 1_555 D N ALA 73 Z ALA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale16 D C LEU 74 Z LEU 31 1_555 D N CGU 75 Z CGU 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale17 D C CGU 75 Z CGU 32 1_555 D N SER 76 Z SER 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? metalc ? metalc1 C OG1 THR 431 L THR 431 1_555 E CA CA . L CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc2 D O ASN 45 Z ASN 2 1_555 I CA CA . Z CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc3 D OE11 CGU 49 Z CGU 6 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc4 D OE12 CGU 49 Z CGU 6 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc5 D OE11 CGU 49 Z CGU 6 1_555 I CA CA . Z CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc6 D OE22 CGU 49 Z CGU 6 1_555 I CA CA . Z CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc7 D OE12 CGU 50 Z CGU 7 1_555 F CA CA . Z CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc8 D OE11 CGU 50 Z CGU 7 1_555 G CA CA . Z CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc9 D OE12 CGU 50 Z CGU 7 1_555 G CA CA . Z CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.001 ? metalc ? metalc10 D OE11 CGU 50 Z CGU 7 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc11 D OE11 CGU 57 Z CGU 14 1_555 K CA CA . Z CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc12 D OE12 CGU 57 Z CGU 14 1_555 K CA CA . Z CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc13 D OE22 CGU 57 Z CGU 14 1_555 K CA CA . Z CA 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc14 D OE21 CGU 59 Z CGU 16 1_555 G CA CA . Z CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc15 D OE22 CGU 59 Z CGU 16 1_555 G CA CA . Z CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc16 D OE12 CGU 59 Z CGU 16 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc17 D OE22 CGU 59 Z CGU 16 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc18 D OE12 CGU 59 Z CGU 16 1_555 I CA CA . Z CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? metalc ? metalc19 D OE22 CGU 63 Z CGU 20 1_555 I CA CA . Z CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc20 D OE11 CGU 63 Z CGU 20 1_555 J CA CA . Z CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc21 D OE21 CGU 63 Z CGU 20 1_555 J CA CA . Z CA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc22 D OE12 CGU 69 Z CGU 26 1_555 G CA CA . Z CA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc23 D OE21 CGU 69 Z CGU 26 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc ? metalc24 D OE22 CGU 69 Z CGU 26 1_555 H CA CA . Z CA 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc25 D OE21 CGU 72 Z CGU 29 1_555 F CA CA . Z CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9CMO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 CA L 1 1001 903 CA CA . F 3 CA Z 1 601 904 CA CA . G 3 CA Z 1 602 905 CA CA . H 3 CA Z 1 603 906 CA CA . I 3 CA Z 1 604 907 CA CA . J 3 CA Z 1 605 908 CA CA . K 3 CA Z 1 606 909 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -5.59 _atom_site.Cartn_y -9.832 _atom_site.Cartn_z 45.072 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 9.37 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 602 _atom_site.auth_asym_id Z _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 24 _model_server_stats.query_time_ms 256 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #