data_9CW6
#
_model_server_result.job_id            czQhn16cRnmEl-3NfDuHYA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-08-02 17:07:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9cw6 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"DA","auth_seq_id":505}' 
#
_entry.id    9CW6 
#
_exptl.entry_id    9CW6 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              209.24 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.82 
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_cell.entry_id            9CW6 
_cell.length_a            59.486 
_cell.length_b            153.227 
_cell.length_c            108.848 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 9CW6 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,SA,TA 1 1 
C,D,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,UA,VA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 H N N 
? 5 I N N 
? 5 J N N 
? 5 T N N 
? 5 U N N 
? 5 Y N N 
? 5 CA N N 
? 5 DA N N 
? 5 NA N N 
? 5 OA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 338 A ASP 378 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.393 ? 
metalc ? metalc5 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? 
metalc ? metalc6 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc7 H N BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc8 H O6 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.036 ? 
metalc ? metalc9 H O8 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.182 ? 
metalc ? metalc10 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 SA O HOH . A HOH 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc11 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 SA O HOH . A HOH 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc12 N GD GD3 . A GD3 510 1_555 VA O HOH . D HOH 679 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? 
metalc ? metalc13 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? 
metalc ? metalc14 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc15 SA O HOH . A HOH 602 1_655 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? 
metalc ? metalc16 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 Q FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc17 B O THR 279 B THR 319 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc18 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? 
metalc ? metalc19 T O3 BTB . B BTB 504 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? 
metalc ? metalc20 T O4 BTB . B BTB 504 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? 
metalc ? metalc21 T N BTB . B BTB 504 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc22 T O6 BTB . B BTB 504 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? 
metalc ? metalc23 T O8 BTB . B BTB 504 1_555 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc24 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 TA O HOH . B HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? 
metalc ? metalc25 X GD GD3 . B GD3 508 1_555 TA O HOH . B HOH 659 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc26 TA O HOH . B HOH 655 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? 
metalc ? metalc27 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 JA ZN ZN . C ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc28 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 JA ZN ZN . C ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc29 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 Z FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? 
metalc ? metalc30 CA O3 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? 
metalc ? metalc31 CA O4 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc32 CA N BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc33 CA O6 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? 
metalc ? metalc34 CA O8 BTB . C BTB 504 1_555 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? 
metalc ? metalc35 IA GD GD3 . C GD3 510 1_555 UA O HOH . C HOH 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc36 JA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc37 JA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc38 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 KA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc39 D O THR 279 D THR 319 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc40 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc41 NA O3 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc42 NA O4 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc43 NA N BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? 
metalc ? metalc44 NA O6 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? 
metalc ? metalc45 NA O8 BTB . D BTB 504 1_555 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc46 RA GD GD3 . D GD3 508 1_555 VA O HOH . D HOH 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H19 N O5' 
_chem_comp.formula_weight    209.24 
_chem_comp.id                BTB 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'BIS-TRIS BUFFER' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 BTB sing 108 n n 
C1 C2 BTB sing 109 n n 
C1 H11 BTB sing 110 n n 
C1 H12 BTB sing 111 n n 
O1 HO1 BTB sing 112 n n 
C2 C3 BTB sing 113 n n 
C2 C4 BTB sing 114 n n 
C2 N BTB sing 115 n n 
C3 O3 BTB sing 116 n n 
C3 H31 BTB sing 117 n n 
C3 H32 BTB sing 118 n n 
O3 HO3 BTB sing 119 n n 
C4 O4 BTB sing 120 n n 
C4 H41 BTB sing 121 n n 
C4 H42 BTB sing 122 n n 
O4 HO4 BTB sing 123 n n 
N C5 BTB sing 124 n n 
N C7 BTB sing 125 n n 
C5 C6 BTB sing 126 n n 
C5 H51 BTB sing 127 n n 
C5 H52 BTB sing 128 n n 
C6 O6 BTB sing 129 n n 
C6 H61 BTB sing 130 n n 
C6 H62 BTB sing 131 n n 
O6 HO6 BTB sing 132 n n 
C7 C8 BTB sing 133 n n 
C7 H71 BTB sing 134 n n 
C7 H72 BTB sing 135 n n 
C8 O8 BTB sing 136 n n 
C8 H81 BTB sing 137 n n 
C8 H82 BTB sing 138 n n 
O8 HO8 BTB sing 139 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9CW6 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016811 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000239 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006526 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009188 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 H4B A 1 502 600 H4B BH4 . 
G 4 A1A0N A 1 503 800 A1A0N 3V7 . 
H 5 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 5 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 5 BTB A 1 506 872 BTB TRB . 
K 6 GOL A 1 507 880 GOL GOL . 
L 6 GOL A 1 508 881 GOL GOL . 
M 7 CL A 1 509 885 CL CL . 
N 8 GD3 A 1 510 890 GD3 GD . 
O 9 ZN A 1 511 900 ZN ZN . 
P 6 GOL A 1 512 881 GOL GOL . 
Q 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
R 3 H4B B 1 502 600 H4B BH4 . 
S 4 A1A0N B 1 503 800 A1A0N 3V7 . 
T 5 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
U 5 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
V 6 GOL B 1 506 881 GOL GOL . 
W 7 CL B 1 507 885 CL CL . 
X 8 GD3 B 1 508 890 GD3 GD . 
Y 5 BTB B 1 509 871 BTB TRB . 
Z 2 HEM C 1 501 500 HEM HEM . 
AA 3 H4B C 1 502 600 H4B BH4 . 
BA 4 A1A0N C 1 503 800 A1A0N 3V7 . 
CA 5 BTB C 1 504 870 BTB TRB . 
DA 5 BTB C 1 505 872 BTB TRB . 
EA 6 GOL C 1 506 880 GOL GOL . 
FA 6 GOL C 1 507 882 GOL GOL . 
GA 6 GOL C 1 508 883 GOL GOL . 
HA 7 CL C 1 509 885 CL CL . 
IA 8 GD3 C 1 510 890 GD3 GD . 
JA 9 ZN C 1 511 900 ZN ZN . 
KA 2 HEM D 1 501 500 HEM HEM . 
LA 3 H4B D 1 502 600 H4B BH4 . 
MA 4 A1A0N D 1 503 800 A1A0N 3V7 . 
NA 5 BTB D 1 504 870 BTB TRB . 
OA 5 BTB D 1 505 871 BTB TRB . 
PA 6 GOL D 1 506 880 GOL GOL . 
QA 7 CL D 1 507 885 CL CL . 
RA 8 GD3 D 1 508 890 GD3 GD . 
SA 10 HOH A 1 601 194 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 2 602 294 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 3 603 203 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 4 604 197 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 5 605 205 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 6 606 126 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 7 607 109 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 8 608 31 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 9 609 71 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 10 610 67 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 11 611 202 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 12 612 43 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 13 613 13 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 14 614 201 HOH HOH . 
SA 10 HOH A 15 615 60 HOH HOH . 
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HETATM 10 C C6 BTB . . . DA 5 65.83 -47.494 -184.24 1 92.6 ? C6 BTB 505 C 1 
HETATM 11 O O6 BTB . . . DA 5 66.506 -46.49 -185.007 1 89.37 ? O6 BTB 505 C 1 
HETATM 12 C C7 BTB . . . DA 5 65.935 -49.463 -186.07 1 104.99 ? C7 BTB 505 C 1 
HETATM 13 C C8 BTB . . . DA 5 66.384 -48.972 -187.441 1 103.92 ? C8 BTB 505 C 1 
HETATM 14 O O8 BTB . . . DA 5 65.282 -49.105 -188.344 1 107.6 ? O8 BTB 505 C 1 
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