data_9D7G # _model_server_result.job_id g737aVU4CIYb6LAjwkti3Q _model_server_result.datetime_utc '2025-07-01 15:38:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9d7g # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"UA","auth_seq_id":607}' # _entry.id 9D7G # _exptl.entry_id 9D7G _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 29 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9D7G _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9D7G _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 EA N N ? 5 FA N N ? 5 GA N N ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N ? 5 CB N N ? 5 DB N N ? 5 EB N N ? 5 FB N N ? 5 GB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n G NAG 1 G 1 NAG A 507 NAG 3 n G NAG 2 G 2 NAG A 508 NAG 3 n H NAG 1 H 1 NAG A 509 NAG 3 n H NAG 2 H 2 NAG A 510 NAG 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 511 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 512 NAG 4 n J NAG 1 J 1 NAG A 514 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG A 515 NAG 4 n J BMA 3 J 3 BMA A 516 BMA 3 n K NAG 1 K 1 NAG A 517 NAG 3 n K NAG 2 K 2 NAG A 518 NAG 3 n L NAG 1 L 1 NAG A 519 NAG 3 n L NAG 2 L 2 NAG A 520 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG A 522 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG A 523 NAG 3 n N NAG 1 N 1 NAG A 526 NAG 3 n N NAG 2 N 2 NAG A 527 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG C 506 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG C 507 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG C 508 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG C 509 NAG 4 n P BMA 3 P 3 BMA C 510 BMA 3 n Q NAG 1 Q 1 NAG C 511 NAG 3 n Q NAG 2 Q 2 NAG C 512 NAG 3 n R NAG 1 R 1 NAG C 513 NAG 3 n R NAG 2 R 2 NAG C 514 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG C 516 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG C 517 NAG 4 n S BMA 3 S 3 BMA C 518 BMA 3 n T NAG 1 T 1 NAG C 524 NAG 3 n T NAG 2 T 2 NAG C 525 NAG 3 n U NAG 1 U 1 NAG C 526 NAG 3 n U NAG 2 U 2 NAG C 527 NAG 3 n V NAG 1 V 1 NAG E 505 NAG 3 n V NAG 2 V 2 NAG E 506 NAG 3 n W NAG 1 W 1 NAG E 509 NAG 3 n W NAG 2 W 2 NAG E 510 NAG 3 n X NAG 1 X 1 NAG E 511 NAG 3 n X NAG 2 X 2 NAG E 512 NAG 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG E 514 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG E 515 NAG 4 n Y BMA 3 Y 3 BMA E 516 BMA 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG E 517 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG E 518 NAG 4 n Z BMA 3 Z 3 BMA E 519 BMA 3 n AA NAG 1 a 1 NAG E 520 NAG 3 n AA NAG 2 a 2 NAG E 521 NAG 3 n BA NAG 1 b 1 NAG E 523 NAG 3 n BA NAG 2 b 2 NAG E 524 NAG 4 n CA NAG 1 c 1 NAG E 526 NAG 4 n CA NAG 2 c 2 NAG E 527 NAG 4 n CA BMA 3 c 3 BMA E 528 BMA 4 n DA NAG 1 d 1 NAG E 529 NAG 4 n DA NAG 2 d 2 NAG E 530 NAG 4 n DA BMA 3 d 3 BMA E 531 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 48 A CYS 54 1_555 A SG CYS 68 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 113 A CYS 119 1_555 A SG CYS 199 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 120 A CYS 126 1_555 A SG CYS 190 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 125 A CYS 131 1_555 A SG CYS 143 A CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 195 A CYS 201 1_555 A SG CYS 425 A CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 212 A CYS 218 1_555 A SG CYS 241 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 222 A CYS 228 1_555 A SG CYS 233 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 290 A CYS 296 1_555 A SG CYS 371 A CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 290 A CYS 296 1_555 A SG CYS 437 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 371 A CYS 378 1_555 A SG CYS 437 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 378 A CYS 385 1_555 A SG CYS 410 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 493 A CYS 501 1_555 B SG CYS 103 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 96 B CYS 598 1_555 B SG CYS 102 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 48 C CYS 54 1_555 C SG CYS 68 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 C SG CYS 113 C CYS 119 1_555 C SG CYS 199 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf16 C SG CYS 120 C CYS 126 1_555 C SG CYS 190 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 125 C CYS 131 1_555 C SG CYS 143 C CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 195 C CYS 201 1_555 C SG CYS 425 C CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 212 C CYS 218 1_555 C SG CYS 241 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 290 C CYS 296 1_555 C SG CYS 324 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 371 C CYS 378 1_555 C SG CYS 437 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 378 C CYS 385 1_555 C SG CYS 410 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf23 E SG CYS 113 E CYS 119 1_555 E SG CYS 199 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 E SG CYS 120 E CYS 126 1_555 E SG CYS 190 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf25 E SG CYS 125 E CYS 131 1_555 E SG CYS 143 E CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf26 E SG CYS 195 E CYS 201 1_555 E SG CYS 425 E CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf27 E SG CYS 222 E CYS 228 1_555 E SG CYS 233 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 E SG CYS 290 E CYS 296 1_555 E SG CYS 324 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf29 E SG CYS 324 E CYS 331 1_555 E SG CYS 410 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf30 E SG CYS 371 E CYS 378 1_555 E SG CYS 437 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf31 E SG CYS 378 E CYS 385 1_555 E SG CYS 410 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf32 E SG CYS 493 E CYS 501 1_555 F SG CYS 103 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 F SG CYS 96 F CYS 598 1_555 F SG CYS 102 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 82 A ASN 88 1_555 EA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 127 A ASN 133 1_555 FA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 142 A ASN 148 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 146 A ASN 152 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 191 A ASN 197 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 228 A ASN 234 1_555 GA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 256 A ASN 262 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 270 A ASN 276 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 289 A ASN 295 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 295 A ASN 301 1_555 HA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 325 A ASN 332 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 348 A ASN 355 1_555 IA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale13 A ND2 ASN 356 A ASN 363 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 A ND2 ASN 379 A ASN 386 1_555 JA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale15 A ND2 ASN 385 A ASN 392 1_555 KA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale16 A ND2 ASN 440 A ASN 448 1_555 LA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale17 B ND2 ASN 109 B ASN 611 1_555 MA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale18 B ND2 ASN 135 B ASN 637 1_555 NA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale19 C ND2 ASN 82 C ASN 88 1_555 OA C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale20 C ND2 ASN 127 C ASN 133 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale21 C ND2 ASN 142 C ASN 148 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale22 C ND2 ASN 146 C ASN 152 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 C ND2 ASN 191 C ASN 197 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale24 C ND2 ASN 228 C ASN 234 1_555 PA C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale25 C ND2 ASN 256 C ASN 262 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale26 C ND2 ASN 270 C ASN 276 1_555 QA C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale27 C ND2 ASN 289 C ASN 295 1_555 RA C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale28 C ND2 ASN 295 C ASN 301 1_555 SA C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale29 C ND2 ASN 325 C ASN 332 1_555 TA C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale30 C ND2 ASN 348 C ASN 355 1_555 UA C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale31 C ND2 ASN 356 C ASN 363 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale32 C ND2 ASN 379 C ASN 386 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 C ND2 ASN 385 C ASN 392 1_555 VA C1 NAG . C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale34 C ND2 ASN 440 C ASN 448 1_555 WA C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale35 D ND2 ASN 135 D ASN 637 1_555 XA C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale36 E ND2 ASN 82 E ASN 88 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale37 E ND2 ASN 127 E ASN 133 1_555 YA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 E ND2 ASN 131 E ASN 137 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale39 E ND2 ASN 142 E ASN 148 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale40 E ND2 ASN 146 E ASN 152 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale41 E ND2 ASN 228 E ASN 234 1_555 AB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale42 E ND2 ASN 256 E ASN 262 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale43 E ND2 ASN 270 E ASN 276 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale44 E ND2 ASN 289 E ASN 295 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? covale ? covale45 E ND2 ASN 295 E ASN 301 1_555 BB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale46 E ND2 ASN 325 E ASN 332 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale47 E ND2 ASN 348 E ASN 355 1_555 CB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale48 E ND2 ASN 356 E ASN 363 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale49 E ND2 ASN 379 E ASN 386 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale50 E ND2 ASN 385 E ASN 392 1_555 DB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale51 E ND2 ASN 440 E ASN 448 1_555 EB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale52 F ND2 ASN 109 F ASN 611 1_555 FB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale53 F ND2 ASN 135 F ASN 637 1_555 GB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale54 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale55 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? covale ? covale56 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale57 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale59 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale60 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale61 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale62 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale63 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale64 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale65 P O4 NAG . P NAG 2 1_555 P C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale66 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale67 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale68 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale69 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale70 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale71 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale72 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale73 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale74 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale75 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale76 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale77 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale78 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale79 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale80 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale81 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale82 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale83 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale84 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9D7G _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code EA 5 NAG A 1 601 505 NAG NAG . FA 5 NAG A 1 602 506 NAG NAG . GA 5 NAG A 1 603 513 NAG NAG . HA 5 NAG A 1 604 521 NAG NAG . IA 5 NAG A 1 605 525 NAG NAG . JA 5 NAG A 1 606 528 NAG NAG . KA 5 NAG A 1 607 529 NAG NAG . LA 5 NAG A 1 608 530 NAG NAG . MA 5 NAG B 1 701 664 NAG NAG . NA 5 NAG B 1 702 665 NAG NAG . OA 5 NAG C 1 601 505 NAG NAG . PA 5 NAG C 1 602 515 NAG NAG . QA 5 NAG C 1 603 519 NAG NAG . RA 5 NAG C 1 604 520 NAG NAG . SA 5 NAG C 1 605 521 NAG NAG . TA 5 NAG C 1 606 522 NAG NAG . UA 5 NAG C 1 607 523 NAG NAG . VA 5 NAG C 1 608 528 NAG NAG . WA 5 NAG C 1 609 529 NAG NAG . XA 5 NAG D 1 701 664 NAG NAG . YA 5 NAG E 1 601 507 NAG NAG . ZA 5 NAG E 1 602 508 NAG NAG . AB 5 NAG E 1 603 513 NAG NAG . BB 5 NAG E 1 604 522 NAG NAG . CB 5 NAG E 1 605 525 NAG NAG . DB 5 NAG E 1 606 532 NAG NAG . EB 5 NAG E 1 607 533 NAG NAG . FB 5 NAG F 1 701 664 NAG NAG . GB 5 NAG F 1 702 665 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . UA 5 216.22 160.223 217.262 1 127.53 ? C1 NAG 607 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . UA 5 216.309 161.253 218.397 1 127.53 ? C2 NAG 607 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . UA 5 217.102 162.459 217.89 1 127.53 ? C3 NAG 607 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . UA 5 218.466 162.042 217.334 1 127.53 ? C4 NAG 607 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . UA 5 218.296 160.898 216.318 1 127.53 ? C5 NAG 607 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . UA 5 219.605 160.33 215.814 1 127.53 ? C6 NAG 607 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . UA 5 214.419 161.131 219.969 1 127.53 ? C7 NAG 607 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . UA 5 213.039 161.664 220.267 1 127.53 ? C8 NAG 607 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . UA 5 214.999 161.628 218.86 1 127.53 ? N2 NAG 607 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . UA 5 217.221 163.372 218.947 1 127.53 ? O3 NAG 607 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . UA 5 219.044 163.183 216.742 1 127.53 ? O4 NAG 607 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . UA 5 217.532 159.848 216.894 1 127.53 ? O5 NAG 607 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . UA 5 220.384 159.897 216.904 1 127.53 ? O6 NAG 607 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . UA 5 214.953 160.304 220.693 1 127.53 ? O7 NAG 607 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 24 _model_server_stats.query_time_ms 462 _model_server_stats.encode_time_ms 19 _model_server_stats.element_count 14 #