data_9DQL # _model_server_result.job_id RgNglWYIL3hiTPSZW2oLJQ _model_server_result.datetime_utc '2025-07-12 17:09:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9dql # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"JA","auth_seq_id":301}' # _entry.id 9DQL # _exptl.entry_id 9DQL _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 384.237 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description N-[(1R)-1-(DIHYDROXYBORYL)-3-METHYLBUTYL]-N-(PYRAZIN-2-YLCARBONYL)-L-PHENYLALANINAMIDE _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 97.87 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9DQL _cell.length_a 122.19 _cell.length_b 93.88 _cell.length_c 133.72 _cell.Z_PDB 28 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9DQL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall 'P 2yb' _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 14-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 O N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 Y N N ? 2 AA N N ? 2 CA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N ? 2 IA N N ? 2 JA N N # _chem_comp.formula 'C19 H25 B N4 O4' _chem_comp.formula_weight 384.237 _chem_comp.id BO2 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name N-[(1R)-1-(DIHYDROXYBORYL)-3-METHYLBUTYL]-N-(PYRAZIN-2-YLCARBONYL)-L-PHENYLALANINAMIDE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms BORTEZOMIB # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 BO2 sing 70 n y N1 C6 BO2 doub 71 n y C2 C3 BO2 doub 72 n y C2 C7 BO2 sing 73 n n C3 N4 BO2 sing 74 n y C3 H3 BO2 sing 75 n n N4 C5 BO2 doub 76 n y C5 C6 BO2 sing 77 n y C5 H5 BO2 sing 78 n n C6 H6 BO2 sing 79 n n C7 O8 BO2 doub 80 n n C7 N9 BO2 sing 81 n n N9 C10 BO2 sing 82 n n N9 HN9 BO2 sing 83 n n C10 C11 BO2 sing 84 n n C10 C18 BO2 sing 85 n n C10 H10 BO2 sing 86 n n C11 C12 BO2 sing 87 n n C11 H111 BO2 sing 88 n n C11 H112 BO2 sing 89 n n C12 C13 BO2 sing 90 n y C12 C17 BO2 doub 91 n y C13 C14 BO2 doub 92 n y C13 H13 BO2 sing 93 n n C14 C15 BO2 sing 94 n y C14 H14 BO2 sing 95 n n C15 C16 BO2 doub 96 n y C15 H15 BO2 sing 97 n n C16 C17 BO2 sing 98 n y C16 H16 BO2 sing 99 n n C17 H17 BO2 sing 100 n n C18 O19 BO2 doub 101 n n C18 N20 BO2 sing 102 n n N20 C21 BO2 sing 103 n n N20 H20 BO2 sing 104 n n C21 C22 BO2 sing 105 n n C21 B26 BO2 sing 106 n n C21 H21 BO2 sing 107 n n C22 C23 BO2 sing 108 n n C22 H221 BO2 sing 109 n n C22 H222 BO2 sing 110 n n C23 C24 BO2 sing 111 n n C23 C25 BO2 sing 112 n n C23 H23 BO2 sing 113 n n C24 H241 BO2 sing 114 n n C24 H242 BO2 sing 115 n n C24 H243 BO2 sing 116 n n C25 H251 BO2 sing 117 n n C25 H252 BO2 sing 118 n n C25 H253 BO2 sing 119 n n B26 O27 BO2 sing 120 n n B26 O28 BO2 sing 121 n n O27 H27 BO2 sing 122 n n O28 H28 BO2 sing 123 n n # _atom_sites.entry_id 9DQL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008184 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001131 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010652 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007549 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code O 2 BO2 A 1 301 301 BO2 BO2 . P 3 CL A 1 302 2 CL CL . Q 3 CL A 1 303 7 CL CL . R 2 BO2 B 1 301 301 BO2 BO2 . S 2 BO2 C 1 301 301 BO2 BO2 . T 3 CL C 1 302 3 CL CL . U 2 BO2 D 1 301 301 BO2 BO2 . V 2 BO2 E 1 301 301 BO2 BO2 . W 2 BO2 F 1 301 301 BO2 BO2 . X 3 CL F 1 302 8 CL CL . Y 2 BO2 G 1 301 301 BO2 BO2 . Z 3 CL G 1 302 9 CL CL . AA 2 BO2 H 1 301 301 BO2 BO2 . BA 3 CL H 1 302 4 CL CL . CA 2 BO2 I 1 301 301 BO2 BO2 . DA 3 CL I 1 302 5 CL CL . EA 2 BO2 J 1 301 301 BO2 BO2 . FA 2 BO2 K 1 301 301 BO2 BO2 . GA 2 BO2 L 1 301 301 BO2 BO2 . HA 3 CL L 1 302 6 CL CL . IA 2 BO2 M 1 301 301 BO2 BO2 . JA 2 BO2 N 1 301 301 BO2 BO2 . KA 3 CL N 1 302 1 CL CL . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 BO2 . . . JA 2 -66.376 4.017 -13.73 0.86 123.11 ? N1 BO2 301 N 1 HETATM 2 C C2 BO2 . . . JA 2 -65.372 4.083 -14.586 0.86 119.01 ? C2 BO2 301 N 1 HETATM 3 C C3 BO2 . . . JA 2 -64.368 3.13 -14.534 0.86 109.17 ? C3 BO2 301 N 1 HETATM 4 N N4 BO2 . . . JA 2 -64.41 2.171 -13.626 0.86 121.54 ? N4 BO2 301 N 1 HETATM 5 C C5 BO2 . . . JA 2 -65.411 2.106 -12.765 0.86 120.92 ? C5 BO2 301 N 1 HETATM 6 C C6 BO2 . . . JA 2 -66.42 3.055 -12.822 0.86 117.9 ? C6 BO2 301 N 1 HETATM 7 C C7 BO2 . . . JA 2 -65.322 5.181 -15.658 0.86 108.48 ? C7 BO2 301 N 1 HETATM 8 O O8 BO2 . . . JA 2 -64.505 5.114 -16.512 0.86 107.29 ? O8 BO2 301 N 1 HETATM 9 N N9 BO2 . . . JA 2 -66.262 6.293 -15.695 0.86 116.99 ? N9 BO2 301 N 1 HETATM 10 C C10 BO2 . . . JA 2 -66.149 7.267 -16.767 0.86 115.92 ? C10 BO2 301 N 1 HETATM 11 C C11 BO2 . . . JA 2 -67.482 7.392 -17.508 0.86 119.74 ? C11 BO2 301 N 1 HETATM 12 C C12 BO2 . . . JA 2 -68.022 5.996 -17.816 0.86 116.04 ? C12 BO2 301 N 1 HETATM 13 C C13 BO2 . . . JA 2 -67.196 5.062 -18.417 0.86 106.42 ? C13 BO2 301 N 1 HETATM 14 C C14 BO2 . . . JA 2 -67.672 3.792 -18.694 0.86 118.95 ? C14 BO2 301 N 1 HETATM 15 C C15 BO2 . . . JA 2 -68.98 3.46 -18.376 0.86 137.55 ? C15 BO2 301 N 1 HETATM 16 C C16 BO2 . . . JA 2 -69.809 4.395 -17.778 0.86 147.22 ? C16 BO2 301 N 1 HETATM 17 C C17 BO2 . . . JA 2 -69.33 5.664 -17.498 0.86 137.33 ? C17 BO2 301 N 1 HETATM 18 C C18 BO2 . . . JA 2 -65.706 8.638 -16.264 0.86 115.23 ? C18 BO2 301 N 1 HETATM 19 O O19 BO2 . . . JA 2 -65.514 8.785 -15.102 0.86 121.46 ? O19 BO2 301 N 1 HETATM 20 N N20 BO2 . . . JA 2 -65.558 9.725 -17.235 0.86 115.95 ? N20 BO2 301 N 1 HETATM 21 C C21 BO2 . . . JA 2 -65.129 11.065 -16.869 0.86 109.8 ? C21 BO2 301 N 1 HETATM 22 C C22 BO2 . . . JA 2 -63.681 10.825 -16.477 0.86 106.17 ? C22 BO2 301 N 1 HETATM 23 C C23 BO2 . . . JA 2 -63.146 12 -15.686 0.86 106.63 ? C23 BO2 301 N 1 HETATM 24 C C24 BO2 . . . JA 2 -61.804 11.553 -15.117 0.86 95.18 ? C24 BO2 301 N 1 HETATM 25 C C25 BO2 . . . JA 2 -64.105 12.237 -14.527 0.86 99.68 ? C25 BO2 301 N 1 HETATM 26 B B26 BO2 . . . JA 2 -65.178 11.995 -18.144 0.86 105.83 ? B26 BO2 301 N 1 HETATM 27 O O27 BO2 . . . JA 2 -63.783 11.874 -19.057 0.86 118.04 ? O27 BO2 301 N 1 HETATM 28 O O28 BO2 . . . JA 2 -66.378 11.468 -19.146 0.86 104.98 ? O28 BO2 301 N 1 # _model_server_stats.io_time_ms 46 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 36 _model_server_stats.query_time_ms 248 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 28 #