data_9ETD
#
_model_server_result.job_id            o-WubZq2sXFrR9GIvbwbjQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 01:32:19' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9etd 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    9ETD 
#
_exptl.entry_id    9ETD 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              392.572 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ISO-URSODEOXYCHOLIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          95.9 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            9ETD 
_cell.length_a            36.335 
_cell.length_b            60.631 
_cell.length_c            61.672 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 9ETD 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,E 1 1 
B,D,F 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
#
_chem_comp.formula           'C24 H40 O4' 
_chem_comp.formula_weight    392.572 
_chem_comp.id                IU5 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ISO-URSODEOXYCHOLIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C10 IU5 sing 173 n n 
C1 C2 IU5 sing 174 n n 
C1 HC11 IU5 sing 175 n n 
C1 HC12 IU5 sing 176 n n 
C10 C19 IU5 sing 177 n n 
C10 C5 IU5 sing 178 n n 
C10 C9 IU5 sing 179 n n 
C11 C12 IU5 sing 180 n n 
C11 C9 IU5 sing 181 n n 
C11 H111 IU5 sing 182 n n 
C11 H112 IU5 sing 183 n n 
C12 C13 IU5 sing 184 n n 
C12 H121 IU5 sing 185 n n 
C12 H122 IU5 sing 186 n n 
C13 C14 IU5 sing 187 n n 
C13 C17 IU5 sing 188 n n 
C13 C18 IU5 sing 189 n n 
C14 C15 IU5 sing 190 n n 
C14 C8 IU5 sing 191 n n 
C14 H141 IU5 sing 192 n n 
C15 C16 IU5 sing 193 n n 
C15 H151 IU5 sing 194 n n 
C15 H152 IU5 sing 195 n n 
C16 C17 IU5 sing 196 n n 
C16 H161 IU5 sing 197 n n 
C16 H162 IU5 sing 198 n n 
C17 C20 IU5 sing 199 n n 
C17 H171 IU5 sing 200 n n 
C18 H181 IU5 sing 201 n n 
C18 H182 IU5 sing 202 n n 
C18 H183 IU5 sing 203 n n 
C19 H191 IU5 sing 204 n n 
C19 H192 IU5 sing 205 n n 
C19 H193 IU5 sing 206 n n 
O1A C7 IU5 sing 207 n n 
O1A HOA1 IU5 sing 208 n n 
O1B C3 IU5 sing 209 n n 
O1B HOB1 IU5 sing 210 n n 
C2 C3 IU5 sing 211 n n 
C2 HC21 IU5 sing 212 n n 
C2 HC22 IU5 sing 213 n n 
C20 C21 IU5 sing 214 n n 
C20 C22 IU5 sing 215 n n 
C20 H201 IU5 sing 216 n n 
C21 H211 IU5 sing 217 n n 
C21 H212 IU5 sing 218 n n 
C21 H213 IU5 sing 219 n n 
C22 C23 IU5 sing 220 n n 
C22 H221 IU5 sing 221 n n 
C22 H222 IU5 sing 222 n n 
C23 C24 IU5 sing 223 n n 
C23 H231 IU5 sing 224 n n 
C23 H232 IU5 sing 225 n n 
C24 O4 IU5 doub 226 n n 
C24 O4A IU5 sing 227 n n 
C3 C4 IU5 sing 228 n n 
C3 HC31 IU5 sing 229 n n 
C4 C5 IU5 sing 230 n n 
C4 HC41 IU5 sing 231 n n 
C4 HC42 IU5 sing 232 n n 
O4A HOA4 IU5 sing 233 n n 
C5 C6 IU5 sing 234 n n 
C5 HC51 IU5 sing 235 n n 
C6 C7 IU5 sing 236 n n 
C6 HC61 IU5 sing 237 n n 
C6 HC62 IU5 sing 238 n n 
C7 C8 IU5 sing 239 n n 
C7 HC71 IU5 sing 240 n n 
C8 C9 IU5 sing 241 n n 
C8 HC81 IU5 sing 242 n n 
C9 HC91 IU5 sing 243 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9ETD 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.027522 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.002846 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.016493 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.016301 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 IU5 A 1 201 201 IU5 IU5 . 
D 2 IU5 B 1 201 201 IU5 IU5 . 
E 3 HOH A 1 301 34 HOH HOH . 
E 3 HOH A 2 302 31 HOH HOH . 
E 3 HOH A 3 303 18 HOH HOH . 
E 3 HOH A 4 304 7 HOH HOH . 
E 3 HOH A 5 305 1 HOH HOH . 
E 3 HOH A 6 306 32 HOH HOH . 
E 3 HOH A 7 307 3 HOH HOH . 
E 3 HOH A 8 308 28 HOH HOH . 
E 3 HOH A 9 309 33 HOH HOH . 
F 3 HOH B 1 301 20 HOH HOH . 
F 3 HOH B 2 302 9 HOH HOH . 
F 3 HOH B 3 303 36 HOH HOH . 
F 3 HOH B 4 304 27 HOH HOH . 
F 3 HOH B 5 305 6 HOH HOH . 
F 3 HOH B 6 306 21 HOH HOH . 
F 3 HOH B 7 307 25 HOH HOH . 
F 3 HOH B 8 308 24 HOH HOH . 
F 3 HOH B 9 309 16 HOH HOH . 
F 3 HOH B 10 310 8 HOH HOH . 
F 3 HOH B 11 311 14 HOH HOH . 
F 3 HOH B 12 312 11 HOH HOH . 
F 3 HOH B 13 313 38 HOH HOH . 
F 3 HOH B 14 314 15 HOH HOH . 
F 3 HOH B 15 315 12 HOH HOH . 
F 3 HOH B 16 316 5 HOH HOH . 
F 3 HOH B 17 317 37 HOH HOH . 
F 3 HOH B 18 318 26 HOH HOH . 
F 3 HOH B 19 319 22 HOH HOH . 
F 3 HOH B 20 320 30 HOH HOH . 
F 3 HOH B 21 321 35 HOH HOH . 
F 3 HOH B 22 322 29 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 IU5 . . . D 2 18.012 6.366 1.906 0.8 64.78 ? C1 IU5 201 B 1 
HETATM 2 C C10 IU5 . . . D 2 16.928 7.458 2.048 0.8 70.64 ? C10 IU5 201 B 1 
HETATM 3 C C11 IU5 . . . D 2 16.5 6.651 4.517 0.8 61.35 ? C11 IU5 201 B 1 
HETATM 4 C C12 IU5 . . . D 2 15.506 6.506 5.69 0.8 68.13 ? C12 IU5 201 B 1 
HETATM 5 C C13 IU5 . . . D 2 14.604 7.732 5.897 0.8 76.83 ? C13 IU5 201 B 1 
HETATM 6 C C14 IU5 . . . D 2 13.946 7.971 4.522 0.8 79.4 ? C14 IU5 201 B 1 
HETATM 7 C C15 IU5 . . . D 2 12.794 8.91 4.804 0.8 84.17 ? C15 IU5 201 B 1 
HETATM 8 C C16 IU5 . . . D 2 12.153 8.19 5.996 0.8 78.44 ? C16 IU5 201 B 1 
HETATM 9 C C17 IU5 . . . D 2 13.32 7.546 6.798 0.8 78.04 ? C17 IU5 201 B 1 
HETATM 10 C C18 IU5 . . . D 2 15.458 8.929 6.356 0.8 70.92 ? C18 IU5 201 B 1 
HETATM 11 C C19 IU5 . . . D 2 17.678 8.776 2.347 0.8 74.5 ? C19 IU5 201 B 1 
HETATM 12 O O1A IU5 . . . D 2 13.591 9.776 1.832 0.8 90.63 ? O1A IU5 201 B 1 
HETATM 13 O O1B IU5 . . . D 2 16.577 4.075 -0.644 0.8 68.43 ? O1B IU5 201 B 1 
HETATM 14 C C2 IU5 . . . D 2 17.539 5.009 1.385 0.8 74.79 ? C2 IU5 201 B 1 
HETATM 15 C C20 IU5 . . . D 2 13.199 7.992 8.276 0.8 79.67 ? C20 IU5 201 B 1 
HETATM 16 C C21 IU5 . . . D 2 12.945 9.49 8.468 0.8 76.78 ? C21 IU5 201 B 1 
HETATM 17 C C22 IU5 . . . D 2 14.335 7.476 9.177 0.8 70.51 ? C22 IU5 201 B 1 
HETATM 18 C C23 IU5 . . . D 2 14.036 7.586 10.678 0.8 70.51 ? C23 IU5 201 B 1 
HETATM 19 C C24 IU5 . . . D 2 14.46 8.861 11.396 0.8 78.8 ? C24 IU5 201 B 1 
HETATM 20 C C3 IU5 . . . D 2 16.45 5.127 0.337 0.8 74.97 ? C3 IU5 201 B 1 
HETATM 21 C C4 IU5 . . . D 2 16.504 6.492 -0.314 0.8 66.27 ? C4 IU5 201 B 1 
HETATM 22 O O4 IU5 . . . D 2 15.155 8.743 12.446 0.8 67.71 ? O4 IU5 201 B 1 
HETATM 23 O O4A IU5 . . . D 2 14.093 9.973 10.916 0.8 68.76 ? O4A IU5 201 B 1 
HETATM 24 C C5 IU5 . . . D 2 16.187 7.617 0.685 0.8 68.89 ? C5 IU5 201 B 1 
HETATM 25 C C6 IU5 . . . D 2 14.654 7.817 0.791 0.8 81.62 ? C6 IU5 201 B 1 
HETATM 26 C C7 IU5 . . . D 2 14.006 8.408 2.048 0.8 89.78 ? C7 IU5 201 B 1 
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HETATM 28 C C9 IU5 . . . D 2 15.896 7.115 3.174 0.8 70.82 ? C9 IU5 201 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              41 
_model_server_stats.parse_time_ms           22 
_model_server_stats.create_model_time_ms    6 
_model_server_stats.query_time_ms           356 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           28 
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