data_9G0P
#
_model_server_result.job_id            1EaA0u0PT5UgtAZmZ3FORg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-18 03:57:39' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9g0p 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    9G0P 
#
_exptl.entry_id    9G0P 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    12-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 S N N 
? 4 U N N 
? 4 X N N 
? 4 Z N N 
? 4 BA N N 
? 4 DA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 G OE1 GLU 70 a GLU 70 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc2 S O1G GTP . a GTP 501 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? 
metalc ? metalc3 S O1B GTP . a GTP 501 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc4 H OE1 GLU 70 b GLU 70 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc5 U O1G GTP . b GTP 501 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? 
metalc ? metalc6 U O1B GTP . b GTP 501 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc7 I OE1 GLU 70 c GLU 70 1_555 W MG MG . c MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc8 W MG MG . c MG 501 1_555 X O1G GTP . c GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? 
metalc ? metalc9 W MG MG . c MG 501 1_555 X O1B GTP . c GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc10 J OE1 GLU 70 d GLU 70 1_555 Y MG MG . d MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc11 Y MG MG . d MG 501 1_555 Z O1G GTP . d GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.763 ? 
metalc ? metalc12 Y MG MG . d MG 501 1_555 Z O1B GTP . d GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc13 K OE1 GLU 70 e GLU 70 1_555 AA MG MG . e MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc14 AA MG MG . e MG 501 1_555 BA O1G GTP . e GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? 
metalc ? metalc15 AA MG MG . e MG 501 1_555 BA O1B GTP . e GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc16 L OE1 GLU 70 f GLU 70 1_555 CA MG MG . f MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc17 CA MG MG . f MG 501 1_555 DA O1G GTP . f GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.763 ? 
metalc ? metalc18 CA MG MG . f MG 501 1_555 DA O1B GTP . f GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9G0P 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 GDP A 1 501 501 GDP GDP . 
N 3 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
O 3 GDP C 1 501 501 GDP GDP . 
P 3 GDP D 1 501 501 GDP GDP . 
Q 3 GDP E 1 501 501 GDP GDP . 
R 3 GDP F 1 501 501 GDP GDP . 
S 4 GTP a 1 501 501 GTP GTP . 
T 5 MG a 1 502 502 MG MG . 
U 4 GTP b 1 501 501 GTP GTP . 
V 5 MG b 1 502 502 MG MG . 
W 5 MG c 1 501 502 MG MG . 
X 4 GTP c 1 502 501 GTP GTP . 
Y 5 MG d 1 501 502 MG MG . 
Z 4 GTP d 1 502 501 GTP GTP . 
AA 5 MG e 1 501 502 MG MG . 
BA 4 GTP e 1 502 501 GTP GTP . 
CA 5 MG f 1 501 502 MG MG . 
DA 4 GTP f 1 502 501 GTP GTP . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . Z 4 128.349 146.083 227.399 1 23.36 ? PG GTP 502 d 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . Z 4 129.351 147.082 226.875 1 21.13 ? O1G GTP 502 d 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . Z 4 128.75 144.691 226.984 1 27.02 ? O2G GTP 502 d 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . Z 4 126.985 146.382 226.836 1 20.83 ? O3G GTP 502 d 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . Z 4 128.296 146.186 229.002 1 15.37 ? O3B GTP 502 d 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . Z 4 128.694 147.562 229.728 1 19.81 ? PB GTP 502 d 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . Z 4 130.036 148.035 229.216 1 27.07 ? O1B GTP 502 d 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . Z 4 128.71 147.379 231.224 1 18.98 ? O2B GTP 502 d 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . Z 4 127.547 148.602 229.304 1 19.09 ? O3A GTP 502 d 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . Z 4 127.309 149.938 230.167 1 20.07 ? PA GTP 502 d 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . Z 4 127.338 151.133 229.245 1 17.98 ? O1A GTP 502 d 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . Z 4 128.327 150.079 231.27 1 17.19 ? O2A GTP 502 d 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . Z 4 125.828 149.798 230.765 1 21.48 ? O5' GTP 502 d 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . Z 4 124.879 150.779 230.426 1 18.35 ? C5' GTP 502 d 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . Z 4 124.829 151.883 231.474 1 13.87 ? C4' GTP 502 d 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . Z 4 126.096 152.218 232.005 1 12.71 ? O4' GTP 502 d 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . Z 4 124.325 153.173 230.866 1 13.23 ? C3' GTP 502 d 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . Z 4 122.925 153.244 230.974 1 15.61 ? O3' GTP 502 d 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . Z 4 124.997 154.257 231.681 1 12.31 ? C2' GTP 502 d 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . Z 4 124.052 154.89 232.51 1 19.25 ? O2' GTP 502 d 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . Z 4 126.046 153.539 232.519 1 12.66 ? C1' GTP 502 d 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . Z 4 127.354 154.218 232.414 1 13.2 ? N9 GTP 502 d 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . Z 4 128.265 154.058 231.41 1 12.53 ? C8 GTP 502 d 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . Z 4 129.338 154.836 231.668 1 10.54 ? N7 GTP 502 d 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . Z 4 129.137 155.488 232.829 1 11.66 ? C5 GTP 502 d 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . Z 4 129.917 156.394 233.537 1 12.53 ? C6 GTP 502 d 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . Z 4 131.017 156.731 233.112 1 14.96 ? O6 GTP 502 d 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . Z 4 129.456 156.915 234.719 1 12.06 ? N1 GTP 502 d 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . Z 4 128.223 156.532 235.192 1 16.28 ? C2 GTP 502 d 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . Z 4 127.778 157.037 236.339 1 19.36 ? N2 GTP 502 d 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . Z 4 127.451 155.63 234.484 1 14.7 ? N3 GTP 502 d 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . Z 4 127.896 155.109 233.314 1 12.99 ? C4 GTP 502 d 1 
HETATM 33 H H3 GTP . . . Z 4 126.547 155.356 234.842 1 14.7 ? H3 GTP 502 d 1 
HETATM 34 H H5' GTP . . . Z 4 123.896 150.313 230.354 1 18.35 ? H5' GTP 502 d 1 
HETATM 35 H "H5''" GTP . . . Z 4 125.141 151.213 229.461 1 18.35 ? "H5''" GTP 502 d 1 
HETATM 36 H H4' GTP . . . Z 4 124.165 151.582 232.285 1 13.87 ? H4' GTP 502 d 1 
HETATM 37 H H3' GTP . . . Z 4 124.628 153.243 229.821 1 13.23 ? H3' GTP 502 d 1 
HETATM 38 H HO3' GTP . . . Z 4 122.566 153.689 230.203 1 15.61 ? HO3' GTP 502 d 1 
HETATM 39 H H2' GTP . . . Z 4 125.472 154.985 231.024 1 12.31 ? H2' GTP 502 d 1 
HETATM 40 H HO2' GTP . . . Z 4 124.484 155.203 233.308 1 19.25 ? HO2' GTP 502 d 1 
HETATM 41 H H1' GTP . . . Z 4 125.728 153.515 233.561 1 12.66 ? H1' GTP 502 d 1 
HETATM 42 H H8 GTP . . . Z 4 128.147 153.415 230.551 1 12.53 ? H8 GTP 502 d 1 
HETATM 43 H HN21 GTP . . . Z 4 128.344 157.696 236.854 1 19.36 ? HN21 GTP 502 d 1 
HETATM 44 H HN22 GTP . . . Z 4 126.874 156.762 236.695 1 19.36 ? HN22 GTP 502 d 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              33 
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