data_9G0Q
#
_model_server_result.job_id            NEtyh9UmixfSm5zOXcD4bw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-18 04:57:48' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9g0q 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    9G0Q 
#
_exptl.entry_id    9G0Q 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    12-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 S N N 
? 4 U N N 
? 4 W N N 
? 4 Y N N 
? 4 AA N N 
? 4 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 G OE1 GLU 70 a GLU 70 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc2 S O1G GTP . a GTP 501 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? 
metalc ? metalc3 S O1B GTP . a GTP 501 1_555 T MG MG . a MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc4 H OE1 GLU 70 b GLU 70 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc5 U O1G GTP . b GTP 501 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? 
metalc ? metalc6 U O1B GTP . b GTP 501 1_555 V MG MG . b MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc7 I OE1 GLU 70 c GLU 70 1_555 X MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc8 W O1G GTP . c GTP 501 1_555 X MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? 
metalc ? metalc9 W O1B GTP . c GTP 501 1_555 X MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc10 J OE1 GLU 70 d GLU 70 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc11 Y O1G GTP . d GTP 501 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? 
metalc ? metalc12 Y O1B GTP . d GTP 501 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc13 K OE1 GLU 70 e GLU 70 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc14 AA O1G GTP . e GTP 501 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc15 AA O1B GTP . e GTP 501 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc16 L OE1 GLU 70 f GLU 70 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc17 CA O1G GTP . f GTP 501 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? 
metalc ? metalc18 CA O1B GTP . f GTP 501 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9G0Q 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 GDP A 1 501 501 GDP GDP . 
N 3 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
O 3 GDP C 1 501 501 GDP GDP . 
P 3 GDP D 1 501 501 GDP GDP . 
Q 3 GDP E 1 501 501 GDP GDP . 
R 3 GDP F 1 501 501 GDP GDP . 
S 4 GTP a 1 501 501 GTP GTP . 
T 5 MG a 1 502 502 MG MG . 
U 4 GTP b 1 501 501 GTP GTP . 
V 5 MG b 1 502 502 MG MG . 
W 4 GTP c 1 501 501 GTP GTP . 
X 5 MG c 1 502 502 MG MG . 
Y 4 GTP d 1 501 501 GTP GTP . 
Z 5 MG d 1 502 502 MG MG . 
AA 4 GTP e 1 501 501 GTP GTP . 
BA 5 MG e 1 502 502 MG MG . 
CA 4 GTP f 1 501 501 GTP GTP . 
DA 5 MG f 1 502 502 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . U 4 198.22 344.484 121.794 1 57.67 ? PG GTP 501 b 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . U 4 198.185 343.122 121.156 1 70.78 ? O1G GTP 501 b 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . U 4 196.901 345.178 121.611 1 62.18 ? O2G GTP 501 b 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . U 4 199.331 345.303 121.182 1 65.85 ? O3G GTP 501 b 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . U 4 198.483 344.26 123.359 1 49.61 ? O3B GTP 501 b 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . U 4 199.715 343.331 123.795 1 56.65 ? PB GTP 501 b 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . U 4 199.896 342.235 122.773 1 67.27 ? O1B GTP 501 b 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . U 4 199.513 342.778 125.182 1 62.07 ? O2B GTP 501 b 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . U 4 200.99 344.307 123.782 1 55.41 ? O3A GTP 501 b 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . U 4 202.453 343.702 124.058 1 74.4 ? PA GTP 501 b 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . U 4 202.672 342.534 123.128 1 72.15 ? O1A GTP 501 b 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . U 4 202.572 343.275 125.497 1 65.82 ? O2A GTP 501 b 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . U 4 203.484 344.898 123.716 1 73.65 ? O5' GTP 501 b 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . U 4 204.884 344.693 123.617 1 57.42 ? C5' GTP 501 b 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . U 4 205.61 344.897 124.949 1 44.32 ? C4' GTP 501 b 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . U 4 205.225 343.898 125.868 1 44.69 ? O4' GTP 501 b 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . U 4 207.118 344.795 124.809 1 57.27 ? C3' GTP 501 b 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . U 4 207.695 346.043 125.105 1 66.87 ? O3' GTP 501 b 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . U 4 207.586 343.783 125.834 1 48.04 ? C2' GTP 501 b 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . U 4 208.474 344.388 126.746 1 55.88 ? O2' GTP 501 b 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . U 4 206.33 343.334 126.553 1 45.06 ? C1' GTP 501 b 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . U 4 206.208 341.862 126.576 1 48.01 ? N9 GTP 501 b 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . U 4 205.539 341.1 125.664 1 45.94 ? C8 GTP 501 b 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . U 4 205.63 339.804 126.031 1 49.68 ? N7 GTP 501 b 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . U 4 206.333 339.718 127.179 1 45.84 ? C5 GTP 501 b 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . U 4 206.711 338.638 127.976 1 42.48 ? C6 GTP 501 b 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . U 4 206.398 337.484 127.682 1 47.43 ? O6 GTP 501 b 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . U 4 207.445 338.871 129.113 1 46.31 ? N1 GTP 501 b 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . U 4 207.803 340.156 129.447 1 46.61 ? C2 GTP 501 b 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . U 4 208.506 340.375 130.55 1 54.27 ? N2 GTP 501 b 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . U 4 207.421 341.216 128.656 1 45.82 ? N3 GTP 501 b 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . U 4 206.699 341.007 127.533 1 47.25 ? C4 GTP 501 b 1 
HETATM 33 H H3 GTP . . . U 4 207.682 342.156 128.917 1 45.82 ? H3 GTP 501 b 1 
HETATM 34 H H5' GTP . . . U 4 205.288 345.397 122.889 1 57.42 ? H5' GTP 501 b 1 
HETATM 35 H "H5''" GTP . . . U 4 205.068 343.678 123.266 1 57.42 ? "H5''" GTP 501 b 1 
HETATM 36 H H4' GTP . . . U 4 205.352 345.876 125.353 1 44.32 ? H4' GTP 501 b 1 
HETATM 37 H H3' GTP . . . U 4 207.389 344.476 123.803 1 57.27 ? H3' GTP 501 b 1 
HETATM 38 H HO3' GTP . . . U 4 208.083 346.414 124.309 1 66.87 ? HO3' GTP 501 b 1 
HETATM 39 H H2' GTP . . . U 4 208.065 342.937 125.341 1 48.04 ? H2' GTP 501 b 1 
HETATM 40 H HO2' GTP . . . U 4 208.374 345.342 126.706 1 55.88 ? HO2' GTP 501 b 1 
HETATM 41 H H1' GTP . . . U 4 206.348 343.709 127.576 1 45.06 ? H1' GTP 501 b 1 
HETATM 42 H H8 GTP . . . U 4 205.022 341.472 124.792 1 45.94 ? H8 GTP 501 b 1 
HETATM 43 H HN21 GTP . . . U 4 208.781 339.6 131.136 1 54.27 ? HN21 GTP 501 b 1 
HETATM 44 H HN22 GTP . . . U 4 208.766 341.317 130.804 1 54.27 ? HN22 GTP 501 b 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              27 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    381 
_model_server_stats.query_time_ms           233 
_model_server_stats.encode_time_ms          12 
_model_server_stats.element_count           44 
#