data_9G0S
#
_model_server_result.job_id            ydA7ws73YUVLIa7bfql6SA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-09-07 16:17:21' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9g0s 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"AA","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    9G0S 
#
_exptl.entry_id    9G0S 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    12-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      12 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 T N N 
? 5 V N N 
? 5 X N N 
? 5 Y N N 
? 5 AA N N 
? 5 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 G OE2 GLU 70 a GLU 70 1_555 S MG MG . a MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? 
metalc ? metalc2 S MG MG . a MG 501 1_555 T O1G GTP . a GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc3 S MG MG . a MG 501 1_555 T O1B GTP . a GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? 
metalc ? metalc4 H OE1 GLN 11 b GLN 11 1_555 U MG MG . b MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? 
metalc ? metalc5 H OE1 GLU 70 b GLU 70 1_555 U MG MG . b MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.783 ? 
metalc ? metalc6 H OE2 GLU 70 b GLU 70 1_555 U MG MG . b MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc7 U MG MG . b MG 501 1_555 V O1G GTP . b GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc8 U MG MG . b MG 501 1_555 V O1B GTP . b GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc9 I OE1 GLN 11 c GLN 11 1_555 W MG MG . c MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? 
metalc ? metalc10 I OE2 GLU 70 c GLU 70 1_555 W MG MG . c MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc11 W MG MG . c MG 501 1_555 X O1G GTP . c GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc12 W MG MG . c MG 501 1_555 X O1B GTP . c GTP 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? 
metalc ? metalc13 J OE2 GLU 70 d GLU 70 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc14 Y O1G GTP . d GTP 501 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc15 Y O1B GTP . d GTP 501 1_555 Z MG MG . d MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? 
metalc ? metalc16 K OE2 GLU 70 e GLU 70 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc17 AA O1G GTP . e GTP 501 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc18 AA O1B GTP . e GTP 501 1_555 BA MG MG . e MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
metalc ? metalc19 L OE1 GLN 11 f GLN 11 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? 
metalc ? metalc20 L OE2 GLU 70 f GLU 70 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.886 ? 
metalc ? metalc21 CA O1G GTP . f GTP 501 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc22 CA O1B GTP . f GTP 501 1_555 DA MG MG . f MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     9G0S 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 GDP A 1 501 501 GDP GDP . 
N 3 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
O 3 GDP C 1 501 501 GDP GDP . 
P 3 GDP D 1 501 501 GDP GDP . 
Q 3 GDP E 1 501 501 GDP GDP . 
R 3 GDP F 1 501 501 GDP GDP . 
S 4 MG a 1 501 502 MG MG . 
T 5 GTP a 1 502 501 GTP GTP . 
U 4 MG b 1 501 502 MG MG . 
V 5 GTP b 1 502 501 GTP GTP . 
W 4 MG c 1 501 502 MG MG . 
X 5 GTP c 1 502 501 GTP GTP . 
Y 5 GTP d 1 501 501 GTP GTP . 
Z 4 MG d 1 502 502 MG MG . 
AA 5 GTP e 1 501 501 GTP GTP . 
BA 4 MG e 1 502 502 MG MG . 
CA 5 GTP f 1 501 501 GTP GTP . 
DA 4 MG f 1 502 502 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . AA 5 128.104 146.025 227.9 1 6.46 ? PG GTP 501 e 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . AA 5 128.885 147.108 227.217 1 6.53 ? O1G GTP 501 e 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . AA 5 128.956 144.799 228.052 1 6.56 ? O2G GTP 501 e 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . AA 5 126.747 145.796 227.301 1 6.54 ? O3G GTP 501 e 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . AA 5 127.757 146.454 229.405 1 6.41 ? O3B GTP 501 e 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . AA 5 128.39 147.726 230.137 1 6.31 ? PB GTP 501 e 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . AA 5 129.776 148.052 229.646 1 6.32 ? O1B GTP 501 e 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . AA 5 128.32 147.494 231.624 1 6.29 ? O2B GTP 501 e 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . AA 5 127.329 148.853 229.747 1 6.29 ? O3A GTP 501 e 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . AA 5 127.264 150.284 230.452 1 6.24 ? PA GTP 501 e 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . AA 5 127.707 151.242 229.37 1 6.23 ? O1A GTP 501 e 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . AA 5 128.036 150.282 231.75 1 6.26 ? O2A GTP 501 e 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . AA 5 125.708 150.425 230.816 1 6.16 ? O5' GTP 501 e 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . AA 5 124.913 151.507 230.354 1 6.1 ? C5' GTP 501 e 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . AA 5 124.258 152.135 231.568 1 6.05 ? C4' GTP 501 e 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . AA 5 125.278 152.647 232.429 1 5.96 ? O4' GTP 501 e 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . AA 5 123.4 153.322 231.161 1 6.03 ? C3' GTP 501 e 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . AA 5 122.304 153.453 232.073 1 6.05 ? O3' GTP 501 e 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . AA 5 124.365 154.469 231.28 1 5.96 ? C2' GTP 501 e 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . AA 5 123.685 155.706 231.488 1 5.99 ? O2' GTP 501 e 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . AA 5 125.173 154.067 232.495 1 5.9 ? C1' GTP 501 e 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . AA 5 126.538 154.624 232.503 1 5.75 ? N9 GTP 501 e 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . AA 5 127.519 154.329 231.647 1 5.69 ? C8 GTP 501 e 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . AA 5 128.651 154.985 231.993 1 5.65 ? N7 GTP 501 e 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . AA 5 128.41 155.692 233.104 1 5.62 ? C5 GTP 501 e 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . AA 5 129.167 156.597 234.004 1 5.59 ? C6 GTP 501 e 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . AA 5 130.362 156.872 233.792 1 5.55 ? O6 GTP 501 e 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . AA 5 128.527 157.114 235.058 1 5.61 ? N1 GTP 501 e 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . AA 5 127.231 156.839 235.307 1 5.63 ? C2 GTP 501 e 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . AA 5 126.631 157.382 236.387 1 5.66 ? N2 GTP 501 e 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . AA 5 126.485 156.013 234.535 1 5.63 ? N3 GTP 501 e 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . AA 5 127.014 155.425 233.445 1 5.66 ? C4 GTP 501 e 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              131 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    256 
_model_server_stats.query_time_ms           339 
_model_server_stats.encode_time_ms          12 
_model_server_stats.element_count           32 
#