data_9GCS # _model_server_result.job_id YrRMPj_0QffdWor0oC3GnQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 16:53:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9gcs # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"NA","auth_seq_id":502}' # _entry.id 9GCS # _exptl.entry_id 9GCS _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9GCS _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9GCS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 22-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 22 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 X N N ? 4 Z N N ? 4 BA N N ? 4 DA N N ? 4 FA N N ? 4 HA N N ? 4 JA N N ? 4 LA N N ? 4 NA N N ? 4 PA N N ? 4 RA N N ? 4 TA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 185 C THR 185 1_555 X MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc2 W O2G ATP . C ATP 501 1_555 X MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc ? metalc3 W O1B ATP . C ATP 501 1_555 X MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc4 W O3B ATP . C ATP 501 1_555 X MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.874 ? metalc ? metalc5 B OG1 THR 185 D THR 185 1_555 Z MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc6 Y O2G ATP . D ATP 501 1_555 Z MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc7 Y O1B ATP . D ATP 501 1_555 Z MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc ? metalc8 Y O1A ATP . D ATP 501 1_555 Z MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc9 C OG1 THR 185 E THR 185 1_555 BA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc10 AA O2G ATP . E ATP 501 1_555 BA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc11 AA O1B ATP . E ATP 501 1_555 BA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc12 AA O1A ATP . E ATP 501 1_555 BA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? metalc ? metalc13 D OG1 THR 185 J THR 185 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc14 CA O2G ATP . J ATP 501 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc15 CA O1B ATP . J ATP 501 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc16 CA O2A ATP . J ATP 501 1_555 DA MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc17 E OG1 THR 185 K THR 185 1_555 FA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc18 EA O2G ATP . K ATP 501 1_555 FA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc ? metalc19 EA O1B ATP . K ATP 501 1_555 FA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc20 EA O3B ATP . K ATP 501 1_555 FA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc21 F OG1 THR 185 L THR 185 1_555 HA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc22 GA O2G ATP . L ATP 501 1_555 HA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? metalc ? metalc23 GA O1B ATP . L ATP 501 1_555 HA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc24 GA O3B ATP . L ATP 501 1_555 HA MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc25 G OG1 THR 185 M THR 185 1_555 JA MG MG . M MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc26 IA O2G ATP . M ATP 501 1_555 JA MG MG . M MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc27 IA O1B ATP . M ATP 501 1_555 JA MG MG . M MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc28 IA O3B ATP . M ATP 501 1_555 JA MG MG . M MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc29 H OG1 THR 185 O THR 185 1_555 LA MG MG . O MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? metalc ? metalc30 KA O2G ATP . O ATP 501 1_555 LA MG MG . O MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc ? metalc31 KA O1B ATP . O ATP 501 1_555 LA MG MG . O MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc32 KA O2A ATP . O ATP 501 1_555 LA MG MG . O MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc33 S OG1 THR 185 B THR 185 1_555 NA MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc34 MA O2G ATP . B ATP 501 1_555 NA MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc35 MA O1B ATP . B ATP 501 1_555 NA MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc36 T OG1 THR 185 G THR 185 1_555 PA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc37 T OE2 GLU 211 G GLU 211 1_555 PA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc38 OA O2G ATP . G ATP 501 1_555 PA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc39 OA O1B ATP . G ATP 501 1_555 PA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc40 OA O3B ATP . G ATP 501 1_555 PA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc41 U OG1 THR 185 N THR 185 1_555 RA MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc42 QA O2G ATP . N ATP 501 1_555 RA MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? metalc ? metalc43 QA O1B ATP . N ATP 501 1_555 RA MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc44 QA O3B ATP . N ATP 501 1_555 RA MG MG . N MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc45 V OG1 THR 185 F THR 185 1_555 TA MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc46 SA O2G ATP . F ATP 501 1_555 TA MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc ? metalc47 SA O1B ATP . F ATP 501 1_555 TA MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? metalc ? metalc48 SA O3B ATP . F ATP 501 1_555 TA MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9GCS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code W 3 ATP C 1 501 501 ATP ATP . X 4 MG C 1 502 502 MG MG . Y 3 ATP D 1 501 501 ATP ATP . Z 4 MG D 1 502 502 MG MG . AA 3 ATP E 1 501 501 ATP ATP . BA 4 MG E 1 502 502 MG MG . CA 3 ATP J 1 501 501 ATP ATP . DA 4 MG J 1 502 502 MG MG . EA 3 ATP K 1 501 501 ATP ATP . FA 4 MG K 1 502 502 MG MG . GA 3 ATP L 1 501 501 ATP ATP . HA 4 MG L 1 502 502 MG MG . IA 3 ATP M 1 501 501 ATP ATP . JA 4 MG M 1 502 502 MG MG . KA 3 ATP O 1 501 501 ATP ATP . LA 4 MG O 1 502 502 MG MG . MA 3 ATP B 1 501 501 ATP ATP . NA 4 MG B 1 502 502 MG MG . OA 3 ATP G 1 501 501 ATP ATP . PA 4 MG G 1 502 502 MG MG . QA 3 ATP N 1 501 501 ATP ATP . RA 4 MG N 1 502 502 MG MG . SA 3 ATP F 1 501 501 ATP ATP . TA 4 MG F 1 502 502 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id NA _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 171.383 _atom_site.Cartn_y 145.749 _atom_site.Cartn_z 170.707 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 71.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 26 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 77 _model_server_stats.query_time_ms 253 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #