data_9GL0 # _model_server_result.job_id kKVXLo8dYAUMfkUs482W4g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 23:38:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9gl0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":501}' # _entry.id 9GL0 # _exptl.entry_id 9GL0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9GL0 _cell.length_a 109.121 _cell.length_b 109.121 _cell.length_c 400.511 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9GL0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 91 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 2 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,K 1 1 B,G,L 2 1 C,H,I,M 3 1 D,J,N 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O GLY 228 A GLY 217 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 230 A ASP 219 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 230 A ASP 219 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc4 A O ASP 230 A ASP 219 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASN 232 A ASN 221 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc6 A O ASN 232 A ASN 221 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.058 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 234 A ASP 223 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 254 A ASP 243 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? metalc ? metalc9 A O VAL 255 A VAL 244 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 343 A ASP 332 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc11 B OD1 ASP 230 B ASP 219 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc12 B OD2 ASP 230 B ASP 219 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc13 B OD1 ASN 232 B ASN 221 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc14 B OD2 ASP 343 B ASP 332 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc15 C O GLY 228 C GLY 217 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? metalc ? metalc16 C OD1 ASP 230 C ASP 219 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc17 C OD2 ASP 230 C ASP 219 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc18 C O ASP 230 C ASP 219 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.077 ? metalc ? metalc19 C OD1 ASN 232 C ASN 221 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc20 C O ASN 232 C ASN 221 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.094 ? metalc ? metalc21 C OD1 ASP 234 C ASP 223 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc22 C OD2 ASP 234 C ASP 223 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.495 ? metalc ? metalc23 C O VAL 255 C VAL 244 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? metalc ? metalc24 C OD2 ASP 343 C ASP 332 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc25 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 M O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc26 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 M O HOH . C HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc27 D OD1 ASP 230 D ASP 219 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc28 D OD2 ASP 230 D ASP 219 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc29 D OD1 ASN 232 D ASN 221 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc30 D OD2 ASP 343 D ASP 332 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9GL0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009164 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009164 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002497 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 ZN A 1 501 1 ZN ZN . F 3 K A 1 502 1 K K . G 2 ZN B 1 501 2 ZN ZN . H 2 ZN C 1 501 3 ZN ZN . I 3 K C 1 502 2 K K . J 2 ZN D 1 501 4 ZN ZN . K 4 HOH A 1 601 1 HOH HOH . K 4 HOH A 2 602 26 HOH HOH . K 4 HOH A 3 603 5 HOH HOH . K 4 HOH A 4 604 24 HOH HOH . L 4 HOH B 1 601 3 HOH HOH . L 4 HOH B 2 602 10 HOH HOH . L 4 HOH B 3 603 4 HOH HOH . L 4 HOH B 4 604 13 HOH HOH . M 4 HOH C 1 601 18 HOH HOH . M 4 HOH C 2 602 23 HOH HOH . M 4 HOH C 3 603 7 HOH HOH . M 4 HOH C 4 604 22 HOH HOH . N 4 HOH D 1 601 2 HOH HOH . N 4 HOH D 2 602 8 HOH HOH . N 4 HOH D 3 603 17 HOH HOH . N 4 HOH D 4 604 9 HOH HOH . N 4 HOH D 5 605 16 HOH HOH . N 4 HOH D 6 606 25 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -33.799 _atom_site.Cartn_y -9.041 _atom_site.Cartn_z 33.464 _atom_site.occupancy 0.8 _atom_site.B_iso_or_equiv 113.48 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 501 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 467 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #