data_9GL0
#
_model_server_result.job_id            X6Vie4oe94Jm4-b1ov4zLA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-28 15:17:16' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9gl0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    9GL0 
#
_exptl.entry_id    9GL0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            9GL0 
_cell.length_a            109.121 
_cell.length_b            109.121 
_cell.length_c            400.511 
_cell.Z_PDB               32 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 9GL0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        91 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 41 2 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,K 1 1 
B,G,L 2 1 
C,H,I,M 3 1 
D,J,N 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O GLY 228 A GLY 217 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 230 A ASP 219 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 230 A ASP 219 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc4 A O ASP 230 A ASP 219 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASN 232 A ASN 221 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc6 A O ASN 232 A ASN 221 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.058 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 234 A ASP 223 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 254 A ASP 243 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? 
metalc ? metalc9 A O VAL 255 A VAL 244 1_555 F K K . A K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc10 A OD2 ASP 343 A ASP 332 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc11 B OD1 ASP 230 B ASP 219 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 230 B ASP 219 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASN 232 B ASN 221 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 343 B ASP 332 1_555 G ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc15 C O GLY 228 C GLY 217 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? 
metalc ? metalc16 C OD1 ASP 230 C ASP 219 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 230 C ASP 219 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc18 C O ASP 230 C ASP 219 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.077 ? 
metalc ? metalc19 C OD1 ASN 232 C ASN 221 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc20 C O ASN 232 C ASN 221 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.094 ? 
metalc ? metalc21 C OD1 ASP 234 C ASP 223 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? 
metalc ? metalc22 C OD2 ASP 234 C ASP 223 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.495 ? 
metalc ? metalc23 C O VAL 255 C VAL 244 1_555 I K K . C K 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? 
metalc ? metalc24 C OD2 ASP 343 C ASP 332 1_555 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc25 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 M O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc26 H ZN ZN . C ZN 501 1_555 M O HOH . C HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? 
metalc ? metalc27 D OD1 ASP 230 D ASP 219 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc28 D OD2 ASP 230 D ASP 219 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc29 D OD1 ASN 232 D ASN 221 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
metalc ? metalc30 D OD2 ASP 343 D ASP 332 1_555 J ZN ZN . D ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     9GL0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009164 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009164 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.002497 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 ZN A 1 501 1 ZN ZN . 
F 3 K A 1 502 1 K K . 
G 2 ZN B 1 501 2 ZN ZN . 
H 2 ZN C 1 501 3 ZN ZN . 
I 3 K C 1 502 2 K K . 
J 2 ZN D 1 501 4 ZN ZN . 
K 4 HOH A 1 601 1 HOH HOH . 
K 4 HOH A 2 602 26 HOH HOH . 
K 4 HOH A 3 603 5 HOH HOH . 
K 4 HOH A 4 604 24 HOH HOH . 
L 4 HOH B 1 601 3 HOH HOH . 
L 4 HOH B 2 602 10 HOH HOH . 
L 4 HOH B 3 603 4 HOH HOH . 
L 4 HOH B 4 604 13 HOH HOH . 
M 4 HOH C 1 601 18 HOH HOH . 
M 4 HOH C 2 602 23 HOH HOH . 
M 4 HOH C 3 603 7 HOH HOH . 
M 4 HOH C 4 604 22 HOH HOH . 
N 4 HOH D 1 601 2 HOH HOH . 
N 4 HOH D 2 602 8 HOH HOH . 
N 4 HOH D 3 603 17 HOH HOH . 
N 4 HOH D 4 604 9 HOH HOH . 
N 4 HOH D 5 605 16 HOH HOH . 
N 4 HOH D 6 606 25 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         H 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -33.799 
_atom_site.Cartn_y               -9.041 
_atom_site.Cartn_z               33.464 
_atom_site.occupancy             0.8 
_atom_site.B_iso_or_equiv        113.48 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           501 
_atom_site.auth_asym_id          C 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              15 
_model_server_stats.parse_time_ms           14 
_model_server_stats.create_model_time_ms    13 
_model_server_stats.query_time_ms           310 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           1 
#