data_9IIG
#
_model_server_result.job_id            tGD-8vrdWFEZodyAT6nJ2Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-09-03 20:54:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          9iig 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"CA","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    9IIG 
#
_exptl.entry_id    9IIG 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    24-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      24 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
? 3 AA N N 
? 3 BA N N 
? 3 CA N N 
? 3 DA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASN 149 A ASN 149 1_555 Y NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 152 A GLN 152 1_555 Y NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? 
metalc ? metalc3 Y NA NA . A NA 201 1_555 R OE1 GLN 151 R GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? 
metalc ? metalc4 B OD1 ASN 149 B ASN 149 1_555 Z NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc5 B OE1 GLN 152 B GLN 152 1_555 Z NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.086 ? 
metalc ? metalc6 Z NA NA . B NA 201 1_555 F OD1 ASN 149 F ASN 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc7 Z NA NA . B NA 201 1_555 O OE1 GLN 151 O GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.991 ? 
metalc ? metalc8 C OE1 GLN 152 C GLN 152 1_555 AA NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? 
metalc ? metalc9 AA NA NA . C NA 201 1_555 N OE1 GLN 151 N GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.76 ? 
metalc ? metalc10 AA NA NA . C NA 201 1_555 V OE1 GLN 151 V GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc11 AA NA NA . C NA 201 1_555 X OE1 GLN 151 X GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.034 ? 
metalc ? metalc12 D OD1 ASN 149 D ASN 149 1_555 BA NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc13 D OE1 GLN 152 D GLN 152 1_555 BA NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? 
metalc ? metalc14 BA NA NA . D NA 201 1_555 E OD1 ASN 149 E ASN 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? 
metalc ? metalc15 BA NA NA . D NA 201 1_555 J OD1 ASN 149 J ASN 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? 
metalc ? metalc16 BA NA NA . D NA 201 1_555 J OE1 GLN 152 J GLN 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc17 BA NA NA . D NA 201 1_555 L OE1 GLN 152 L GLN 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? 
metalc ? metalc18 G OD1 ASN 149 G ASN 149 1_555 CA NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? 
metalc ? metalc19 G OE1 GLN 152 G GLN 152 1_555 CA NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.165 ? 
metalc ? metalc20 CA NA NA . G NA 201 1_555 I OD1 ASN 149 I ASN 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? 
metalc ? metalc21 CA NA NA . G NA 201 1_555 W OE1 GLN 151 W GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.152 ? 
metalc ? metalc22 K OE1 GLN 152 K GLN 152 1_555 DA NA NA . K NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc23 DA NA NA . K NA 201 1_555 P OE1 GLN 151 P GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? 
metalc ? metalc24 DA NA NA . K NA 201 1_555 Q OE1 GLN 151 Q GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.14 ? 
metalc ? metalc25 DA NA NA . K NA 201 1_555 S OE1 GLN 151 S GLN 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.141 ? 
metalc ? metalc26 M SD MET 52 M MET 52 1_555 EA FE HEM . N HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc27 N SD MET 52 N MET 52 1_555 EA FE HEM . N HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc28 O SD MET 52 O MET 52 1_555 FA FE HEM . O HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc29 FA FE HEM . O HEM 201 1_555 P SD MET 52 P MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc30 Q SD MET 52 Q MET 52 1_555 GA FE HEM . Q HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc31 GA FE HEM . Q HEM 201 1_555 R SD MET 52 R MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
metalc ? metalc32 S SD MET 52 S MET 52 1_555 HA FE HEM . S HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc33 HA FE HEM . S HEM 201 1_555 T SD MET 52 T MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? 
metalc ? metalc34 U SD MET 52 U MET 52 1_555 IA FE HEM . U HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc35 IA FE HEM . U HEM 201 1_555 V SD MET 52 V MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? 
metalc ? metalc36 W SD MET 52 W MET 52 1_555 JA FE HEM . X HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc37 X SD MET 52 X MET 52 1_555 JA FE HEM . X HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     9IIG 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Y 3 NA A 1 201 2 NA NA . 
Z 3 NA B 1 201 6 NA NA . 
AA 3 NA C 1 201 3 NA NA . 
BA 3 NA D 1 201 1 NA NA . 
CA 3 NA G 1 201 4 NA NA . 
DA 3 NA K 1 201 5 NA NA . 
EA 4 HEM N 1 201 1 HEM HEMF . 
FA 4 HEM O 1 201 1 HEM HEME . 
GA 4 HEM Q 1 201 1 HEM HEMA . 
HA 4 HEM S 1 201 1 HEM HEMB . 
IA 4 HEM U 1 201 1 HEM HEMC . 
JA 4 HEM X 1 201 1 HEM HEMD . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           NA 
_atom_site.label_atom_id         NA 
_atom_site.label_comp_id         NA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         CA 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               136.88 
_atom_site.Cartn_y               105.872 
_atom_site.Cartn_z               67.326 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        30 
_atom_site.pdbx_formal_charge    0 
_atom_site.auth_atom_id          NA 
_atom_site.auth_comp_id          NA 
_atom_site.auth_seq_id           201 
_atom_site.auth_asym_id          G 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              72 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    31 
_model_server_stats.query_time_ms           349 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           1 
#