data_9MSD # _model_server_result.job_id vUCitDyKqIjjyjidb6rN3g _model_server_result.datetime_utc '2025-09-06 23:06:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9msd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QA","auth_seq_id":701}' # _entry.id 9MSD # _exptl.entry_id 9MSD _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 27 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9MSD _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9MSD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 Y N N ? 8 Z N N ? 8 AA N N ? 8 BA N N ? 8 CA N N ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 6 n P NAG 1 P 1 NAG A 666 NAG 6 n P NAG 2 P 2 NAG A 667 NAG 6 n Q NAG 1 Q 1 NAG A 669 NAG 6 n Q NAG 2 Q 2 NAG A 670 NAG 7 n R NAG 1 R 1 NAG A 674 NAG 7 n R NAG 2 R 2 NAG A 675 NAG 7 n R BMA 3 R 3 BMA A 679 BMA 6 n S NAG 1 S 1 NAG G 666 NAG 6 n S NAG 2 S 2 NAG G 667 NAG 6 n T NAG 1 T 1 NAG G 669 NAG 6 n T NAG 2 T 2 NAG G 670 NAG 7 n U NAG 1 U 1 NAG G 674 NAG 7 n U NAG 2 U 2 NAG G 675 NAG 7 n U BMA 3 U 3 BMA G 679 BMA 6 n V NAG 1 V 1 NAG B 666 NAG 6 n V NAG 2 V 2 NAG B 667 NAG 6 n W NAG 1 W 1 NAG B 669 NAG 6 n W NAG 2 W 2 NAG B 670 NAG 7 n X NAG 1 X 1 NAG B 674 NAG 7 n X NAG 2 X 2 NAG B 675 NAG 7 n X BMA 3 X 3 BMA B 679 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 27 A CYS 54 1_555 A SG CYS 47 A CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 92 A CYS 119 1_555 A SG CYS 185 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 99 A CYS 126 1_555 A SG CYS 176 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 104 A CYS 131 1_555 A SG CYS 130 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 198 A CYS 218 1_555 A SG CYS 227 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 208 A CYS 228 1_555 A SG CYS 219 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 276 A CYS 296 1_555 A SG CYS 310 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 356 A CYS 378 1_555 A SG CYS 422 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 363 A CYS 385 1_555 A SG CYS 395 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 477 A CYS 501 1_555 A SG CYS 591 A CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 584 A CYS 598 1_555 A SG CYS 590 A CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 23 L CYS 23 1_555 C SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf14 D SG CYS 20 D CYS 23 1_555 D SG CYS 88 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 22 C CYS 22 1_555 E SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf16 F SG CYS 27 G CYS 54 1_555 F SG CYS 47 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf17 F SG CYS 92 G CYS 119 1_555 F SG CYS 185 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 99 G CYS 126 1_555 F SG CYS 176 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf19 F SG CYS 104 G CYS 131 1_555 F SG CYS 130 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 198 G CYS 218 1_555 F SG CYS 227 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 208 G CYS 228 1_555 F SG CYS 219 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 276 G CYS 296 1_555 F SG CYS 310 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 356 G CYS 378 1_555 F SG CYS 422 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 363 G CYS 385 1_555 F SG CYS 395 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf25 F SG CYS 477 G CYS 501 1_555 F SG CYS 591 G CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 584 G CYS 598 1_555 F SG CYS 590 G CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 22 I CYS 22 1_555 G SG CYS 96 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 H SG CYS 23 M CYS 23 1_555 H SG CYS 88 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 20 F CYS 23 1_555 I SG CYS 88 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 22 E CYS 22 1_555 J SG CYS 96 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 27 B CYS 54 1_555 K SG CYS 47 B CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 92 B CYS 119 1_555 K SG CYS 185 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 99 B CYS 126 1_555 K SG CYS 176 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 104 B CYS 131 1_555 K SG CYS 130 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 198 B CYS 218 1_555 K SG CYS 227 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 208 B CYS 228 1_555 K SG CYS 219 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 276 B CYS 296 1_555 K SG CYS 310 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 356 B CYS 378 1_555 K SG CYS 422 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf39 K SG CYS 363 B CYS 385 1_555 K SG CYS 395 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 477 B CYS 501 1_555 K SG CYS 591 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf41 K SG CYS 584 B CYS 598 1_555 K SG CYS 590 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf42 L SG CYS 22 N CYS 22 1_555 L SG CYS 96 N CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf43 M SG CYS 23 O CYS 23 1_555 M SG CYS 88 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf44 N SG CYS 20 K CYS 23 1_555 N SG CYS 88 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf45 O SG CYS 22 J CYS 22 1_555 O SG CYS 96 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 61 A ASN 88 1_555 Y C1 NAG . A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 129 A ASN 156 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 133 A ASN 160 1_555 Z C1 NAG . A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 177 A ASN 197 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 210 A ASN 230 1_555 AA C1 NAG . A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 214 A ASN 234 1_555 BA C1 NAG . A NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 221 A ASN 241 1_555 CA C1 NAG . A NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 242 A ASN 262 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 281 A ASN 301 1_555 DA C1 NAG . A NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 311 A ASN 332 1_555 EA C1 NAG . A NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 364 A ASN 386 1_555 GA C1 NAG . A NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 A ND2 ASN 425 A ASN 448 1_555 FA C1 NAG . A NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale13 F ND2 ASN 61 G ASN 88 1_555 HA C1 NAG . G NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 F ND2 ASN 129 G ASN 156 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 F ND2 ASN 133 G ASN 160 1_555 IA C1 NAG . G NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale16 F ND2 ASN 177 G ASN 197 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale17 F ND2 ASN 210 G ASN 230 1_555 JA C1 NAG . G NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale18 F ND2 ASN 214 G ASN 234 1_555 KA C1 NAG . G NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 F ND2 ASN 221 G ASN 241 1_555 LA C1 NAG . G NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 F ND2 ASN 242 G ASN 262 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 281 G ASN 301 1_555 MA C1 NAG . G NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 311 G ASN 332 1_555 NA C1 NAG . G NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 364 G ASN 386 1_555 PA C1 NAG . G NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale24 F ND2 ASN 425 G ASN 448 1_555 OA C1 NAG . G NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale25 K ND2 ASN 61 B ASN 88 1_555 QA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale26 K ND2 ASN 129 B ASN 156 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale27 K ND2 ASN 133 B ASN 160 1_555 RA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 K ND2 ASN 177 B ASN 197 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale29 K ND2 ASN 210 B ASN 230 1_555 SA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale30 K ND2 ASN 214 B ASN 234 1_555 TA C1 NAG . B NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale31 K ND2 ASN 221 B ASN 241 1_555 UA C1 NAG . B NAG 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale32 K ND2 ASN 242 B ASN 262 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale33 K ND2 ASN 281 B ASN 301 1_555 VA C1 NAG . B NAG 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale34 K ND2 ASN 311 B ASN 332 1_555 WA C1 NAG . B NAG 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale35 K ND2 ASN 364 B ASN 386 1_555 YA C1 NAG . B NAG 709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 K ND2 ASN 425 B ASN 448 1_555 XA C1 NAG . B NAG 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale38 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale39 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale40 R O4 NAG . R NAG 2 1_555 R C1 BMA . R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale41 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale42 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale43 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale44 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale45 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale46 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale47 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale48 X O4 NAG . X NAG 2 1_555 X C1 BMA . X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9MSD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 8 NAG A 1 701 665 NAG NAG . Z 8 NAG A 1 702 668 NAG NAG . AA 8 NAG A 1 703 671 NAG NAG . BA 8 NAG A 1 704 672 NAG NAG . CA 8 NAG A 1 705 673 NAG NAG . DA 8 NAG A 1 706 676 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 707 677 NAG NAG . FA 8 NAG A 1 708 678 NAG NAG . GA 8 NAG A 1 709 680 NAG NAG . HA 8 NAG G 1 701 665 NAG NAG . IA 8 NAG G 1 702 668 NAG NAG . JA 8 NAG G 1 703 671 NAG NAG . KA 8 NAG G 1 704 672 NAG NAG . LA 8 NAG G 1 705 673 NAG NAG . MA 8 NAG G 1 706 676 NAG NAG . NA 8 NAG G 1 707 677 NAG NAG . OA 8 NAG G 1 708 678 NAG NAG . PA 8 NAG G 1 709 680 NAG NAG . QA 8 NAG B 1 701 665 NAG NAG . RA 8 NAG B 1 702 668 NAG NAG . SA 8 NAG B 1 703 671 NAG NAG . TA 8 NAG B 1 704 672 NAG NAG . UA 8 NAG B 1 705 673 NAG NAG . VA 8 NAG B 1 706 676 NAG NAG . WA 8 NAG B 1 707 677 NAG NAG . XA 8 NAG B 1 708 678 NAG NAG . YA 8 NAG B 1 709 680 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . QA 8 187.265 234.225 186.185 1 88.87 ? C1 NAG 701 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . QA 8 188.402 233.788 185.256 1 86.54 ? C2 NAG 701 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . QA 8 188.872 234.963 184.408 1 89.67 ? C3 NAG 701 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . QA 8 187.684 235.603 183.702 1 91.73 ? C4 NAG 701 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . QA 8 186.599 235.96 184.725 1 90.94 ? C5 NAG 701 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . QA 8 185.346 236.53 184.1 1 89.28 ? C6 NAG 701 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . QA 8 189.813 231.907 186.028 1 80.03 ? C7 NAG 701 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . QA 8 190.999 231.559 186.893 1 75.88 ? C8 NAG 701 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . QA 8 189.491 233.214 186.005 1 84.94 ? N2 NAG 701 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . QA 8 189.839 234.501 183.502 1 88.57 ? O3 NAG 701 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . QA 8 188.165 236.754 183.042 1 92.13 ? O4 NAG 701 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . QA 8 186.223 234.791 185.425 1 92.25 ? O5 NAG 701 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . QA 8 185.677 237.703 183.395 1 91.57 ? O6 NAG 701 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . QA 8 189.211 231.044 185.409 1 77.16 ? O7 NAG 701 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 44 _model_server_stats.query_time_ms 333 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #