data_9NHK # _model_server_result.job_id pCRmAk1OyPKxiErPWySUdA _model_server_result.datetime_utc '2025-09-06 07:51:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9nhk # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MB","auth_seq_id":701}' # _entry.id 9NHK # _exptl.entry_id 9NHK _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 55 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9NHK _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9NHK _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 N N N ? 8 O N N ? 8 P N N ? 8 Q N N ? 8 R N N ? 8 S N N ? 8 T N N ? 8 U N N ? 8 V N N ? 8 W N N ? 8 X N N ? 8 Y N N ? 8 Z N N ? 8 AA N N ? 8 BA N N ? 8 CA N N ? 8 DA N N ? 8 EA N N ? 8 FA N N ? 8 GA N N ? 8 HA N N ? 8 IA N N ? 8 JA N N ? 8 KA N N ? 8 LA N N ? 8 MA N N ? 8 NA N N ? 8 OA N N ? 8 PA N N ? 8 QA N N ? 8 RA N N ? 8 SA N N ? 8 TA N N ? 8 UA N N ? 8 VA N N ? 8 WA N N ? 8 XA N N ? 8 YA N N ? 8 ZA N N ? 8 AB N N ? 8 BB N N ? 8 CB N N ? 8 DB N N ? 8 EB N N ? 8 FB N N ? 8 GB N N ? 8 HB N N ? 8 IB N N ? 8 JB N N ? 8 KB N N ? 8 LB N N ? 8 MB N N ? 8 NB N N ? 8 OB N N ? 8 PB N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 7 3 2 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n I NAG 1 G 1 NAG C 518 NAG 5 n I NAG 2 G 2 NAG C 519 NAG 5 n I BMA 3 G 3 BMA C 527 BMA 6 n J NAG 1 I 1 NAG A 515 NAG 6 n J NAG 2 I 2 NAG A 516 NAG 5 n K NAG 1 J 1 NAG A 518 NAG 5 n K NAG 2 J 2 NAG A 519 NAG 5 n K BMA 3 J 3 BMA A 527 BMA 7 n L NAG 1 K 1 NAG E 515 NAG 7 n L NAG 2 K 2 NAG E 516 NAG 7 n L NAG 3 K 3 NAG E 517 NAG 5 n M NAG 1 M 1 NAG E 518 NAG 5 n M NAG 2 M 2 NAG E 519 NAG 5 n M BMA 3 M 3 BMA E 527 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 H CYS 22 1_555 A SG CYS 93 H CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 59 C CYS 54 1_555 C SG CYS 78 C CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 124 C CYS 119 1_555 C SG CYS 201 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 131 C CYS 126 1_555 C SG CYS 192 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 136 C CYS 131 1_555 C SG CYS 153 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 214 C CYS 218 1_555 C SG CYS 243 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 224 C CYS 228 1_555 C SG CYS 235 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 292 C CYS 296 1_555 C SG CYS 326 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 372 C CYS 377 1_555 C SG CYS 438 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 379 C CYS 384 1_555 C SG CYS 411 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 492 C CYS 500 1_555 F SG CYS 152 B CYS 663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 87 D CYS 598 1_555 D SG CYS 93 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf13 D SG CYS 152 D CYS 663 1_555 G SG CYS 492 E CYS 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 59 A CYS 54 1_555 E SG CYS 78 A CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 124 A CYS 119 1_555 E SG CYS 201 A CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 131 A CYS 126 1_555 E SG CYS 192 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 136 A CYS 131 1_555 E SG CYS 153 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 214 A CYS 218 1_555 E SG CYS 243 A CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 224 A CYS 228 1_555 E SG CYS 235 A CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf20 E SG CYS 292 A CYS 296 1_555 E SG CYS 326 A CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 E SG CYS 372 A CYS 377 1_555 E SG CYS 438 A CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf22 E SG CYS 379 A CYS 384 1_555 E SG CYS 411 A CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf23 E SG CYS 492 A CYS 500 1_555 H SG CYS 152 F CYS 663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 87 B CYS 598 1_555 F SG CYS 93 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf25 G SG CYS 59 E CYS 54 1_555 G SG CYS 78 E CYS 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 G SG CYS 124 E CYS 119 1_555 G SG CYS 201 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf27 G SG CYS 131 E CYS 126 1_555 G SG CYS 192 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 136 E CYS 131 1_555 G SG CYS 153 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf29 G SG CYS 214 E CYS 218 1_555 G SG CYS 243 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf30 G SG CYS 224 E CYS 228 1_555 G SG CYS 235 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf31 G SG CYS 292 E CYS 296 1_555 G SG CYS 326 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf32 G SG CYS 372 E CYS 377 1_555 G SG CYS 438 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf33 G SG CYS 379 E CYS 384 1_555 G SG CYS 411 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf34 H SG CYS 87 F CYS 598 1_555 H SG CYS 93 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 C ND2 ASN 93 C ASN 88 1_555 AA C1 NAG . C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale2 C ND2 ASN 135 C ASN 130 1_555 N C1 NAG . C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 138 C ASN 133 1_555 Z C1 NAG . C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 152 C ASN 156 1_555 O C1 NAG . C NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 156 C ASN 160 1_555 P C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale6 C ND2 ASN 193 C ASN 197 1_555 Q C1 NAG . C NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale7 C ND2 ASN 226 C ASN 230 1_555 R C1 NAG . C NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale8 C ND2 ASN 237 C ASN 241 1_555 S C1 NAG . C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 258 C ASN 262 1_555 I C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 285 C ASN 289 1_555 T C1 NAG . C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 327 C ASN 332 1_555 V C1 NAG . C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale ? covale12 C ND2 ASN 334 C ASN 339 1_555 BA C1 NAG . C NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale13 C ND2 ASN 380 C ASN 385 1_555 W C1 NAG . C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.527 ? covale ? covale14 C ND2 ASN 435 C ASN 442 1_555 X C1 NAG . C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale15 C ND2 ASN 441 C ASN 448 1_555 Y C1 NAG . C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 100 D ASN 611 1_555 DA C1 NAG . D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 145 D ASN 656 1_555 CA C1 NAG . D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 93 A ASN 88 1_555 SA C1 NAG . A NAG 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 135 A ASN 130 1_555 EA C1 NAG . A NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 138 A ASN 133 1_555 TA C1 NAG . A NAG 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale21 E ND2 ASN 152 A ASN 156 1_555 FA C1 NAG . A NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.529 ? covale ? covale22 E ND2 ASN 156 A ASN 160 1_555 GA C1 NAG . A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale23 E ND2 ASN 193 A ASN 197 1_555 HA C1 NAG . A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ? covale ? covale24 E ND2 ASN 226 A ASN 230 1_555 IA C1 NAG . A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale25 E ND2 ASN 237 A ASN 241 1_555 J C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale26 E ND2 ASN 258 A ASN 262 1_555 K C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale27 E ND2 ASN 272 A ASN 276 1_555 RA C1 NAG . A NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale28 E ND2 ASN 285 A ASN 289 1_555 JA C1 NAG . A NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale29 E ND2 ASN 297 A ASN 301 1_555 KA C1 NAG . A NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale30 E ND2 ASN 327 A ASN 332 1_555 LA C1 NAG . A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.52 ? covale ? covale31 E ND2 ASN 352 A ASN 357 1_555 PA C1 NAG . A NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale32 E ND2 ASN 380 A ASN 385 1_555 MA C1 NAG . A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale33 E ND2 ASN 386 A ASN 391 1_555 QA C1 NAG . A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.528 ? covale ? covale34 E ND2 ASN 435 A ASN 442 1_555 NA C1 NAG . A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? covale ? covale35 E ND2 ASN 441 A ASN 448 1_555 OA C1 NAG . A NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? covale ? covale36 F ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 UA C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? covale ? covale37 F ND2 ASN 105 B ASN 616 1_555 WA C1 NAG . B NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale38 F ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 VA C1 NAG . B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale39 F ND2 ASN 145 B ASN 656 1_555 XA C1 NAG . B NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale40 G ND2 ASN 93 E ASN 88 1_555 IB C1 NAG . E NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? covale ? covale41 G ND2 ASN 135 E ASN 130 1_555 YA C1 NAG . E NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? covale ? covale42 G ND2 ASN 138 E ASN 133 1_555 JB C1 NAG . E NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.524 ? covale ? covale43 G ND2 ASN 152 E ASN 156 1_555 ZA C1 NAG . E NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale44 G ND2 ASN 156 E ASN 160 1_555 AB C1 NAG . E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale45 G ND2 ASN 193 E ASN 197 1_555 BB C1 NAG . E NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale46 G ND2 ASN 226 E ASN 230 1_555 CB C1 NAG . E NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale47 G ND2 ASN 237 E ASN 241 1_555 L C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ? covale ? covale48 G ND2 ASN 258 E ASN 262 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale49 G ND2 ASN 285 E ASN 289 1_555 DB C1 NAG . E NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale50 G ND2 ASN 297 E ASN 301 1_555 EB C1 NAG . E NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale51 G ND2 ASN 327 E ASN 332 1_555 FB C1 NAG . E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale52 G ND2 ASN 380 E ASN 385 1_555 LB C1 NAG . E NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale ? covale53 G ND2 ASN 386 E ASN 391 1_555 KB C1 NAG . E NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? covale ? covale54 G ND2 ASN 435 E ASN 442 1_555 GB C1 NAG . E NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale55 G ND2 ASN 441 E ASN 448 1_555 HB C1 NAG . E NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale56 H ND2 ASN 100 F ASN 611 1_555 NB C1 NAG . F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.525 ? covale ? covale57 H ND2 ASN 105 F ASN 616 1_555 PB C1 NAG . F NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? covale ? covale58 H ND2 ASN 126 F ASN 637 1_555 MB C1 NAG . F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ? covale ? covale59 H ND2 ASN 145 F ASN 656 1_555 OB C1 NAG . F NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? covale ? covale60 I O4 NAG . G NAG 1 1_555 I C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ? covale ? covale61 I O4 NAG . G NAG 2 1_555 I C1 BMA . G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale ? covale62 J O4 NAG . I NAG 1 1_555 J C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale63 K O4 NAG . J NAG 1 1_555 K C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ? covale ? covale64 K O4 NAG . J NAG 2 1_555 K C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? covale ? covale65 L O4 NAG . K NAG 1 1_555 L C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale66 L O4 NAG . K NAG 2 1_555 L C1 NAG . K NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale ? covale67 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.519 ? covale ? covale68 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 9NHK _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 8 NAG C 1 601 509 NAG NAG . O 8 NAG C 1 602 510 NAG NAG . P 8 NAG C 1 603 511 NAG NAG . Q 8 NAG C 1 604 512 NAG NAG . R 8 NAG C 1 605 513 NAG NAG . S 8 NAG C 1 606 515 NAG NAG . T 8 NAG C 1 607 520 NAG NAG . U 8 NAG C 1 608 521 NAG NAG . V 8 NAG C 1 609 522 NAG NAG . W 8 NAG C 1 610 524 NAG NAG . X 8 NAG C 1 611 525 NAG NAG . Y 8 NAG C 1 612 526 NAG NAG . Z 8 NAG C 1 613 528 NAG NAG . AA 8 NAG C 1 614 529 NAG NAG . BA 8 NAG C 1 615 530 NAG NAG . CA 8 NAG D 1 701 665 NAG NAG . DA 8 NAG D 1 702 666 NAG NAG . EA 8 NAG A 1 601 509 NAG NAG . FA 8 NAG A 1 602 510 NAG NAG . GA 8 NAG A 1 603 511 NAG NAG . HA 8 NAG A 1 604 512 NAG NAG . IA 8 NAG A 1 605 513 NAG NAG . JA 8 NAG A 1 606 520 NAG NAG . KA 8 NAG A 1 607 521 NAG NAG . LA 8 NAG A 1 608 522 NAG NAG . MA 8 NAG A 1 609 524 NAG NAG . NA 8 NAG A 1 610 525 NAG NAG . OA 8 NAG A 1 611 526 NAG NAG . PA 8 NAG A 1 612 529 NAG NAG . QA 8 NAG A 1 613 530 NAG NAG . RA 8 NAG A 1 614 531 NAG NAG . SA 8 NAG A 1 615 532 NAG NAG . TA 8 NAG A 1 616 533 NAG NAG . UA 8 NAG B 1 701 664 NAG NAG . VA 8 NAG B 1 702 665 NAG NAG . WA 8 NAG B 1 703 666 NAG NAG . XA 8 NAG B 1 704 668 NAG NAG . YA 8 NAG E 1 601 509 NAG NAG . ZA 8 NAG E 1 602 510 NAG NAG . AB 8 NAG E 1 603 511 NAG NAG . BB 8 NAG E 1 604 512 NAG NAG . CB 8 NAG E 1 605 513 NAG NAG . DB 8 NAG E 1 606 520 NAG NAG . EB 8 NAG E 1 607 521 NAG NAG . FB 8 NAG E 1 608 522 NAG NAG . GB 8 NAG E 1 609 525 NAG NAG . HB 8 NAG E 1 610 526 NAG NAG . IB 8 NAG E 1 611 528 NAG NAG . JB 8 NAG E 1 612 529 NAG NAG . KB 8 NAG E 1 613 530 NAG NAG . LB 8 NAG E 1 614 531 NAG NAG . MB 8 NAG F 1 701 665 NAG NAG . NB 8 NAG F 1 702 666 NAG NAG . OB 8 NAG F 1 703 667 NAG NAG . PB 8 NAG F 1 704 668 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . MB 8 272.815 243.225 227.119 1 131.4 ? C1 NAG 701 F 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . MB 8 271.992 242.785 228.414 1 136.03 ? C2 NAG 701 F 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . MB 8 272.98 242.73 229.627 1 140.35 ? C3 NAG 701 F 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . MB 8 274.127 241.71 229.317 1 136.7 ? C4 NAG 701 F 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . MB 8 274.876 242.158 228.009 1 136.61 ? C5 NAG 701 F 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . MB 8 275.95 241.163 227.574 1 136.71 ? C6 NAG 701 F 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . MB 8 269.586 243.512 228.619 1 125.03 ? C7 NAG 701 F 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . MB 8 268.936 242.159 228.424 1 111.73 ? C8 NAG 701 F 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . MB 8 270.906 243.786 228.642 1 133.93 ? N2 NAG 701 F 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . MB 8 272.275 242.302 230.803 1 139.48 ? O3 NAG 701 F 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . MB 8 275.026 241.687 230.425 1 140.36 ? O4 NAG 701 F 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . MB 8 273.906 242.262 226.878 1 131.89 ? O5 NAG 701 F 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . MB 8 276.61 241.6 226.391 1 136.38 ? O6 NAG 701 F 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . MB 8 268.853 244.493 228.779 1 128.16 ? O7 NAG 701 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 59 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 337 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #