data_9QLN # _model_server_result.job_id b0xBqy_OcSmhM0ztzsjIKA _model_server_result.datetime_utc '2025-07-01 23:51:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 9qln # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":2004}' # _entry.id 9QLN # _exptl.entry_id 9QLN _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 9QLN _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 9QLN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O MET 424 E MET 373 1_555 C CA CA . E CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 425 E ASP 374 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 425 E ASP 374 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.852 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 425 E ASP 374 1_555 C CA CA . E CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 447 E ASP 396 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 495 E ASP 444 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 495 E ASP 444 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 495 E ASP 444 1_555 C CA CA . E CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc9 A O TRP 496 E TRP 445 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 497 E ASP 446 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 497 E ASP 446 1_555 B CA CA . E CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.072 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 497 E ASP 446 1_555 C CA CA . E CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 503 E ASP 452 1_555 C CA CA . E CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc14 A O LEU 1205 E LEU 1154 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 1206 E ASP 1155 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 1206 E ASP 1155 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 1206 E ASP 1155 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc18 A OD2 ASP 1212 E ASP 1161 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 1268 E ASP 1217 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc20 A OD2 ASP 1268 E ASP 1217 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? metalc ? metalc21 A OD2 ASP 1268 E ASP 1217 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc22 A O ASN 1269 E ASN 1218 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc23 A OD1 ASP 1270 E ASP 1219 1_555 D CA CA . E CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 1270 E ASP 1219 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 1270 E ASP 1219 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc26 A OE1 GLU 1276 E GLU 1225 1_555 E CA CA . E CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc27 A O GLN 1619 E GLN 1568 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc28 A OD1 ASP 1620 E ASP 1569 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc29 A OD2 ASP 1620 E ASP 1569 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc30 A OD1 ASP 1620 E ASP 1569 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc31 A OD2 ASP 1626 E ASP 1575 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc32 A OD1 ASP 1675 E ASP 1624 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc33 A OD2 ASP 1675 E ASP 1624 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc34 A OD2 ASP 1675 E ASP 1624 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc35 A O TYR 1676 E TYR 1625 1_555 F CA CA . E CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc36 A OD1 ASP 1677 E ASP 1626 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc ? metalc37 A OD2 ASP 1677 E ASP 1626 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc38 A OE1 GLU 1683 E GLU 1632 1_555 G CA CA . E CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 9QLN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA E 1 2001 1 CA CA . C 2 CA E 1 2002 2 CA CA . D 2 CA E 1 2003 3 CA CA . E 2 CA E 1 2004 4 CA CA . F 2 CA E 1 2005 6 CA CA . G 2 CA E 1 2006 7 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 152.649 _atom_site.Cartn_y 112.952 _atom_site.Cartn_z 127.183 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 95.77 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 2004 _atom_site.auth_asym_id E _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 31 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 299 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #